150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0081 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0081  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  100 
 
 
193 aa  380  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0628211  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1318  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  39.68 
 
 
344 aa  122  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0617616  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0344  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  38.46 
 
 
185 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2432  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  35.23 
 
 
197 aa  106  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744665  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0261  NADH:ubiquinone oxidoreductase, RnfG subunit-like  32.99 
 
 
201 aa  91.3  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1325  FMN-binding domain protein  34.97 
 
 
181 aa  85.5  4e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000405195  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1093  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.16 
 
 
178 aa  83.6  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.997884  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1959  hypothetical protein  39.69 
 
 
205 aa  80.1  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2404  electron transport complex protein RnfG  32.16 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.59015  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0686  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.17 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.320236  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14330  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  34.91 
 
 
186 aa  77.8  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000378736  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1531  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.77 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00374795  normal  0.943593 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0213  FMN-binding domain-containing protein  32.2 
 
 
218 aa  75.1  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000585453  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0308  FMN-binding domain-containing protein  33.16 
 
 
199 aa  74.3  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0470915  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1157  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.18 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.40861 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.05 
 
 
368 aa  72  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.53 
 
 
580 aa  72  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0978  FMN-binding domain protein  27.27 
 
 
185 aa  71.6  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224949 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1794  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.25 
 
 
222 aa  71.2  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.956584  hitchhiker  0.000880554 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0697  FMN-binding domain protein  28.49 
 
 
201 aa  70.9  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.820437  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1735  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  39.64 
 
 
190 aa  70.9  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0812  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.9 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151893  normal  0.42525 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0496  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.09 
 
 
177 aa  70.9  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00037002  hitchhiker  0.000327646 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0722  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.27 
 
 
224 aa  68.2  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.271576  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2070  electron transport complex protein RnfG  29.5 
 
 
212 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2019  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.69 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0287  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  35.05 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0817829  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1171  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2630  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.79 
 
 
233 aa  63.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2277  electron transport complex protein RnfG  28.16 
 
 
212 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.050891  normal  0.93229 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50940  Electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.94 
 
 
229 aa  63.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0444757  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0520  FMN-binding domain-containing protein  26.84 
 
 
191 aa  63.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.273649 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4549  electron transport complex protein RnfG  28.16 
 
 
208 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2263  electron transport complex protein RnfG  28.16 
 
 
208 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00083065  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2108  electron transport complex protein RnfG  28.16 
 
 
208 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.220327  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1400  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  35.45 
 
 
211 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.50013 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0986  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  35.04 
 
 
181 aa  62.4  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625397  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2357  electron transport complex protein RnfG  38.24 
 
 
207 aa  62  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1489  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.84 
 
 
229 aa  61.2  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2195  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  36.17 
 
 
259 aa  60.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.648995  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1312  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.49 
 
 
181 aa  60.5  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.777604  normal  0.23386 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1834  electron transport complex protein RnfG  27.98 
 
 
215 aa  60.8  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.856968  normal  0.105681 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1783  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  39 
 
 
256 aa  60.1  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1868  electron transport complex protein RnfG  33.33 
 
 
210 aa  60.1  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.803831  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1958  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.89 
 
 
193 aa  59.7  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.537285  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2176  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.32 
 
 
215 aa  59.3  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18900  hypothetical protein  26.34 
 
 
214 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0705821  normal  0.0432187 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1846  electron transport complex protein RnfG  36.19 
 
 
208 aa  59.3  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000030729  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1541  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  35.64 
 
 
205 aa  59.7  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.174651 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1707  electron transport complex protein RnfG  29.57 
 
 
206 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.116117  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2040  electron transport complex protein RnfG  35.29 
 
 
208 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.8254  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2993  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  36.96 
 
 
218 aa  59.3  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01601  electron transport complex protein RnfG  29.57 
 
 
206 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00338935  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0306  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.6 
 
 
215 aa  58.9  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2897  electron transport complex, G subunit  28.24 
 
 
212 aa  58.9  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.432539  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01591  hypothetical protein  29.57 
 
 
206 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00493917  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0934  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.11 
 
 
233 aa  58.9  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2061  electron transport complex protein RnfG  27.84 
 
 
208 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000406522  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1998  electron transport complex protein RnfG  29.57 
 
 
206 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0210205  normal  0.220533 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1382  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.65 
 
 
190 aa  58.9  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000652446  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1636  hypothetical protein  24.88 
 
 
213 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1899  electron transport complex protein RnfG  28.27 
 
 
209 aa  58.5  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00381532  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2249  electron transport complex protein RnfG  27.46 
 
 
209 aa  58.5  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000657737  normal  0.472384 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2011  electron transport complex protein RnfG  27.46 
 
 
209 aa  58.5  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000172244  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02968  electron transport complex protein RnfG  40.66 
 
 
212 aa  58.5  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1553  electron transport complex protein RnfG  26.78 
 
 
206 aa  57.8  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.86084  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1568  electron transport complex protein RnfG  29.57 
 
 
206 aa  57.8  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172689  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2010  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.57 
 
 
206 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00233582  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1839  electron transport complex protein RnfG  29.57 
 
 
206 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00239547  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1820  electron transport complex protein RnfG  29.57 
 
 
206 aa  57.4  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.953623  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1625  electron transport complex protein RnfG  26.23 
 
 
206 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.469993 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1719  electron transport complex protein RnfG  26.78 
 
 
206 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.275661  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2343  electron transport complex protein RnfG  29.57 
 
 
206 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0100314  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2068  electron transport complex protein RnfG  36.67 
 
 
208 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00132342  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1907  electron transport complex protein RnfG  36.67 
 
 
208 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2172  electron transport complex protein RnfG  38.71 
 
 
208 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.179108  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1565  electron transport complex protein RnfG  26.78 
 
 
206 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896563  normal  0.099042 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1887  electron transport complex protein RnfG  26.78 
 
 
206 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.169724  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1867  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  24.35 
 
 
217 aa  56.2  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0651  FMN-binding domain-containing protein  34.02 
 
 
203 aa  56.2  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.330764  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2538  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit C  25.88 
 
 
247 aa  56.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.645341  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2560  electron transport complex protein RnfG  33.33 
 
 
208 aa  56.2  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0486766 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2697  FMN-binding domain-containing protein  26.92 
 
 
304 aa  55.8  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.535417  normal  0.011631 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002945  electron transport complex protein RnfG  38.24 
 
 
210 aa  55.8  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.564885  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0734  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  38.2 
 
 
211 aa  55.5  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.35811  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0534  electron transport complex protein RnfG  36.67 
 
 
209 aa  55.5  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000007202  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2512  electron transport complex protein RnfG  36.67 
 
 
212 aa  55.1  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19230  Electron transport complex, subunit G  28.95 
 
 
208 aa  55.1  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1817  electron transport complex protein RnfG  29.69 
 
 
206 aa  55.1  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0386367  decreased coverage  0.000324023 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3196  RnfA-Nqr electron transport subunit  27.97 
 
 
220 aa  54.7  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.401599  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3196  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.86 
 
 
219 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1063  electron transport complex protein RnfG  25.95 
 
 
207 aa  53.1  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.137113  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1240  FMN-binding domain protein  26.98 
 
 
192 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0678  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.11 
 
 
224 aa  53.5  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0630  FMN-binding domain-containing protein  28.73 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.033917  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0702  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.11 
 
 
224 aa  53.5  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2969  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.33 
 
 
215 aa  53.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3935  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.91 
 
 
219 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00699897  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2820  electron transport complex, G subunit  33.33 
 
 
230 aa  52.4  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12153  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  33.66 
 
 
248 aa  52.4  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>