More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1603 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  100 
 
 
157 aa  323  5e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  63.95 
 
 
150 aa  204  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  63.95 
 
 
150 aa  203  7e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1829  NUDIX hydrolase  65.31 
 
 
150 aa  201  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000906254  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0988  NUDIX hydrolase  71.72 
 
 
150 aa  201  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000252657  hitchhiker  0.00430366 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2015  mutT/nudix family protein  66.67 
 
 
150 aa  193  7e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0857519  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1206  NUDIX hydrolase  60.28 
 
 
154 aa  172  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.483034 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  58.33 
 
 
166 aa  168  3e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2643  NUDIX hydrolase  65.15 
 
 
149 aa  167  7e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  57.04 
 
 
153 aa  166  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5152  NUDIX hydrolase  59.09 
 
 
144 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000414992 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2639  NUDIX hydrolase  57.58 
 
 
148 aa  158  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  59.69 
 
 
140 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1823  NUDIX hydrolase  59.4 
 
 
143 aa  155  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.24885  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1935  NUDIX hydrolase  59.54 
 
 
142 aa  154  4e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3464  NUDIX hydrolase  56.82 
 
 
148 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0519  MutT/nudix family protein  60.77 
 
 
146 aa  153  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  52.86 
 
 
154 aa  149  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1187  NUDIX hydrolase  56.82 
 
 
143 aa  147  7e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  57.94 
 
 
140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  57.14 
 
 
140 aa  144  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0883  NUDIX hydrolase  59.2 
 
 
151 aa  144  6e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  50.68 
 
 
156 aa  140  8e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  56.2 
 
 
130 aa  138  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0529  NUDIX hydrolase  53.85 
 
 
150 aa  134  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.803448  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  50.39 
 
 
171 aa  134  7.000000000000001e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  52.38 
 
 
171 aa  134  7.000000000000001e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  53.17 
 
 
171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0842  NUDIX hydrolase  49.7 
 
 
176 aa  130  6e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0134181 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0750  NUDIX hydrolase  45.89 
 
 
212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  49.61 
 
 
144 aa  125  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  54.92 
 
 
139 aa  125  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1530  NUDIX hydrolase  52.78 
 
 
137 aa  120  6e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.249617  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2047  NUDIX hydrolase  54.62 
 
 
156 aa  120  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  48.46 
 
 
137 aa  120  7e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  44.09 
 
 
135 aa  114  5e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  44.78 
 
 
236 aa  110  9e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32661  predicted protein  42.34 
 
 
237 aa  101  5e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.540856  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  42.74 
 
 
132 aa  100  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  42.31 
 
 
148 aa  89  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 
164 aa  89.7  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  42.75 
 
 
229 aa  89  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 
252 aa  87.4  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  42.2 
 
 
137 aa  85.9  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  38.17 
 
 
240 aa  85.5  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 
252 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  43.61 
 
 
229 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1510  NUDIX hydrolase  39.73 
 
 
157 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  39.22 
 
 
231 aa  80.9  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2888  NUDIX hydrolase  37.98 
 
 
151 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  38.76 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  38.76 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 
237 aa  74.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  37.84 
 
 
232 aa  74.3  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  37.6 
 
 
190 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1798  NUDIX hydrolase  41.09 
 
 
164 aa  72.4  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  41.74 
 
 
226 aa  72.4  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 
184 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  38.28 
 
 
228 aa  71.2  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5226  NUDIX hydrolase  44.94 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916804  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1061  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
179 aa  70.5  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 
273 aa  69.7  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2862  NUDIX hydrolase  38.21 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.200319  hitchhiker  0.00911064 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  37.66 
 
 
286 aa  69.3  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2121  NUDIX hydrolase  38.02 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575199  decreased coverage  0.00514227 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
269 aa  68.9  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 
229 aa  68.9  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 
239 aa  68.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  43.62 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  36.69 
 
 
260 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2686  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1988  NUDIX hydrolase  30.61 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104841 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
160 aa  67.4  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  40.66 
 
 
137 aa  67  0.00000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  43.28 
 
 
158 aa  67  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1851  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  36.36 
 
 
362 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289338 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  34.11 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2899  NUDIX hydrolase  30.41 
 
 
187 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  34.75 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  34.4 
 
 
303 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4287  hydrolase, NUDIX family  29.41 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000426319  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 
141 aa  63.9  0.0000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1914  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.592421  normal  0.977797 
 
 
-
 
NC_002950  PG1735  MutT/nudix family protein  36.22 
 
 
184 aa  63.2  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4229  mutT/nudix family protein  26.98 
 
 
154 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000345145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3901  MutT/Nudix family protein  28.69 
 
 
154 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267829  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1479  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 
135 aa  63.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142432  hitchhiker  0.00620383 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 
163 aa  63.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1303  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 
187 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  43.28 
 
 
158 aa  63.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4267  hydrolase, NUDIX family  28.69 
 
 
154 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.555582  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  37.68 
 
 
251 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2843  NUDIX hydrolase  33.55 
 
 
267 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4178  hydrolase, NUDIX family  27.87 
 
 
154 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0036026 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  34.55 
 
 
159 aa  62.8  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  34.55 
 
 
159 aa  62.8  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2213  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 
200 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.254598 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>