More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0379 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0379  rare lipoprotein A  100 
 
 
156 aa  317  5e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0364782  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0489  rare lipoprotein A  52.46 
 
 
161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0615  rare lipoprotein A  52.29 
 
 
157 aa  115  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.679180000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0601  rare lipoprotein A  58.51 
 
 
154 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000191646  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0688  rare lipoprotein A  54.37 
 
 
141 aa  110  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000610426  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0455  lipoprotein A domain-containing protein  43.84 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3379  rare lipoprotein A  41.13 
 
 
150 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0689  rare lipoprotein A  55.68 
 
 
135 aa  99  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0747  rare lipoprotein A, putative  44.44 
 
 
135 aa  92.4  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0479565  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  45.69 
 
 
124 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  42.75 
 
 
170 aa  89  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  37.25 
 
 
163 aa  87.8  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  48.96 
 
 
165 aa  86.3  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  39.86 
 
 
139 aa  85.1  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2481  rare lipoprotein A  37.59 
 
 
162 aa  85.5  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.383159  normal  0.0948331 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  42.19 
 
 
163 aa  84  7e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  45.22 
 
 
124 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  40.16 
 
 
145 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  45.22 
 
 
124 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  45.22 
 
 
124 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  46.67 
 
 
134 aa  82.8  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  50.55 
 
 
335 aa  81.6  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  45.37 
 
 
249 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  44.35 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  46.67 
 
 
360 aa  81.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  46.67 
 
 
360 aa  81.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2367  rare lipoprotein A  48.91 
 
 
128 aa  80.9  0.000000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  45.19 
 
 
257 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4129  rare lipoprotein A  41.53 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.905636 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  45.63 
 
 
171 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  45.56 
 
 
142 aa  79  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  45.26 
 
 
125 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  43.75 
 
 
122 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  45.26 
 
 
125 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  46.74 
 
 
199 aa  78.2  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  46.32 
 
 
198 aa  77.8  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4056  rare lipoprotein A  46.07 
 
 
108 aa  77.8  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.926393  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  46.81 
 
 
324 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  45.54 
 
 
124 aa  77.4  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  40.94 
 
 
168 aa  77.4  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2221  rare lipoprotein A-like protein  43.62 
 
 
249 aa  77  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219986  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  42.39 
 
 
142 aa  77  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  37.06 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  37.06 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  37.06 
 
 
230 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  37.5 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  37.06 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1351  rare lipoprotein A  40.59 
 
 
162 aa  76.6  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.281508  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  43.33 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  41.3 
 
 
367 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  37.06 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  37.06 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  41.94 
 
 
259 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  38.17 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  43.88 
 
 
119 aa  76.3  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  38.97 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  46.32 
 
 
238 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1056  rare lipoprotein A  41.67 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0387657  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  37.5 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  44.21 
 
 
167 aa  75.9  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  38.24 
 
 
230 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1543  rare lipoprotein A  41.18 
 
 
217 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  41.07 
 
 
114 aa  75.1  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  36.76 
 
 
214 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  37.61 
 
 
339 aa  74.7  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0492  rare lipoprotein A  47.78 
 
 
238 aa  74.3  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3653  rare lipoprotein A  45.36 
 
 
175 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.812873 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  41.49 
 
 
239 aa  73.9  0.0000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  42.39 
 
 
186 aa  73.9  0.0000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  45.16 
 
 
171 aa  73.9  0.0000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  39.13 
 
 
290 aa  73.9  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  47.83 
 
 
121 aa  73.9  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  36.3 
 
 
323 aa  73.6  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  34.35 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0720  rare lipoprotein A  44.68 
 
 
116 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  42.55 
 
 
246 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0531  rare lipoprotein A  40.68 
 
 
370 aa  73.6  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.863608  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  42.71 
 
 
144 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  45.16 
 
 
140 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  48.89 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  42.16 
 
 
285 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  40.86 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  43.33 
 
 
367 aa  72.8  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  40.86 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  40.86 
 
 
266 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  43.48 
 
 
371 aa  72.4  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1475  rare lipoprotein A  50 
 
 
124 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3972  rare lipoprotein A  41.67 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134475  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0045  rare lipoprotein A  43.43 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  44 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  36.36 
 
 
213 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  36.36 
 
 
213 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  36.84 
 
 
127 aa  72  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  44.44 
 
 
273 aa  72  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  38.74 
 
 
286 aa  72  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4774  rare lipoprotein A  38.83 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.480483  hitchhiker  0.000486811 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0709  rare lipoprotein A  50 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  43.16 
 
 
206 aa  71.6  0.000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  47.96 
 
 
227 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  33.83 
 
 
322 aa  71.6  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>