259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3533 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0478  4-alpha-glucanotransferase  53.61 
 
 		 730 aa  709    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3533  4-alpha-glucanotransferase  100 
 
 		 721 aa  1451    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2633  4-alpha-glucanotransferase  50.49 
 
 		 733 aa  649    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.272173 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13220  4-alpha-glucanotransferase  50.49 
 
 		 717 aa  640    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.133916  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2153  4-alpha-glucanotransferase  55.29 
 
 		 717 aa  713    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.362113  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1369  4-alpha-glucanotransferase  51.34 
 
 		 708 aa  652    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.613124  hitchhiker  0.00100057 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24590  4-alpha-glucanotransferase  48.8 
 
 		 718 aa  631  1e-179  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.686427  normal  0.585333 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1101  4-alpha-glucanotransferase  49.3 
 
 		 717 aa  616  1e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00817417  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3421  4-alpha-glucanotransferase  50 
 
 		 708 aa  615  1e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11812  4-alpha-glucanotransferase malQ  51.39 
 
 		 724 aa  608  1e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.268573 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4887  4-alpha-glucanotransferase  48.14 
 
 		 724 aa  605  9.999999999999999e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3529  4-alpha-glucanotransferase  49.93 
 
 		 712 aa  600  1e-170  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00842103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3175  4-alpha-glucanotransferase  47.87 
 
 		 730 aa  593  1e-168  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.682952  normal  0.0349305 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2869  4-alpha-glucanotransferase  48.85 
 
 		 719 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2913  4-alpha-glucanotransferase  48.85 
 
 		 719 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2899  4-alpha-glucanotransferase  48.85 
 
 		 719 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11750  4-alpha-glucanotransferase  46.07 
 
 		 1169 aa  541  9.999999999999999e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1347  4-alpha-glucanotransferase  45.13 
 
 		 717 aa  531  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.451927  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2205  glycoside hydrolase family protein  46.41 
 
 		 702 aa  523  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3414  4-alpha-glucanotransferase  43.2 
 
 		 677 aa  511  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.723218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1692  4-alpha-glucanotransferase  40.78 
 
 		 721 aa  504  1e-141  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1299  4-alpha-glucanotransferase  40.47 
 
 		 749 aa  503  1e-141  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0251  4-alpha-glucanotransferase  40.17 
 
 		 721 aa  499  1e-140  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1601  4-alpha-glucanotransferase  41.23 
 
 		 766 aa  462  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1321  4-alpha-glucanotransferase  38.49 
 
 		 745 aa  464  1e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1157  4-alpha-glucanotransferase  41.8 
 
 		 757 aa  426  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.337105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5309  4-alpha-glucanotransferase  41.55 
 
 		 780 aa  425  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.242878 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5116  4-alpha-glucanotransferase  40.32 
 
 		 692 aa  410  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.796514  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0996  4-alpha-glucanotransferase  39.97 
 
 		 660 aa  412  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3093  4-alpha-glucanotransferase  41.31 
 
 		 610 aa  362  2e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601313  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  32.12 
 
 		 1464 aa  339  9.999999999999999e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04850  4-alpha-glucanotransferase  31.33 
 
 		 726 aa  326  8.000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001104  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  31.33 
 
 		 726 aa  324  3e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1402  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.18 
 
 		 1730 aa  323  5e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.701685  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1174  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  33.57 
 
 		 1715 aa  319  9e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.814781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01251  4-alpha-glucanotransferase  31.43 
 
 		 732 aa  320  9e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2365  4-alpha-glucanotransferase  29.16 
 
 		 732 aa  313  5.999999999999999e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.84762  normal  0.279532 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1984  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.69 
 
 		 1673 aa  313  6.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432862  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2156  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  33.15 
 
 		 1703 aa  313  1e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57322  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0118  4-alpha-glucanotransferase  32.15 
 
 		 726 aa  312  1e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3829  4-alpha-glucanotransferase  32.02 
 
 		 695 aa  312  1e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3927  4-alpha-glucanotransferase  33.12 
 
 		 694 aa  309  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0039  4-alpha-glucanotransferase  30.7 
 
 		 726 aa  308  3e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0890  4-alpha-glucanotransferase  34.41 
 
 		 699 aa  307  3e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.763251  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0162  4-alpha-glucanotransferase  31.42 
 
 		 698 aa  302  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4120  4-alpha-glucanotransferase  33.12 
 
 		 694 aa  303  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3992  4-alpha-glucanotransferase  31.42 
 
 		 698 aa  302  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0315  4-alpha-glucanotransferase  34.96 
 
 		 707 aa  301  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1607  4-alpha-glucanotransferase  34.02 
 
 		 728 aa  301  4e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0233  4-alpha-glucanotransferase  34.02 
 
 		 717 aa  300  5e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3751  4-alpha-glucanotransferase  31.28 
 
 		 698 aa  300  8e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4635  4-alpha-glucanotransferase  33.96 
 
 		 696 aa  298  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3787  4-alpha-glucanotransferase  34 
 
 		 692 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3715  4-alpha-glucanotransferase  34 
 
 		 692 aa  292  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0297  4-alpha-glucanotransferase  30.57 
 
 		 694 aa  291  3e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128437  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3614  4-alpha-glucanotransferase  30.57 
 
 		 694 aa  291  3e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3797  4-alpha-glucanotransferase  30.23 
 
 		 694 aa  291  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0297  4-alpha-glucanotransferase  30.57 
 
 		 694 aa  291  3e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000311021  normal  0.0613825 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3883  4-alpha-glucanotransferase  34 
 
 		 692 aa  291  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3892  4-alpha-glucanotransferase  30.42 
 
 		 694 aa  291  4e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2166  4-alpha-glucanotransferase  32.39 
 
 		 761 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3697  4-alpha-glucanotransferase  30.67 
 
 		 694 aa  290  8e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.451758 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03268  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  30.42 
 
 		 694 aa  289  1e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000118056  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03220  hypothetical protein  30.42 
 
 		 694 aa  289  1e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3821  4-alpha-glucanotransferase  33.83 
 
 		 692 aa  288  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3712  4-alpha-glucanotransferase  33.83 
 
 		 692 aa  288  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1635  4-alpha-glucanotransferase  29.28 
 
 		 731 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4723  4-alpha-glucanotransferase  30.28 
 
 		 694 aa  287  4e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2938  4-alpha-glucanotransferase  33.24 
 
 		 664 aa  284  4.0000000000000003e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2674  4-alpha-glucanotransferase  33.33 
 
 		 607 aa  283  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5566  4-alpha-glucanotransferase  33.63 
 
 		 604 aa  282  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.163065  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2985  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.47 
 
 		 1662 aa  282  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.149144  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1247  4-alpha-glucanotransferase  32.5 
 
 		 745 aa  281  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2866  glycoside hydrolase family protein  31.14 
 
 		 736 aa  281  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.988435 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0986  4-alpha-glucanotransferase  29.24 
 
 		 724 aa  280  6e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0154961 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2994  glycoside hydrolase family protein  30.09 
 
 		 692 aa  279  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.10076  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1493  4-alpha-glucanotransferase  33.79 
 
 		 769 aa  278  3e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3029  4-alpha-glucanotransferase  33.33 
 
 		 808 aa  277  4e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2935  4-alpha-glucanotransferase  33.33 
 
 		 801 aa  277  4e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1330  4-alpha-glucanotransferase  33.33 
 
 		 808 aa  278  4e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1320  4-alpha-glucanotransferase  33.33 
 
 		 808 aa  276  8e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2837  4-alpha-glucanotransferase  33.15 
 
 		 801 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1780  4-alpha-glucanotransferase  34.98 
 
 		 605 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.900692  normal  0.822688 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2759  4-alpha-glucanotransferase  32.66 
 
 		 796 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1356  4-alpha-glucanotransferase  33.15 
 
 		 808 aa  274  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.547791 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2547  4-alpha-glucanotransferase  30.1 
 
 		 692 aa  273  6e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1114  4-alpha-glucanotransferase  35.39 
 
 		 605 aa  270  8.999999999999999e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.587609 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3127  4-alpha-glucanotransferase  31.15 
 
 		 692 aa  269  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6826  4-alpha-glucanotransferase  30.66 
 
 		 736 aa  270  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2451  putative 4-alpha-glucanotransferase  35.5 
 
 		 605 aa  267  5e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1467  4-alpha-glucanotransferase  30.96 
 
 		 646 aa  266  7e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1167  4-alpha-glucanotransferase  30.63 
 
 		 745 aa  266  8e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0817385 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1931  4-alpha-glucanotransferase  31.01 
 
 		 699 aa  266  8e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2279  4-alpha-glucanotransferase  32.47 
 
 		 684 aa  262  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0480824  normal  0.0112086 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7548  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.91 
 
 		 1642 aa  260  8e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838098  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5398  4-alpha-glucanotransferase  34.99 
 
 		 630 aa  259  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.229574  hitchhiker  0.00287392 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4388  4-alpha-glucanotransferase  30.24 
 
 		 726 aa  259  9e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373122 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5595  4-alpha-glucanotransferase  33.61 
 
 		 743 aa  259  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.670849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6809  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.09 
 
 		 1647 aa  254  6e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5486  4-alpha-glucanotransferase  31.01 
 
 		 736 aa  253  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.259622  hitchhiker  0.00166664 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>