72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3986 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3986  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 418 aa  814    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0358  major facilitator transporter  62.56 
 
 		 410 aa  479  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1635  major facilitator transporter  61.82 
 
 		 411 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.402698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0556  major facilitator transporter  54.68 
 
 		 414 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.968297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3709  major facilitator transporter  61.76 
 
 		 408 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.682847  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3849  major facilitator superfamily MFS_1  61.65 
 
 		 407 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3766  major facilitator superfamily MFS_1  61.41 
 
 		 407 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1867  major facilitator transporter  38.96 
 
 		 419 aa  265  1e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09393  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04000)  37.79 
 
 		 468 aa  255  9e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.133031 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5142  major facilitator transporter  38.12 
 
 		 418 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2489  major facilitator transporter  40 
 
 		 399 aa  238  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00111531  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5608  major facilitator transporter  39.23 
 
 		 397 aa  237  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.338314 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2103  major facilitator transporter  40.3 
 
 		 422 aa  236  6e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.941752  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0899  major facilitator transporter  37.31 
 
 		 413 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6018  major facilitator superfamily MFS_1  39.41 
 
 		 420 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46289  predicted protein  34.27 
 
 		 439 aa  229  5e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.862046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5228  major facilitator transporter  38.82 
 
 		 407 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6196  major facilitator transporter  38.25 
 
 		 413 aa  222  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226919 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1249  major facilitator transporter  33.99 
 
 		 366 aa  191  2.9999999999999997e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000314091 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0053  hypothetical protein  36.71 
 
 		 418 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0064  major facilitator transporter  36.71 
 
 		 418 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1208  major facilitator transporter  36.71 
 
 		 418 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1561  light regulation of gametogenesis6 protein  36.71 
 
 		 418 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1491  major facilitator transporter  36.71 
 
 		 418 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0081  major facilitator transporter  37.2 
 
 		 418 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0064  major facilitator transporter  36.71 
 
 		 418 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1531  major facilitator transporter  34.83 
 
 		 405 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1379  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 438 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1067  major facilitator transporter  25.3 
 
 		 396 aa  97.4  4e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2689  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 		 397 aa  93.2  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0230105 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3090  hypothetical protein  26.91 
 
 		 397 aa  93.2  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0722  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 391 aa  92.4  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1609  major facilitator transporter  26.48 
 
 		 410 aa  82  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.655483 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0889  major facilitator superfamily MFS_1  24.3 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0437  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 377 aa  67  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2623  major facilitator superfamily MFS_1  21.7 
 
 		 398 aa  67  0.0000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.600696  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1359  major facilitator transporter  26.81 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0736  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 398 aa  56.6  0.0000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00989309 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  23.14 
 
 		 428 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2910  transport protein  23.16 
 
 		 432 aa  53.9  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464136  decreased coverage  0.0000430598 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  25.07 
 
 		 397 aa  52.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  23.86 
 
 		 407 aa  51.6  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0952  major facilitator superfamily MFS_1  20.6 
 
 		 381 aa  50.4  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000396638  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  24.85 
 
 		 415 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2690  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 401 aa  49.7  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 418 aa  48.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2780  major facilitator superfamily MFS_1  24.31 
 
 		 421 aa  47.4  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 421 aa  47  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  27.17 
 
 		 440 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0769  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 		 412 aa  46.6  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  23.66 
 
 		 388 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  29.27 
 
 		 516 aa  45.8  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3574  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 514 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5489  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 486 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157895 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0418  hypothetical protein  32.28 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4793  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 514 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1618  major facilitator transporter  23.48 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  23.66 
 
 		 388 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0877  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 		 436 aa  45.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.256808  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0313  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 489 aa  45.8  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2346  peptide permease  26.47 
 
 		 404 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0385238  hitchhiker  0.0021515 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5620  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 420 aa  44.3  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.84 
 
 		 461 aa  44.3  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1556  putative transmembrane transport protein  26.39 
 
 		 422 aa  43.9  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.233072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0309  major facilitator transporter  19.38 
 
 		 389 aa  43.9  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0224718  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1030  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 411 aa  43.5  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  24.06 
 
 		 400 aa  43.5  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  24.06 
 
 		 427 aa  43.5  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3435  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 435 aa  43.5  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1507  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 411 aa  43.5  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5071  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 		 485 aa  43.1  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.706796  normal  0.279172 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>