208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2886 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  100 
 
 		 196 aa  396  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  97.09 
 
 		 172 aa  341  5e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  81.14 
 
 		 182 aa  294  6e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  76.51 
 
 		 172 aa  275  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  50.62 
 
 		 237 aa  143  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  44.44 
 
 		 183 aa  135  5e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1277  hypothetical protein  44.81 
 
 		 251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.241962  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  42.68 
 
 		 164 aa  128  6e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  46.79 
 
 		 160 aa  126  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0270  hypothetical protein  39.29 
 
 		 246 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0768014 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0265  hypothetical protein  39.29 
 
 		 246 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.485834  normal  0.889458 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0265  hypothetical protein  39.29 
 
 		 246 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.222677 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0281  hypothetical protein  39.29 
 
 		 246 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.236696 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2841  hypothetical protein  42.04 
 
 		 248 aa  122  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3346  hypothetical protein  42.58 
 
 		 238 aa  122  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00404428  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0284  hypothetical protein  40.51 
 
 		 235 aa  121  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1092  hypothetical protein  43.51 
 
 		 235 aa  121  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3409  hypothetical protein  43.51 
 
 		 235 aa  121  6e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0939148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3503  protein of unknown function UPF0066  41.94 
 
 		 238 aa  120  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0149186  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1039  hypothetical protein  43.51 
 
 		 235 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011739  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  44.3 
 
 		 183 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0874  protein of unknown function UPF0066  44.52 
 
 		 235 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0588086  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0733  hypothetical protein  40.13 
 
 		 235 aa  119  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0409036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3757  hypothetical protein  42.58 
 
 		 235 aa  119  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  normal  0.0834525 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00194  hypothetical protein  40.65 
 
 		 235 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.043388  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00193  hypothetical protein  40.65 
 
 		 235 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0320479  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  42.28 
 
 		 166 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3407  protein of unknown function UPF0066  40.65 
 
 		 235 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000511594  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0199  hypothetical protein  40.65 
 
 		 235 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0201514  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0202  hypothetical protein  40.65 
 
 		 235 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000993842  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0189  hypothetical protein  40.65 
 
 		 235 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0457219  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0207  hypothetical protein  40.65 
 
 		 235 aa  118  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.9755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0206  hypothetical protein  40.65 
 
 		 235 aa  118  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0519396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0843  protein of unknown function UPF0066  42.95 
 
 		 235 aa  118  7e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000863698  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3464  hypothetical protein  40.65 
 
 		 235 aa  118  7e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0230966  normal  0.865335 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  39.22 
 
 		 164 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0222  hypothetical protein  43.04 
 
 		 240 aa  115  3.9999999999999997e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00354115  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  44.08 
 
 		 175 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3241  hypothetical protein  40.65 
 
 		 240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.488613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1164  hypothetical protein  40.79 
 
 		 245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2542  hypothetical protein  40.13 
 
 		 265 aa  112  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00464055  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03251  hypothetical protein  37.97 
 
 		 231 aa  112  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2853  hypothetical protein  42.68 
 
 		 239 aa  112  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00329387  hitchhiker  0.000000086947 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0401  hypothetical protein  36.05 
 
 		 231 aa  112  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000112089  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002726  hypothetical protein  38.04 
 
 		 234 aa  111  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0430932  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0110  protein of unknown function UPF0066  43.14 
 
 		 228 aa  111  7.000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1440  hypothetical protein  39.87 
 
 		 241 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2812  hypothetical protein  45.39 
 
 		 251 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3287  hypothetical protein  41.4 
 
 		 238 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.231288  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1388  hypothetical protein  43.62 
 
 		 230 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.767988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2238  protein of unknown function UPF0066  39.61 
 
 		 233 aa  108  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  41.45 
 
 		 235 aa  108  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2751  hypothetical protein  38.26 
 
 		 262 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235309  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4023  hypothetical protein  42.28 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  41.94 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0891  hypothetical protein  40.26 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.150441  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2686  hypothetical protein  39.49 
 
 		 249 aa  107  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.468068  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2854  hypothetical protein  38.26 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.762122  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2589  hypothetical protein  40.52 
 
 		 245 aa  107  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38460  hypothetical protein  46.15 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2871  hypothetical protein  38.26 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.867889  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  42.22 
 
 		 135 aa  106  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  43.33 
 
 		 241 aa  106  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1742  hypothetical protein  45.89 
 
 		 231 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2516  hypothetical protein  37.91 
 
 		 244 aa  105  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.507921  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1400  hypothetical protein  37.25 
 
 		 244 aa  105  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381665 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20260  hypothetical protein  44.97 
 
 		 231 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.675197 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1347  hypothetical protein  37.25 
 
 		 244 aa  104  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0192591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1412  hypothetical protein  37.25 
 
 		 244 aa  104  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2860  hypothetical protein  38.26 
 
 		 256 aa  104  9e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.486739  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3151  hypothetical protein  36.6 
 
 		 244 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1505  protein of unknown function UPF0066  37.58 
 
 		 244 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.410529  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3000  hypothetical protein  37.58 
 
 		 244 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1705  hypothetical protein  43.06 
 
 		 234 aa  103  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  37.66 
 
 		 294 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  38.41 
 
 		 167 aa  103  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1189  hypothetical protein  42.47 
 
 		 232 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.7243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4020  hypothetical protein  43.15 
 
 		 231 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012325 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  40.62 
 
 		 161 aa  101  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  35.1 
 
 		 151 aa  100  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4227  hypothetical protein  42.47 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940222 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  41.78 
 
 		 162 aa  100  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39681  predicted protein  36.88 
 
 		 336 aa  99.8  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0134522  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1220  hypothetical protein  42.76 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.420343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02964  hypothetical protein  36.25 
 
 		 239 aa  98.6  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  42.76 
 
 		 145 aa  98.6  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  39.04 
 
 		 166 aa  95.9  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  37.16 
 
 		 166 aa  95.9  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  35.33 
 
 		 163 aa  95.1  6e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  35.33 
 
 		 143 aa  94  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2822  heat shock protein DnaJ-like  38.22 
 
 		 233 aa  94  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000736424 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  35.33 
 
 		 143 aa  94  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4260  hypothetical protein  41.5 
 
 		 166 aa  92.4  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905923  normal  0.100966 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  37.27 
 
 		 171 aa  89.4  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2344  protein of unknown function UPF0066  36.08 
 
 		 231 aa  89  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1534  hypothetical protein  33.96 
 
 		 280 aa  89.4  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0746722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  32.03 
 
 		 150 aa  89  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  31.82 
 
 		 181 aa  88.6  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  37.33 
 
 		 161 aa  88.2  7e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  46.91 
 
 		 144 aa  87.8  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>