246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2581 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 289 aa  578  1e-164  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3089  hypothetical protein  52.69 
 
 		 287 aa  299  4e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231673  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0847  polysaccharide ABC transporter, permease  51.24 
 
 		 283 aa  281  7.000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0287089  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2433  ABC-2 type transporter  51.8 
 
 		 287 aa  271  9e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0840786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3894  ABC-2 type transporter  51.07 
 
 		 287 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0406  ABC-2 type transporter  45.27 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1416  ABC transporter, permease protein  45.32 
 
 		 283 aa  249  3e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2027  ABC-2 type transporter  42.21 
 
 		 288 aa  235  8e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514923  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3245  ABC-2 type transporter  41.84 
 
 		 290 aa  234  8e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07235  ABC transporter, permease protein  47.43 
 
 		 253 aa  223  3e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0327  ABC-2 type transporter  42.81 
 
 		 288 aa  219  5e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180441  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  39.19 
 
 		 282 aa  214  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2464  ABC-2 type transporter  43.21 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.114145  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  40.88 
 
 		 282 aa  206  4e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  37.84 
 
 		 298 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  35.99 
 
 		 294 aa  189  5.999999999999999e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  35.25 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  35.25 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  35.77 
 
 		 269 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  34.52 
 
 		 276 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2359  ABC-2 type transporter  35.4 
 
 		 282 aa  176  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  34.48 
 
 		 277 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  36.33 
 
 		 279 aa  175  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2173  ABC-2 type transporter  41.35 
 
 		 281 aa  175  7e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0652138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  35.21 
 
 		 278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  35.25 
 
 		 278 aa  170  3e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4945  ABC-2 type transporter  32.95 
 
 		 279 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1724  ABC-2 type transporter  35.88 
 
 		 274 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  0.0420045 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  37.16 
 
 		 278 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  33.21 
 
 		 295 aa  162  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1504  ABC transporter permease  35.61 
 
 		 283 aa  162  9e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1646  ABC-2 type transporter  34.1 
 
 		 279 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0626  carbohydrate ABC-transporter, permease protein, putative  33.98 
 
 		 275 aa  150  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.580926  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2771  ABC-2 type transporter  37.93 
 
 		 277 aa  149  5e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0349  ABC-2 type transporter  33.59 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  34.23 
 
 		 276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2570  ABC-2 type transporter  31.32 
 
 		 279 aa  143  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0125622  normal  0.492528 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1103  ABC-2 type transporter  31.18 
 
 		 275 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2896  ABC transporter permease  35.25 
 
 		 335 aa  138  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  31.39 
 
 		 274 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2771  ABC-2 type transporter  32.2 
 
 		 277 aa  132  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.588379  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0837  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  33.84 
 
 		 283 aa  132  7.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0813  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  33.84 
 
 		 283 aa  132  7.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  32.58 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  32.69 
 
 		 263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0395  ABC-2 type transporter  32.82 
 
 		 278 aa  129  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  27.39 
 
 		 237 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  33.07 
 
 		 478 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0450  ABC-2 type transporter  25.18 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  35.45 
 
 		 570 aa  123  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  32.83 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  30.57 
 
 		 264 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  29.66 
 
 		 258 aa  119  7.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  33.05 
 
 		 606 aa  118  9e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  32 
 
 		 265 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  30.85 
 
 		 604 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  31.32 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71960  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  31.56 
 
 		 265 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  30.38 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0716  hypothetical protein  31.03 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  28.16 
 
 		 633 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  27.95 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  31.18 
 
 		 283 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  29.81 
 
 		 283 aa  106  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3461  ABC-2 type transporter permease protein  27.38 
 
 		 271 aa  106  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273257  normal  0.0897342 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08840  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  27.99 
 
 		 296 aa  105  9e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.704211 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  25.76 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  26.62 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  32.89 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  29.61 
 
 		 278 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  31.56 
 
 		 273 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2462  ABC transporter, inner membrane subunit  32.17 
 
 		 283 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  29.32 
 
 		 283 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  26.62 
 
 		 261 aa  102  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5890  ABC-2 type transporter  29.21 
 
 		 310 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.706739  normal  0.557903 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4205  ABC-2 type transporter  28.16 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.145294 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  26.16 
 
 		 276 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1748  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 		 316 aa  99.4  5e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1493  ABC-2 type transporter  32.59 
 
 		 283 aa  99.4  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.121302  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0190  ABC-2 type transporter  30.08 
 
 		 253 aa  96.3  6e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1732  hypothetical protein  27.27 
 
 		 263 aa  95.1  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3817  ABC-2 type transporter  25.76 
 
 		 270 aa  94.7  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0117338  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0765  ABC-2 type transporter  28.52 
 
 		 267 aa  94  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1220  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 		 280 aa  93.6  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4049  hypothetical protein  27.82 
 
 		 272 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448399  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2397  hypothetical protein  26.07 
 
 		 273 aa  93.6  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0564424  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4317  ABC-2 type transporter  28.37 
 
 		 282 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  29.39 
 
 		 294 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09070  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  28.09 
 
 		 295 aa  92.8  6e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00126145  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1363  ABC-2 type transporter  27.5 
 
 		 284 aa  92.4  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.521768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0576  ABC-2 type transporter  30.74 
 
 		 268 aa  92.4  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0370  putative ABC-2 type transport system permease protein  29.03 
 
 		 255 aa  92  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3980  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, inner membrane subunit  26.13 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.693027 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1239  ABC-2 type transporter  28.74 
 
 		 272 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3693  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 		 271 aa  91.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3799  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, innermembrane subunit  27.34 
 
 		 276 aa  89  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1227  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  28.42 
 
 		 275 aa  87.8  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5477  ABC-2 type transporter  28.69 
 
 		 285 aa  87.4  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0650  ABC polysaccharide efflux pump, inner membrane subunit  25.38 
 
 		 257 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.414968  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0318  ABC-2 type transporter  26.77 
 
 		 280 aa  86.7  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>