55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2344 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2344  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  329  9e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2678  hypothetical protein  49.07 
 
 		 167 aa  158  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000820261 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1537  hypothetical protein  34.81 
 
 		 161 aa  103  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1805  hypothetical protein  35.67 
 
 		 159 aa  92.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2674  hypothetical protein  28.92 
 
 		 169 aa  91.7  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000300663 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1541  hypothetical protein  29.52 
 
 		 169 aa  87  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0988  hypothetical protein  35.15 
 
 		 171 aa  85.9  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2037  hypothetical protein  31.61 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2154  hypothetical protein  32.26 
 
 		 166 aa  73.9  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  29.92 
 
 		 192 aa  53.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  36.49 
 
 		 172 aa  52  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1093  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.89 
 
 		 178 aa  48.9  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4157  general secretion pathway protein H  38.98 
 
 		 148 aa  48.1  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000758704 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4154  hypothetical protein  37.5 
 
 		 183 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  28.04 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  32 
 
 		 201 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0685  general secretion pathway protein H  33.33 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277162 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  33.85 
 
 		 168 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  38.81 
 
 		 162 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0108  pilin  25.93 
 
 		 165 aa  44.7  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000812987  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0385  putative type IV pilin  35.94 
 
 		 184 aa  44.3  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0767  hypothetical protein  35.37 
 
 		 186 aa  44.3  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130879 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1122  hypothetical protein  31.75 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.711782  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0271  putative pilin protein PilA  31.58 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.148513  normal  0.384028 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3912  hypothetical protein  33.75 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.580591  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  28.46 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  51.43 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0253  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  29.91 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0319  hypothetical protein  30.77 
 
 		 199 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.380813  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  37.8 
 
 		 188 aa  42.4  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  34.04 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  44.9 
 
 		 188 aa  42.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3404  fimbrial biogenesis protein  28.57 
 
 		 199 aa  42.4  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205912 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3040  general secretion pathway protein H  26.58 
 
 		 177 aa  42.4  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.504644  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  32.1 
 
 		 137 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0250  fimbrial subunit  42.11 
 
 		 152 aa  42  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0333044  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1352  general secretion pathway protein H  30.12 
 
 		 177 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  26.39 
 
 		 203 aa  41.6  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0686  hypothetical protein  27.85 
 
 		 192 aa  41.6  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0670  hypothetical protein  36.36 
 
 		 171 aa  41.6  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.177225  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  34.94 
 
 		 131 aa  41.6  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  28.19 
 
 		 162 aa  41.6  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1301  type IV pilus biogenesis protein, putative  29.31 
 
 		 177 aa  41.6  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  38.89 
 
 		 187 aa  41.6  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3217  hypothetical protein  31.68 
 
 		 108 aa  41.2  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000170582 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  36.17 
 
 		 138 aa  41.2  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0713  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  38.89 
 
 		 214 aa  41.2  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0897  hypothetical protein  30.12 
 
 		 162 aa  41.2  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0324  hypothetical protein  25.93 
 
 		 167 aa  40.8  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00212965  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  39.47 
 
 		 142 aa  40.8  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4847  hypothetical protein  31.4 
 
 		 157 aa  40.8  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  34.33 
 
 		 188 aa  40.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  42.22 
 
 		 139 aa  40.4  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0669  hypothetical protein  27.22 
 
 		 192 aa  40.4  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  37.1 
 
 		 170 aa  40.4  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>