More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2866 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  100 
 
 		 234 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  94.87 
 
 		 234 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  84.62 
 
 		 233 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  83.69 
 
 		 233 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  84.98 
 
 		 233 aa  398  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  81.82 
 
 		 233 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  81.39 
 
 		 233 aa  388  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  75.55 
 
 		 233 aa  360  8e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  66.67 
 
 		 231 aa  314  8e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  65.22 
 
 		 232 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1546  ribosomal protein L1  64.89 
 
 		 234 aa  306  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  64.44 
 
 		 231 aa  303  2.0000000000000002e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  66.06 
 
 		 234 aa  301  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  66.06 
 
 		 234 aa  301  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  66.06 
 
 		 234 aa  301  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  64.71 
 
 		 230 aa  301  8.000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  68.44 
 
 		 232 aa  300  1e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  64.55 
 
 		 233 aa  299  3e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  62.67 
 
 		 233 aa  297  1e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  66.81 
 
 		 233 aa  295  4e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  64.07 
 
 		 232 aa  295  5e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0699  ribosomal protein L1  61.33 
 
 		 234 aa  295  5e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0241249  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  64.52 
 
 		 234 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  61.4 
 
 		 233 aa  291  5e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  60.79 
 
 		 231 aa  290  1e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4019  ribosomal protein L1  62.39 
 
 		 235 aa  289  3e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  65.5 
 
 		 233 aa  289  3e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2075  ribosomal protein L1  61.3 
 
 		 234 aa  288  5.0000000000000004e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  59.56 
 
 		 235 aa  288  6e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2993  50S ribosomal protein L1  59.57 
 
 		 235 aa  287  8e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3691  50S ribosomal protein L1  63.11 
 
 		 229 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  60.61 
 
 		 232 aa  284  7e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0199586 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  61.82 
 
 		 230 aa  284  8e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3865  50S ribosomal protein L1  61.04 
 
 		 231 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.100026 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  59.47 
 
 		 230 aa  283  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  59.47 
 
 		 230 aa  283  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0354  50S ribosomal protein L1  61.99 
 
 		 229 aa  282  3.0000000000000004e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000103528  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  62.22 
 
 		 229 aa  281  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2957  50S ribosomal protein L1  60.18 
 
 		 231 aa  281  4.0000000000000003e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0502013 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1820  50S ribosomal protein L1  61.04 
 
 		 231 aa  281  4.0000000000000003e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2564  50S ribosomal protein L1  59.39 
 
 		 232 aa  281  5.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1633  50S ribosomal protein L1  58.7 
 
 		 235 aa  281  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.858056  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1805  50S ribosomal protein L1P  61.67 
 
 		 232 aa  281  9e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.163663 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2278  50S ribosomal protein L1  60.89 
 
 		 229 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0744  50S ribosomal protein L1  61.47 
 
 		 233 aa  280  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00583178 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2784  ribosomal protein L1  58.26 
 
 		 234 aa  279  2e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0008683  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1321  50S ribosomal protein L1  64.06 
 
 		 233 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.18039 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0407  50S ribosomal protein L1  60.44 
 
 		 230 aa  279  3e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.3464e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1344  50S ribosomal protein L1  61.78 
 
 		 231 aa  278  5e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0377064  normal  0.0460128 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  59.28 
 
 		 235 aa  278  6e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  60.61 
 
 		 233 aa  278  6e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0395  50S ribosomal protein L1P  58.01 
 
 		 231 aa  277  1e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.780238  hitchhiker  0.00704539 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  57.33 
 
 		 242 aa  277  1e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3200  50S ribosomal protein L1  59.56 
 
 		 229 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0837  50S ribosomal protein L1P  64.19 
 
 		 229 aa  277  1e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0423664  normal  0.0981496 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0350  50S ribosomal protein L1  65.02 
 
 		 232 aa  276  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.81183  normal  0.731209 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1702  50S ribosomal protein L1  65.02 
 
 		 232 aa  276  2e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.311882  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0336  50S ribosomal protein L1  65.02 
 
 		 232 aa  276  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28407  normal  0.840151 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2545  50S ribosomal protein L1  65.02 
 
 		 232 aa  275  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1419  50S ribosomal protein L1  63.72 
 
 		 233 aa  275  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560035  normal  0.451837 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  59.28 
 
 		 241 aa  275  4e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1955  50S ribosomal protein L1  61.06 
 
 		 230 aa  275  5e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0301  50S ribosomal protein L1  57.38 
 
 		 242 aa  275  6e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000226656  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1475  50S ribosomal protein L1  57.51 
 
 		 237 aa  273  1.0000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0729357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0446  50S ribosomal protein L1  57.64 
 
 		 233 aa  273  2.0000000000000002e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0241504  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2721  50S ribosomal protein L1  61.99 
 
 		 231 aa  272  3e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127574  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0480  50S ribosomal protein L1  56.52 
 
 		 233 aa  272  3e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.841279  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  59.29 
 
 		 235 aa  271  5.000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0465  50S ribosomal protein L1  57.39 
 
 		 233 aa  271  6e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00222885  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  57.94 
 
 		 235 aa  270  2e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0309  50S ribosomal protein L1  57.21 
 
 		 253 aa  270  2e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000338213  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5086  50S ribosomal protein L1  61.5 
 
 		 230 aa  268  4e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00155922  normal  0.872957 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  53.78 
 
 		 230 aa  268  4e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0265  50S ribosomal protein L1  54.74 
 
 		 232 aa  268  5e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.516489  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0256  50S ribosomal protein L1  54.74 
 
 		 232 aa  268  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0257763  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  56.44 
 
 		 229 aa  268  5e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0261  50S ribosomal protein L1  59.73 
 
 		 232 aa  268  5.9999999999999995e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0856  50S ribosomal protein L1  62.9 
 
 		 230 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000185888  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0092  50S ribosomal protein L1  61.67 
 
 		 230 aa  268  8e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000171982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5208  50S ribosomal protein L1  62.11 
 
 		 230 aa  267  8e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140164  unclonable  7.070390000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0316  50S ribosomal protein L1  59.36 
 
 		 229 aa  267  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000103871  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2725  50S ribosomal protein L1  63.56 
 
 		 229 aa  267  1e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000462552  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2411  50S ribosomal protein L1  63.56 
 
 		 229 aa  267  1e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000512351  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3757  50S ribosomal protein L1  54.74 
 
 		 232 aa  266  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0092623  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1822  ribosomal protein L1  55.17 
 
 		 242 aa  266  2e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2644  50S ribosomal protein L1  54.74 
 
 		 232 aa  266  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0687921  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3789  50S ribosomal protein L1  54.74 
 
 		 232 aa  266  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.042669  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3452  50S ribosomal protein L1  55.56 
 
 		 232 aa  266  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00102084  normal  0.0363138 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1452  50S ribosomal protein L1  57.83 
 
 		 235 aa  266  2e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3079  50S ribosomal protein L1  54.74 
 
 		 232 aa  266  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.22613  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1911  50S ribosomal protein L1  54.74 
 
 		 232 aa  266  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299291  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3466  50S ribosomal protein L1  54.74 
 
 		 232 aa  266  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0147067  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3819  50S ribosomal protein L1  54.74 
 
 		 232 aa  266  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3181  50S ribosomal protein L1  54.74 
 
 		 232 aa  266  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000145836  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3436  50S ribosomal protein L1  56 
 
 		 232 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3361  50S ribosomal protein L1  60 
 
 		 232 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.235181  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0316  50S ribosomal protein L1  54.31 
 
 		 232 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.225661 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2770  50S ribosomal protein L1  54.31 
 
 		 232 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0337  50S ribosomal protein L1  54.31 
 
 		 232 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29393  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0365  50S ribosomal protein L1  59.31 
 
 		 235 aa  264  7e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.716572  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>