More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0110 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 		 180 aa  356  8e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  86.67 
 
 		 180 aa  317  6e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  65.56 
 
 		 180 aa  245  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  63.33 
 
 		 180 aa  238  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  62.78 
 
 		 180 aa  236  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  51.67 
 
 		 180 aa  194  4.0000000000000005e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0603  F0F1 ATP synthase subunit delta  45.56 
 
 		 180 aa  157  8e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1504  F0F1 ATP synthase subunit delta  45.56 
 
 		 180 aa  157  8e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.164611  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  40.68 
 
 		 179 aa  136  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.56 
 
 		 183 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.22 
 
 		 179 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.36 
 
 		 183 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.88 
 
 		 184 aa  122  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.98 
 
 		 178 aa  122  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.62 
 
 		 183 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.31 
 
 		 179 aa  118  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.71 
 
 		 182 aa  117  7e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.31 
 
 		 179 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.87 
 
 		 193 aa  114  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  35.63 
 
 		 190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.85 
 
 		 181 aa  111  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2585  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.86 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2828  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.16 
 
 		 183 aa  108  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.86 
 
 		 178 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.29 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.71 
 
 		 186 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6638  ATP synthase F1, delta subunit  37.28 
 
 		 190 aa  107  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  34.27 
 
 		 201 aa  107  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  35.09 
 
 		 188 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.71 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  35.12 
 
 		 192 aa  105  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.51 
 
 		 179 aa  104  8e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.48 
 
 		 186 aa  104  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  33.33 
 
 		 194 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.58 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.39 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.86 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2185  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.71 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2760  ATP synthase F1, delta subunit  37.29 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.58 
 
 		 188 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  33.14 
 
 		 176 aa  101  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.14 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  30.56 
 
 		 182 aa  100  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.9 
 
 		 181 aa  99.8  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.53 
 
 		 184 aa  99.8  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.48 
 
 		 180 aa  99.8  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.52 
 
 		 193 aa  99.8  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.64 
 
 		 182 aa  98.2  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.29 
 
 		 186 aa  97.8  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.91 
 
 		 185 aa  97.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.91 
 
 		 185 aa  97.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3213  ATP synthase F1, delta subunit  33.53 
 
 		 179 aa  96.7  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 		 179 aa  97.4  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3337  ATP synthase F1 delta subunit  35.06 
 
 		 184 aa  97.1  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.631562  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  33.72 
 
 		 179 aa  95.9  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0335  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.79 
 
 		 180 aa  96.3  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.584491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.52 
 
 		 180 aa  96.7  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.6 
 
 		 180 aa  96.3  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7383  ATP synthase F1, delta subunit  33.73 
 
 		 190 aa  95.5  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.705381  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1468  ATP synthase F1, delta subunit  34.32 
 
 		 189 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.7 
 
 		 180 aa  95.5  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3308  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.69 
 
 		 178 aa  95.1  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3461  ATP synthase F1, delta subunit  29.78 
 
 		 179 aa  95.1  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.330748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2488  F0F1 ATP synthase subunit delta  36 
 
 		 181 aa  94  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000402457  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1469  ATP synthase F1, delta subunit  32.54 
 
 		 179 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 		 180 aa  92.8  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.14 
 
 		 183 aa  93.2  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  30.56 
 
 		 178 aa  92  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.57 
 
 		 182 aa  92  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5022  ATP synthase F1, delta subunit  33.91 
 
 		 178 aa  91.7  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5430  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.04 
 
 		 180 aa  91.3  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5433  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.04 
 
 		 180 aa  91.3  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1232  ATP synthase F1, delta subunit  32.54 
 
 		 186 aa  91.3  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5486  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.04 
 
 		 180 aa  91.3  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.151912  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.32 
 
 		 186 aa  90.9  8e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  34.36 
 
 		 188 aa  90.9  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.4 
 
 		 180 aa  90.5  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5521  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.04 
 
 		 180 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000263908  hitchhiker  0.00000000000000110124 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3287  ATP synthase F1, delta subunit  32.95 
 
 		 178 aa  90.5  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.19524  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.89 
 
 		 182 aa  90.5  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_002936  DET0561  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.2 
 
 		 180 aa  90.1  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.132233  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5399  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.6 
 
 		 180 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.135919999999999e-51 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5158  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.6 
 
 		 180 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4991  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.6 
 
 		 180 aa  89.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5008  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.6 
 
 		 180 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0946  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.1 
 
 		 179 aa  90.1  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_500  ATP synthase F1, delta subunit  32.2 
 
 		 180 aa  90.1  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0258764  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5550  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.6 
 
 		 180 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0201793  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  32 
 
 		 178 aa  89.7  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  30.9 
 
 		 217 aa  90.1  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1747  ATP synthase F1, delta subunit  31.95 
 
 		 189 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.409884  normal  0.151346 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0369  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.62 
 
 		 180 aa  89  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.398312 
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.68 
 
 		 186 aa  88.6  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1545  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.99 
 
 		 180 aa  88.6  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.68 
 
 		 186 aa  88.6  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16311  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.4 
 
 		 180 aa  88.2  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2847  ATP synthase F1, delta subunit  29.38 
 
 		 179 aa  87.8  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.187337 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.46 
 
 		 181 aa  87.4  9e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2937  ATP synthase delta chain  30.34 
 
 		 186 aa  87.4  9e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213023  normal  0.0695694 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1241  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.21 
 
 		 182 aa  87.4  9e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>