More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0395 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0395  histidine kinase  100 
 
 		 492 aa  1010    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.268294 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.78 
 
 		 492 aa  560  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.31 
 
 		 491 aa  457  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303105  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2752  histidine kinase  50.22 
 
 		 460 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2844  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 550 aa  253  6e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1259  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 		 505 aa  243  6e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000141182 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3250  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 488 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4191  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 		 476 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000558631  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0096  histidine kinase  26.47 
 
 		 525 aa  144  3e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 		 473 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0888  histidine kinase  29 
 
 		 647 aa  141  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  31.75 
 
 		 516 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2603  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 570 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0962  sensor histidine kinase  35.02 
 
 		 655 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3902  histidine kinase  27.64 
 
 		 468 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116044 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2693  histidine kinase  30.87 
 
 		 656 aa  134  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23882e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 		 656 aa  134  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2428  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  24.4 
 
 		 656 aa  133  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00399652  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 		 510 aa  132  9e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2216  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 475 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.263831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 655 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7222  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 		 589 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.368099  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 594 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5981  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 602 aa  131  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2000  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 		 515 aa  131  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5574  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 611 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 611 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3826  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 		 492 aa  130  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.873199  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  31.75 
 
 		 674 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 		 581 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0671901  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6440  histidine kinase  32.08 
 
 		 611 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1897  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 488 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03495  Signal transduction histidine kinase  25.06 
 
 		 557 aa  129  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0071  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 		 480 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3342  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 		 581 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3487  histidine kinase  32.95 
 
 		 581 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0451928  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1443  sensor histidine kinase/response regulator  25.91 
 
 		 654 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.676986  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0039  histidine kinase  33.21 
 
 		 655 aa  127  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  31.22 
 
 		 673 aa  126  9e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0965  sensor histidine kinase  35.47 
 
 		 982 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3017  sensor histidine kinase  32.97 
 
 		 524 aa  125  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413812  normal  0.591209 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2369  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 1146 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5442  two-component sensor CbrA  35.65 
 
 		 983 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0832  PAS  35.47 
 
 		 984 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253594 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3157  histidine kinase  28.08 
 
 		 484 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01018  histidine kinase  32.88 
 
 		 408 aa  125  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06148  histidine kinase  32.88 
 
 		 408 aa  125  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00011043  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 494 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62530  two-component sensor CbrA  35.65 
 
 		 983 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.84 
 
 		 491 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2069  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 653 aa  124  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3818  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 		 468 aa  124  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.634058  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2667  histidine kinase  32.37 
 
 		 486 aa  124  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 372 aa  124  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0738  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 991 aa  124  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000340339 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 		 630 aa  124  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.449456  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4694  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 991 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000630671 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 488 aa  124  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4258  histidine kinase  30.69 
 
 		 506 aa  124  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0620  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 		 518 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 		 970 aa  123  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.984464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 496 aa  123  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.739503  normal  0.406153 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1243  histidine kinase  25 
 
 		 654 aa  123  8e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0706231 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 		 566 aa  123  8e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4695  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 991 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000969954 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 991 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310149  hitchhiker  0.0000734254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4807  two-component sensor kinase CbrA  36.11 
 
 		 982 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111257 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2312  Signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 389 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  27.45 
 
 		 517 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0619  histidine kinase  29.64 
 
 		 313 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2042  sensor histidine kinase  29.41 
 
 		 524 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1291  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 690 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2945  sensor histidine kinase/response regulator  29.37 
 
 		 505 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1911  histidine kinase  30.93 
 
 		 406 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.267492 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 		 1519 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0865128  normal  0.147126 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3588  two-component sensor kinase CbrA  34.06 
 
 		 984 aa  121  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.883039 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4555  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 		 467 aa  121  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.85 
 
 		 541 aa  121  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0750  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 		 390 aa  121  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5455  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 		 571 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0104043  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.83 
 
 		 483 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1660  sensory box sensor histidine kinase  32.21 
 
 		 358 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1718  sensor histidine kinase  32.21 
 
 		 389 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0709  sensory box sensor histidine kinase  32.21 
 
 		 358 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3423  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.79 
 
 		 564 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0561308  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4376  histidine kinase  28.02 
 
 		 667 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314442  normal  0.0171304 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2229  sensor histidine kinase  32.21 
 
 		 389 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0601  sensor histidine kinase  32.21 
 
 		 389 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1925  sensor histidine kinase  32.21 
 
 		 389 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574394  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.33 
 
 		 466 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120654 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1168  sensor histidine kinase  30.34 
 
 		 685 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.527437 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1578  histidine kinase  32.34 
 
 		 829 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0373  sensor histidine kinase  27.5 
 
 		 500 aa  120  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2584  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 654 aa  120  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2742  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 467 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1796  histidine kinase  31.08 
 
 		 584 aa  120  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2683  histidine kinase  28.46 
 
 		 490 aa  119  9e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000711589 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.25 
 
 		 522 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00328327  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  33.94 
 
 		 912 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>