61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5849 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5849  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 316 aa  610  1e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.273522 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0755  RDD  63.52 
 
 		 340 aa  351  1e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.581888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1614  RDD domain-containing protein  45.08 
 
 		 323 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1397  membrane protein/domain-like protein  46.96 
 
 		 343 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.309206 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4952  RDD domain-containing protein  44.13 
 
 		 262 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5231  RDD domain-containing protein  44.13 
 
 		 262 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435963  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4863  RDD domain-containing protein  44.13 
 
 		 262 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.964955  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13726  hypothetical protein  43.51 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0402342  normal  0.595615 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4051  RDD domain containing protein  44.34 
 
 		 288 aa  158  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3834  RDD domain containing protein  41.3 
 
 		 272 aa  155  7e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7601  RDD domain containing protein  43.2 
 
 		 327 aa  155  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5459  RDD domain-containing protein  40.57 
 
 		 293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1333  RDD domain-containing protein  40.98 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.391018 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1201  RDD domain-containing protein  38.89 
 
 		 269 aa  139  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2522  RDD domain containing protein  36.98 
 
 		 272 aa  136  6.0000000000000005e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11329  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3753  RDD domain containing protein  38.06 
 
 		 285 aa  132  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3913  RDD domain-containing protein  40.67 
 
 		 269 aa  132  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0538103  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20730  predicted membrane protein/domain  36.08 
 
 		 286 aa  130  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00769566  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1836  RDD domain containing protein  35.69 
 
 		 268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2339  RDD domain containing protein  40.08 
 
 		 282 aa  125  7e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0325969  hitchhiker  0.0000235215 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2503  hypothetical protein  38.14 
 
 		 264 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09260  predicted membrane protein/domain protein  36.63 
 
 		 272 aa  117  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.144214 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4825  RDD domain containing protein  41.08 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1271  RDD domain containing protein  35.71 
 
 		 266 aa  108  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000317829 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3316  RDD domain-containing protein  41.21 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  28.85 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4317  hypothetical protein  39.08 
 
 		 235 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4021  RDD  36.21 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897049  normal  0.0584976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4958  RDD domain containing protein  28.03 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000303152 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3843  RDD domain containing protein  37.09 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38330  hypothetical protein  35.98 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  30.37 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3574  RDD domain containing protein  32 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.737424  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  27.95 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0824  RDD domain containing protein  31.25 
 
 		 590 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0333571  normal  0.0552944 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56100  hypothetical protein  32.39 
 
 		 265 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2132  hypothetical protein  32.45 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09288  putative transmembrane protein  31.37 
 
 		 237 aa  62.4  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.875246  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0232  RDD domain containing protein  31.71 
 
 		 247 aa  62.4  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1596  RDD domain-containing protein  31.1 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0409  RDD  34.29 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4887  hypothetical protein  32.38 
 
 		 223 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437888  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4439  RDD  39.6 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  37.16 
 
 		 150 aa  57  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1682  RDD domain containing protein  30.07 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1701  RDD domain containing protein  30.82 
 
 		 162 aa  51.2  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000482282  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3744  RDD domain containing protein  28.12 
 
 		 279 aa  51.2  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1157  RDD domain-containing protein  42.22 
 
 		 175 aa  50.4  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  26.74 
 
 		 257 aa  49.7  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  32.93 
 
 		 159 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4626  RDD domain containing protein  30.72 
 
 		 247 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.624916  normal  0.497258 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0015  RDD domain-containing protein  41.89 
 
 		 80 aa  48.5  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3579  RDD domain containing protein  29.41 
 
 		 265 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000310569 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2233  RDD domain-containing protein  29.45 
 
 		 247 aa  47.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00562558  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0726  RDD domain containing protein  35.21 
 
 		 156 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3591  hypothetical protein  25.58 
 
 		 133 aa  45.8  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157612  normal  0.0949488 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2675  RDD domain-containing protein  30.22 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  30.77 
 
 		 270 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21570  predicted membrane protein/domain  38.24 
 
 		 668 aa  45.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.497077  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  27.5 
 
 		 211 aa  43.1  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1078  RDD domain-containing protein  25.81 
 
 		 191 aa  42.7  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.30777  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>