More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3822 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3822  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 578 aa  1155    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  35.8 
 
 		 587 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  36.79 
 
 		 606 aa  302  1e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  35.94 
 
 		 610 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  33.85 
 
 		 589 aa  283  9e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  33.39 
 
 		 593 aa  273  7e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5384  Rhs element Vgr protein  33.5 
 
 		 602 aa  257  5e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  29.65 
 
 		 592 aa  251  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2945  Rhs element Vgr protein  31.9 
 
 		 589 aa  241  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703955  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  26.37 
 
 		 641 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4390  Rhs element Vgr protein  26.93 
 
 		 652 aa  185  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.86257  normal  0.698434 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26590  hypothetical protein  28.9 
 
 		 599 aa  153  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0848935  normal  0.672502 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1051  Rhs element Vgr protein  27.26 
 
 		 594 aa  152  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5250  Rhs element Vgr protein  26.38 
 
 		 596 aa  140  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012293 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0983  hypothetical protein  37.84 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208742  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0369  Rhs element Vgr protein  26.36 
 
 		 596 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  25.81 
 
 		 589 aa  126  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0676  Rhs element Vgr protein  25.34 
 
 		 596 aa  126  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  25.76 
 
 		 589 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3609  Rhs element Vgr protein  25.85 
 
 		 574 aa  117  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3155  Rhs element Vgr protein  21.49 
 
 		 581 aa  115  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2462  hypothetical protein  25.5 
 
 		 595 aa  115  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3003  Rhs element Vgr protein  24.24 
 
 		 598 aa  114  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0660  hypothetical protein  23.73 
 
 		 605 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.279373 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0769  Rhs element Vgr protein  30.9 
 
 		 248 aa  111  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1564  hypothetical protein  26.04 
 
 		 504 aa  110  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21515 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1042  phosphoserine phosphatase SerB  25.84 
 
 		 565 aa  110  9.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3927  Rhs element Vgr protein  24.02 
 
 		 604 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00332693  hitchhiker  0.00450013 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1509  Rhs element Vgr protein  31.31 
 
 		 239 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1953  Rhs element Vgr protein  38 
 
 		 275 aa  103  8e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6416  Rhs element Vgr protein  23.45 
 
 		 617 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3260  Rhs element Vgr protein  25.71 
 
 		 602 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386521  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3666  Rhs element Vgr protein  31.72 
 
 		 226 aa  100  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408922  decreased coverage  0.0000749166 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3684  Rhs element Vgr protein  32.24 
 
 		 247 aa  98.6  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.149401  hitchhiker  0.000521794 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0669  Rhs element Vgr protein  22.24 
 
 		 576 aa  97.8  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0982  hypothetical protein  27.27 
 
 		 362 aa  96.7  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3931  Rhs element Vgr protein  25.24 
 
 		 616 aa  94  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.410968  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2892  hypothetical protein  26.72 
 
 		 499 aa  91.3  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1080  hypothetical protein  22.36 
 
 		 599 aa  90.5  8e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.752206 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3664  hypothetical protein  25.22 
 
 		 360 aa  89.7  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000879822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5894  Rhs element Vgr protein  31.16 
 
 		 615 aa  88.6  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3043  Rhs element Vgr protein  35.67 
 
 		 229 aa  86.3  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160638 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4015  Rhs element Vgr protein  29.52 
 
 		 602 aa  83.2  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.211679  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1508  phage protein D  24.93 
 
 		 348 aa  83.6  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2555  hypothetical protein  27.75 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000216389 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02036  Rhs element Vgr protein  29.14 
 
 		 587 aa  77.4  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.372394  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1796  Rhs element Vgr protein  23.12 
 
 		 619 aa  75.5  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0896  Rhs element Vgr protein  20.2 
 
 		 545 aa  75.1  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.79786 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1040  Rhs element Vgr protein  20.2 
 
 		 545 aa  75.1  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.605907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3589  Rhs element Vgr protein  28.57 
 
 		 612 aa  73.6  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.512863 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4864  Rhs element Vgr protein  21.99 
 
 		 599 aa  71.6  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0846936  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3665  Rhs element Vgr protein  35 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  hitchhiker  0.000248141 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02038  Rhs element Vgr protein  29.58 
 
 		 477 aa  71.2  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.307189  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5985  type VI secretion system Vgr family protein  24 
 
 		 641 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4257  type VI secretion system Vgr family protein  24.28 
 
 		 610 aa  68.6  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5436  Rhs element Vgr protein  27.97 
 
 		 680 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2044  Rhs element Vgr protein  27.59 
 
 		 680 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.909849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04253  Rhs element Vgr protein  27.99 
 
 		 612 aa  67.8  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3177  Rhs family protein  28.12 
 
 		 697 aa  67.4  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_36  VgrG protein, VgrG-2  23.87 
 
 		 754 aa  67.4  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1868  hypothetical protein  24.87 
 
 		 216 aa  66.2  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1212  Rhs element Vgr protein  26.41 
 
 		 699 aa  65.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01965  hypothetical protein  29.53 
 
 		 771 aa  66.2  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000029  hypothetical protein  25.78 
 
 		 611 aa  66.2  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  25.64 
 
 		 668 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  25.64 
 
 		 668 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1155  type VI secretion system Vgr family protein  24.39 
 
 		 706 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0542625  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3077  type VI secretion system Vgr family protein  30.5 
 
 		 633 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4109  Rhs element Vgr protein  20.38 
 
 		 576 aa  65.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0273732 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0649  type VI secretion system Vgr family protein  30.5 
 
 		 633 aa  65.1  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0764  type VI secretion system Vgr family protein  28.57 
 
 		 741 aa  64.7  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0696  putative VgrG protein  28.57 
 
 		 741 aa  64.7  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0616  type VI secretion system Vgr family protein  30.5 
 
 		 633 aa  64.7  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0499415  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  24.88 
 
 		 669 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0115  vgrG protein  23.92 
 
 		 694 aa  64.3  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3254  type VI secretion system Vgr family protein  30.51 
 
 		 787 aa  64.7  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  28.57 
 
 		 838 aa  64.7  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0587  type VI secretion system Vgr family protein  30.5 
 
 		 633 aa  64.3  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  27.14 
 
 		 683 aa  64.3  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1183  Rhs element Vgr protein  27.32 
 
 		 694 aa  64.3  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2565  Rhs element Vgr protein  22.31 
 
 		 687 aa  64.3  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125293  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2572  Rhs element Vgr protein  22.31 
 
 		 687 aa  64.3  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0544876  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2579  Rhs element Vgr protein  22.31 
 
 		 687 aa  64.3  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0472026  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  26.05 
 
 		 968 aa  63.9  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  25 
 
 		 668 aa  63.9  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1194  Rhs element Vgr protein  27.8 
 
 		 655 aa  63.9  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2151  Rhs element Vgr protein  24.11 
 
 		 706 aa  63.9  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  28.65 
 
 		 841 aa  63.9  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  28.65 
 
 		 841 aa  63.9  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3220  Rhs element Vgr protein  22.81 
 
 		 618 aa  63.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3015  Rhs element Vgr protein  30.25 
 
 		 645 aa  63.2  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  33.06 
 
 		 683 aa  63.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2188  type VI secretion system Vgr family protein  24.64 
 
 		 656 aa  63.5  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.33539  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0838  Rhs element Vgr protein  29.29 
 
 		 697 aa  63.2  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  24.07 
 
 		 709 aa  62.4  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  27.1 
 
 		 714 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0650  Rhs element Vgr protein  28.64 
 
 		 727 aa  62.4  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0732792  normal  0.0253872 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69550  hypothetical protein  27.01 
 
 		 680 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256731  normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  27.98 
 
 		 841 aa  62.8  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2513  type VI secretion system Vgr family protein  31.31 
 
 		 682 aa  61.6  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>