More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3056 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3056  tricarballylate dehydrogenase  100 
 
 		 482 aa  983    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2834  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  63.71 
 
 		 488 aa  607  9.999999999999999e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3133  tricarballylate dehydrogenase  54.3 
 
 		 524 aa  455  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262589  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06133  conserved hypothetical protein  43.33 
 
 		 530 aa  392  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1064  tricarballylate dehydrogenase  44.17 
 
 		 505 aa  380  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6400  tricarballylate dehydrogenase  46.57 
 
 		 502 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2808  tricarballylate dehydrogenase  45.64 
 
 		 503 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5093  tricarballylate dehydrogenase  46.01 
 
 		 498 aa  361  2e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496959 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02608  conserved hypothetical protein  35.87 
 
 		 508 aa  299  6e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.262389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0283  tricarballylate dehydrogenase  38.62 
 
 		 493 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8556  tricarballylate dehydrogenase  35.77 
 
 		 462 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.819008  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6301  tricarballylate dehydrogenase  35.39 
 
 		 468 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2722  tricarballylate dehydrogenase  33.67 
 
 		 468 aa  237  3e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0639  tricarballylate dehydrogenase  33.95 
 
 		 479 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0738  tricarballylate dehydrogenase  33.88 
 
 		 467 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0182155  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0811  tricarballylate dehydrogenase  33.88 
 
 		 467 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.329314  normal  0.994664 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0847  tricarballylate dehydrogenase  33.88 
 
 		 467 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.530072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0798  tricarballylate dehydrogenase  33.88 
 
 		 467 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2274  tricarballylate dehydrogenase  34.64 
 
 		 465 aa  232  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579032  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0750  tricarballylate dehydrogenase  33.68 
 
 		 467 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0900786  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3133  tricarballylate dehydrogenase  34.36 
 
 		 476 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.615879  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5148  tricarballylate dehydrogenase  34.45 
 
 		 469 aa  229  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.226548  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6017  tricarballylate dehydrogenase  33.33 
 
 		 469 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.652214 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4070  tricarballylate dehydrogenase  33.67 
 
 		 479 aa  226  7e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3815  tricarballylate dehydrogenase  32.92 
 
 		 469 aa  224  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.990462 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5626  tricarballylate dehydrogenase  33.33 
 
 		 469 aa  221  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0794  tricarballylate dehydrogenase  33.88 
 
 		 474 aa  220  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2502  tricarballylate dehydrogenase  33.88 
 
 		 472 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.927489  normal  0.370831 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2086  tricarballylate dehydrogenase  33.81 
 
 		 471 aa  219  7.999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32911  normal  0.0400814 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4210  tricarballylate dehydrogenase  32.3 
 
 		 477 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3415  tricarballylate dehydrogenase  32.86 
 
 		 479 aa  216  8e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6134  tricarballylate dehydrogenase  32.86 
 
 		 469 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3858  tricarballylate dehydrogenase  32.86 
 
 		 474 aa  212  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000815395 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5878  tricarballylate dehydrogenase  32.45 
 
 		 469 aa  211  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4211  tricarballylate dehydrogenase  33.68 
 
 		 470 aa  210  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3488  tricarballylate dehydrogenase  32.45 
 
 		 486 aa  209  7e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1893  tricarballylate dehydrogenase  32.85 
 
 		 457 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.291034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1003  putative succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  31.5 
 
 		 485 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.415422  normal  0.433093 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0200  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  31.99 
 
 		 488 aa  155  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2986  tricarballylate dehydrogenase  30.71 
 
 		 477 aa  145  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0071938  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2323  tricarballylate dehydrogenase  29.29 
 
 		 432 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  29.1 
 
 		 597 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2383  tricarballylate dehydrogenase  28.69 
 
 		 434 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.401613  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  27.91 
 
 		 588 aa  125  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  27.82 
 
 		 589 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  26.9 
 
 		 502 aa  116  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  27.31 
 
 		 598 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.67 
 
 		 493 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000784469 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  27.49 
 
 		 596 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.27 
 
 		 482 aa  114  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  26.9 
 
 		 599 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  26.69 
 
 		 598 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.2 
 
 		 470 aa  109  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4077  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.4 
 
 		 491 aa  109  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  26.88 
 
 		 591 aa  109  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2427  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  29.75 
 
 		 599 aa  107  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.250716 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0355  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  29.87 
 
 		 471 aa  107  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3501  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.52 
 
 		 510 aa  106  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3793  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  33.63 
 
 		 533 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.445361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3175  tricarballylate dehydrogenase  29.26 
 
 		 441 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3789  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  33.63 
 
 		 533 aa  106  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.270006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3862  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  33.63 
 
 		 533 aa  106  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314999  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  26.04 
 
 		 589 aa  105  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0482  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  28.33 
 
 		 491 aa  105  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  27.25 
 
 		 504 aa  104  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  27.73 
 
 		 596 aa  104  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0232  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.42 
 
 		 523 aa  104  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0397857  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26990  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  29.32 
 
 		 551 aa  103  7e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  27.53 
 
 		 596 aa  103  9e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  26.25 
 
 		 507 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3960  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.47 
 
 		 577 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052594  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2600  putative FAD-binding dehydrogenase  28.83 
 
 		 570 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742686  normal  0.0811196 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  27.53 
 
 		 596 aa  102  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0182  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.36 
 
 		 588 aa  102  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0682  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.65 
 
 		 640 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000305666  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  27.18 
 
 		 635 aa  101  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  27.27 
 
 		 598 aa  101  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  27.53 
 
 		 596 aa  101  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2894  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.44 
 
 		 529 aa  100  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165292  hitchhiker  0.000448653 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3125  putative FAD-binding dehydrogenase  28.83 
 
 		 570 aa  101  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1851  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.83 
 
 		 532 aa  100  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  27.53 
 
 		 596 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  27.53 
 
 		 596 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  27.53 
 
 		 596 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  27.53 
 
 		 596 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  22.62 
 
 		 519 aa  100  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2702  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.69 
 
 		 489 aa  99.8  9e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3243  putative FAD-binding dehydrogenase  30.16 
 
 		 570 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.650049 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  24.9 
 
 		 589 aa  99.4  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  26.49 
 
 		 1004 aa  98.2  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2292  putative succinate dehydrogenase  28.26 
 
 		 558 aa  98.2  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  25.41 
 
 		 1005 aa  97.8  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  28.43 
 
 		 631 aa  97.8  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3582  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.02 
 
 		 492 aa  97.4  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0224  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.01 
 
 		 539 aa  97.1  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0183  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.27 
 
 		 592 aa  97.1  6e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  26.17 
 
 		 616 aa  96.7  8e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  24 
 
 		 519 aa  96.3  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4658  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.47 
 
 		 492 aa  95.5  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35590  putative FAD-binding dehydrogenase  28.85 
 
 		 577 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000596962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>