More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3048 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3048  ABC transporter related  100 
 
 		 584 aa  1153    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.522258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6064  ABC transporter related protein  41.89 
 
 		 575 aa  362  7.0000000000000005e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3472  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  40.99 
 
 		 564 aa  246  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00244165  hitchhiker  0.00122928 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3689  ABC transporter related protein  37.02 
 
 		 560 aa  214  4.9999999999999996e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2406  ABC transporter related  38.06 
 
 		 570 aa  206  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1593  ABC transporter related protein  39.04 
 
 		 587 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.317799  normal  0.0625099 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37360  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.6 
 
 		 619 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0856  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  31.6 
 
 		 566 aa  177  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5067  ABC transporter related  39.58 
 
 		 549 aa  175  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0419  ABC transporter related protein  30.28 
 
 		 574 aa  171  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.937876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4060  ABC transporter related protein  30.8 
 
 		 570 aa  160  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.282527  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8453  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  29.94 
 
 		 564 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00619084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3727  ABC transporter related  32.34 
 
 		 578 aa  154  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202459  normal  0.0336359 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2082  ABC transporter transmembrane region  29.74 
 
 		 575 aa  154  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3041  ABC transporter transmembrane region  29.53 
 
 		 615 aa  146  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00327338 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28420  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.26 
 
 		 607 aa  139  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.520014 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0647  ABC transporter transmembrane region  27.16 
 
 		 589 aa  137  6.0000000000000005e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.415337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5182  ABC transporter related  28.86 
 
 		 578 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.459442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  27.84 
 
 		 625 aa  126  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66080  transport protein MsbA  26.03 
 
 		 603 aa  124  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  23.77 
 
 		 581 aa  121  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1245  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.84 
 
 		 587 aa  121  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11248  ABC transporter, ATP-binding protein  24.31 
 
 		 566 aa  120  6e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06452  ABC-type RTX toxin transporter ATPase and permease components  28.57 
 
 		 523 aa  120  6e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1941  ABC transporter, transmembrane region  26.72 
 
 		 592 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.121107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0610  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.46 
 
 		 587 aa  119  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0115  ABC transporter related  22.94 
 
 		 609 aa  117  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0698  ABC transporter transmembrane region  27.81 
 
 		 612 aa  117  7.999999999999999e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  25.97 
 
 		 575 aa  116  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  26.53 
 
 		 644 aa  117  8.999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  31.62 
 
 		 595 aa  116  8.999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07640  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.89 
 
 		 588 aa  116  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  24.62 
 
 		 571 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  26.33 
 
 		 720 aa  116  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  25.23 
 
 		 614 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  25.7 
 
 		 601 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2573  ABC transporter related protein  29 
 
 		 619 aa  115  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0847371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2077  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.68 
 
 		 597 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0851764  normal  0.0377374 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5732  transport protein MsbA  25.79 
 
 		 603 aa  115  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.76 
 
 		 582 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  24.31 
 
 		 588 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  24.54 
 
 		 600 aa  114  5e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1127  ABC transporter transmembrane region  31 
 
 		 580 aa  114  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  29.55 
 
 		 1522 aa  114  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  23.08 
 
 		 608 aa  113  8.000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0481  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  26.41 
 
 		 600 aa  113  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4471  ABC transporter related protein  25.14 
 
 		 629 aa  113  9e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0660374  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.81 
 
 		 571 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.23 
 
 		 582 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.25 
 
 		 571 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1375  ABC transporter related  26.38 
 
 		 651 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.07 
 
 		 571 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  24.07 
 
 		 571 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  24.07 
 
 		 571 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  24.07 
 
 		 571 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.07 
 
 		 571 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  24.07 
 
 		 571 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.07 
 
 		 571 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10196  drug ABC transporter ATP-binding protein  30.65 
 
 		 1194 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0038  ABC-type transport system, ATPase and permease components  28.1 
 
 		 576 aa  111  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  26.98 
 
 		 628 aa  112  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.639878 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3979  ABC transporter-related protein  27.12 
 
 		 773 aa  110  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2674  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.15 
 
 		 602 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0832532  normal  0.0804565 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0721  ABC transporter related  25.48 
 
 		 621 aa  110  7.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.787703  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  23.02 
 
 		 578 aa  110  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003987  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  24.16 
 
 		 582 aa  110  7.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  23.02 
 
 		 578 aa  110  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2388  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.96 
 
 		 600 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.496768  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  26.59 
 
 		 578 aa  110  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0054  hypothetical protein  25.55 
 
 		 597 aa  110  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0975  ABC transporter related  27.27 
 
 		 585 aa  110  9.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.685046  hitchhiker  0.000181513 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  22.78 
 
 		 578 aa  109  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0461  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.59 
 
 		 579 aa  110  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2002  type I secretion system ATPase  25.54 
 
 		 712 aa  109  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1705  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.15 
 
 		 602 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.433379  normal  0.881057 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0207  ABC transporter related  24.74 
 
 		 734 aa  109  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1034  ABC transporter related  31.02 
 
 		 1321 aa  109  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.229722 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00588  lipid A export permease/ATP-binding protein MsbA  23.06 
 
 		 569 aa  110  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.232531  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.7 
 
 		 597 aa  109  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1683  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.15 
 
 		 602 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1668  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.15 
 
 		 602 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1889  type I secretion system ATPase  25.72 
 
 		 712 aa  109  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  26.45 
 
 		 660 aa  108  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2090  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  24.59 
 
 		 581 aa  109  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1550  ABC transporter related  26.73 
 
 		 589 aa  109  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.759268  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  24 
 
 		 577 aa  109  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  24.8 
 
 		 590 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  27.71 
 
 		 598 aa  109  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20180  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.35 
 
 		 634 aa  108  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28848 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  26.15 
 
 		 764 aa  108  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4196  ABC transporter transmembrane region  28.21 
 
 		 580 aa  108  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00643785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0637  ABC transporter related  26 
 
 		 588 aa  108  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.188311 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.32 
 
 		 593 aa  108  3e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1770  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  24.9 
 
 		 607 aa  108  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0549134  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0672  ABC transporter related  25.42 
 
 		 777 aa  108  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.264122  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  26.36 
 
 		 589 aa  108  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  23.23 
 
 		 594 aa  108  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0526  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.8 
 
 		 592 aa  108  4e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000230499  normal  0.803212 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01535  lipid transporter ATP-binding/permease protein  23.27 
 
 		 583 aa  107  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  24.11 
 
 		 612 aa  107  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.740474 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>