282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2884 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  100 
 
 		 288 aa  561  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9115  2-oxopent-4-enoate hydratase  66.13 
 
 		 265 aa  309  4e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  65.1 
 
 		 265 aa  305  4.0000000000000004e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  62.2 
 
 		 263 aa  300  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1354  hydratase/decarboxylase  64.32 
 
 		 262 aa  298  6e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000612409  decreased coverage  0.00000118865 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0905  hydratase/decarboxylase  63.9 
 
 		 263 aa  297  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0436706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0272  4-oxalocrotonate decarboxylase  62.5 
 
 		 262 aa  297  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3902  4-oxalocrotonate decarboxylase  64.9 
 
 		 265 aa  293  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.561065 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5207  2-keto-4-pentenoate hydratase  60.77 
 
 		 273 aa  293  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133138  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7646  4-oxalocrotonate decarboxylase  61.92 
 
 		 274 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.573554 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1466  4-oxalocrotonate decarboxylase  60.77 
 
 		 273 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4537  4-oxalocrotonate decarboxylase  59.61 
 
 		 262 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  58.04 
 
 		 264 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1477  4-oxalocrotonate decarboxylase  57.59 
 
 		 264 aa  286  4e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3548  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (CmtF)  57.09 
 
 		 262 aa  285  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.107167 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2327  putative 2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase(MhpD)  59.47 
 
 		 268 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5499  4-oxalocrotonate decarboxylase  58.98 
 
 		 274 aa  279  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2875  4-oxalocrotonate decarboxylase  57.42 
 
 		 268 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2011  4-oxalocrotonate decarboxylase  58.5 
 
 		 260 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2890  4-oxalocrotonate decarboxylase  58.98 
 
 		 262 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0381  2-keto-4-pentenoate hydratase  53.12 
 
 		 269 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.795138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3275  2-keto-4-pentenoate hydratase  53.12 
 
 		 269 aa  271  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3854  hydratase/decarboxylase  54.3 
 
 		 264 aa  271  1e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.595722  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5436  4-oxalocrotonate decarboxylase  56.25 
 
 		 274 aa  270  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.635895 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5833  4-oxalocrotonate decarboxylase  56.25 
 
 		 274 aa  270  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3256  4-oxalocrotonate decarboxylase  52.73 
 
 		 269 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0414  2-keto-4-pentenoate hydratase  52.73 
 
 		 269 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0374  2-keto-4-pentenoate hydratase  52.73 
 
 		 269 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.832182  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15110  2-keto-4-pentenoate hydratase  56.64 
 
 		 264 aa  270  2.9999999999999997e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.473426  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00304  2-keto-4-pentenoate hydratase  52.73 
 
 		 269 aa  269  4e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.503312  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00308  hypothetical protein  52.73 
 
 		 269 aa  269  4e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.527408  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5220  4-oxalocrotonate decarboxylase  56.25 
 
 		 264 aa  267  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1186  4-oxalocrotonate decarboxylase  57.87 
 
 		 264 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0763202  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0911  4-oxalocrotonate decarboxylase  57.59 
 
 		 277 aa  264  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.625128 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0425  2-keto-4-pentenoate hydratase  53.63 
 
 		 269 aa  264  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01662  putative hydratase protein  58.85 
 
 		 265 aa  263  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5134  hydratase/decarboxylase  55.12 
 
 		 263 aa  262  4.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0285955 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0936  4-oxalocrotonate decarboxylase  58.3 
 
 		 268 aa  259  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  52.55 
 
 		 269 aa  259  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2151  4-oxalocrotonate decarboxylase  53.44 
 
 		 271 aa  250  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42150  2-hydroxypent-2,4-dienoate hydratase  53.7 
 
 		 261 aa  247  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1651  4-oxalocrotonate decarboxylase  50.19 
 
 		 275 aa  242  6e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.452701  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3512  4-oxalocrotonate decarboxylase  51.75 
 
 		 269 aa  238  8e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2779  hydratase/decarboxylase  52.79 
 
 		 273 aa  235  5.0000000000000005e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.963348  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  50.18 
 
 		 280 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3242  hydratase/decarboxylase  53.18 
 
 		 260 aa  230  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000968427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4393  hydratase/decarboxylase  52.82 
 
 		 283 aa  228  6e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  48.21 
 
 		 259 aa  228  7e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4925  4-oxalocrotonate decarboxylase  50.2 
 
 		 260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.624784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4745  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.86 
 
 		 270 aa  211  7.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1639  4-oxalocrotonate decarboxylase  49.21 
 
 		 259 aa  211  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.193054 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  45.88 
 
 		 267 aa  206  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  44.92 
 
 		 260 aa  206  5e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  45.91 
 
 		 261 aa  203  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30610  2-Hydroxypent-2,4-dienoate hydratase; LapE  46.51 
 
 		 265 aa  203  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000960153  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  46.64 
 
 		 260 aa  201  8e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  44.09 
 
 		 260 aa  201  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.06 
 
 		 260 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0534  2-oxopent-4-enoate hydratase  49.21 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0224  2-oxopent-4-enoate hydratase  48 
 
 		 264 aa  199  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0261621  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.8 
 
 		 261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  43.31 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  43.7 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  43.31 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  43.53 
 
 		 264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4144  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.34 
 
 		 260 aa  196  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.246439 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1189  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (BphH)  46.38 
 
 		 264 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  42.51 
 
 		 262 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1520  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.5 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.13 
 
 		 260 aa  191  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5044  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.71 
 
 		 261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1392  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.18 
 
 		 263 aa  189  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13569  hydratase  41.27 
 
 		 261 aa  189  4e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748615 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4661  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.92 
 
 		 261 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.930854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4749  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.92 
 
 		 261 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0856703  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.53 
 
 		 261 aa  188  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2961  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.15 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0439  2-oxopent-4-enoate hydratase  47.23 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3325  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.31 
 
 		 266 aa  186  4e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5236  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.92 
 
 		 261 aa  185  8e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1510  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.91 
 
 		 260 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0909  2-oxopent-4-enoate hydratase  36.76 
 
 		 262 aa  177  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0222  4-oxalocrotonate decarboxylase  48.89 
 
 		 262 aa  177  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4269  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  42.22 
 
 		 282 aa  177  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.238552  normal  0.686193 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2155  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase, putative  39.76 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1459  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.28 
 
 		 260 aa  176  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4209  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.71 
 
 		 264 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2578  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.53 
 
 		 276 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1627  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  39.23 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.72873 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1777  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.17 
 
 		 257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2118  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.79 
 
 		 271 aa  172  5e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.609149  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4066  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  42.25 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.597772 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1955  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  38.02 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.504182  normal  0.0219036 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4313  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  38.4 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3798  2-oxopent-4-enoate hydratase  43.67 
 
 		 261 aa  170  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2405  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.08 
 
 		 267 aa  169  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3524  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  39.84 
 
 		 261 aa  169  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1476  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  40.86 
 
 		 260 aa  169  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.161964 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0943  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  39.31 
 
 		 267 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3472  2-oxopent-4-enoate hydratase  38.34 
 
 		 260 aa  168  8e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>