More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1117 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1117  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 		 328 aa  637    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.113705 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1062  transglutaminase domain protein  37.11 
 
 		 281 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  27.71 
 
 		 308 aa  99.4  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1123  hypothetical protein  36.73 
 
 		 292 aa  98.6  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484773  normal  0.370646 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1738  transglutaminase-like cysteine protease  36.51 
 
 		 266 aa  98.2  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1670  transglutaminase domain protein  35.38 
 
 		 277 aa  98.2  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.492777  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1429  transglutaminase domain-containing protein  31.28 
 
 		 265 aa  97.8  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  35.09 
 
 		 272 aa  96.7  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  33.68 
 
 		 285 aa  96.3  6e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  32.04 
 
 		 272 aa  96.3  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0966  transglutaminase domain protein  34.33 
 
 		 281 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  32.76 
 
 		 326 aa  95.5  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  34.08 
 
 		 272 aa  94.7  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  29.56 
 
 		 311 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  32.29 
 
 		 316 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  31.28 
 
 		 280 aa  94  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0878  transglutaminase domain-containing protein  27.72 
 
 		 266 aa  92.4  9e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.53102 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  30.32 
 
 		 273 aa  92  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  31.25 
 
 		 323 aa  91.3  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  30.35 
 
 		 274 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  34.5 
 
 		 316 aa  90.9  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  32.28 
 
 		 266 aa  90.5  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0166  transglutaminase domain protein  36.45 
 
 		 308 aa  89.4  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0772661  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  30.9 
 
 		 272 aa  89.4  9e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  29.85 
 
 		 274 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0645  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 		 288 aa  88.6  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1917  transglutaminase domain-containing protein  34.91 
 
 		 345 aa  88.2  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3407  transglutaminase domain protein  35.37 
 
 		 326 aa  88.2  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  31.34 
 
 		 279 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  31.34 
 
 		 279 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22850  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  32.78 
 
 		 259 aa  87  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  31.34 
 
 		 279 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  32.61 
 
 		 268 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2773  transglutaminase-like  39.22 
 
 		 270 aa  86.7  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  31.75 
 
 		 266 aa  86.7  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  33.14 
 
 		 265 aa  86.3  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0681  transglutaminase domain-containing protein  34.39 
 
 		 350 aa  85.9  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  27.75 
 
 		 318 aa  85.9  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2057  transglutaminase domain-containing protein  34.39 
 
 		 340 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682428  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  34.59 
 
 		 269 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1085  transglutaminase-like  34 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0772  transglutaminase domain-containing protein  34.39 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11713  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2560  transglutaminase-like  34.15 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507077  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4480  transglutaminase domain-containing protein  28.87 
 
 		 272 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2498  transglutaminase-like  35.33 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3435  hypothetical protein  33.53 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1776  transglutaminase domain-containing protein  33.94 
 
 		 338 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2035  transglutaminase domain-containing protein  33.94 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0841583  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0767  transglutaminase domain-containing protein  33.94 
 
 		 338 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.321823  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1060  transglutaminase domain-containing protein  33.94 
 
 		 338 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  27.54 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3244  putative transglutaminase-like superfamily protein  32.34 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1208  transglutaminase domain-containing protein  29.28 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.667068  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2171  transglutaminase domain protein  27.69 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5583  transglutaminase domain protein  23.58 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.700656 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5721  transglutaminase domain protein  28.44 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  27.78 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4253  transglutaminase-like  36.25 
 
 		 366 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0321822  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4113  transglutaminase domain-containing protein  36.25 
 
 		 367 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0069  transglutaminase-like  29.18 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  30.96 
 
 		 314 aa  81.6  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1931  transglutaminase-like  35.62 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4112  transglutaminase domain-containing protein  35.12 
 
 		 339 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.822684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3410  transglutaminase domain-containing protein  35.62 
 
 		 361 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3155  transglutaminase-like  30.54 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0530774  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4408  transglutaminase domain protein  33.75 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.80946 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  27.04 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3524  transglutaminase domain-containing protein  35.62 
 
 		 352 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0116091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4007  transglutaminase domain-containing protein  35.62 
 
 		 352 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.188369 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2551  transglutaminase domain-containing protein  36.59 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138061  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3909  transglutaminase domain-containing protein  29.82 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3755  hypothetical protein  27.55 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2668  transglutaminase domain-containing protein  29.73 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0332836  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1080  transglutaminase domain-containing protein  35 
 
 		 269 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3510  transglutaminase domain protein  24.55 
 
 		 291 aa  79  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  30.26 
 
 		 280 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2214  transglutaminase domain-containing protein  27.45 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.032796  normal  0.659525 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0590  transglutaminase-like  27.76 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.92131  normal  0.206831 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3008  transglutaminase-like  26.98 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2797  transglutaminase domain protein  31.28 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2116  transglutaminase-like  29.89 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.239433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65050  hypothetical protein  32.32 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00894338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1884  transglutaminase domain protein  25.86 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  34.66 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0727  transglutaminase family protein  33.12 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2133  transglutaminase domain-containing protein  30.81 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00733647  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2490  transglutaminase domain protein  28.03 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0150331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4075  transglutaminase domain-containing protein  26.96 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.399957 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2203  transglutaminase domain protein  35.76 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.424742  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4924  transglutaminase-like domain protein  27.38 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1565  transglutaminase domain-containing protein  53.75 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.176972 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2603  transglutaminase domain-containing protein  36.25 
 
 		 417 aa  76.6  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.767969 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1220  transglutaminase domain-containing protein  31.55 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.826592  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1966  transglutaminase domain protein  29.08 
 
 		 304 aa  75.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2317  transglutaminase domain protein  29.47 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.253333  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2678  transglutaminase-like  32.77 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4491  transglutaminase domain-containing protein  32.56 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.401966  normal  0.176228 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0657  transglutaminase domain-containing protein  31.25 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013619 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2048  transglutaminase domain protein  26.51 
 
 		 654 aa  74.3  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.586279 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0199  transglutaminase domain-containing protein  28.99 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>