More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0402 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3039  integrase catalytic region  89.67 
 
 		 368 aa  639    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3264  integrase catalytic region  88.76 
 
 		 356 aa  643    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3414  integrase catalytic region  90.76 
 
 		 368 aa  659    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0441  integrase catalytic region  91.03 
 
 		 368 aa  677    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0402  integrase catalytic region  100 
 
 		 368 aa  738    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1404  integrase catalytic region  88.32 
 
 		 368 aa  640    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.731191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4376  integrase catalytic region  86.12 
 
 		 395 aa  596  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3838  integrase catalytic region  84.32 
 
 		 370 aa  591  1e-168  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3831  hypothetical protein  87.5 
 
 		 252 aa  396  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0221462 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0474  integrase catalytic region  55.06 
 
 		 355 aa  362  4e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3035  integrase catalytic region  54.78 
 
 		 355 aa  361  1e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0478  integrase catalytic region  55.06 
 
 		 355 aa  358  9e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6713  integrase catalytic region  53.65 
 
 		 355 aa  352  7e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0469  integrase catalytic region  53.09 
 
 		 355 aa  350  3e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0554  Integrase catalytic region  50.42 
 
 		 357 aa  331  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402049  hitchhiker  0.00292352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4464  integrase catalytic region  89.02 
 
 		 173 aa  314  9.999999999999999e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3409  integrase catalytic region  55 
 
 		 299 aa  312  6.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.603508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0519  Integrase catalytic region  48.12 
 
 		 347 aa  302  6.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.299528 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3430  hypothetical protein  88.24 
 
 		 189 aa  299  6e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7014  integrase catalytic region  55.15 
 
 		 333 aa  290  4e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4436  hypothetical protein  84.15 
 
 		 214 aa  272  7e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4141  hypothetical protein  48.62 
 
 		 296 aa  239  5e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2959  hypothetical protein  40.63 
 
 		 355 aa  220  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0510943 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0991  hypothetical protein  42.33 
 
 		 355 aa  218  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0485  integrase catalytic region  54.03 
 
 		 359 aa  216  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.444951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6717  integrase catalytic region  53.77 
 
 		 235 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2548  integrase catalytic subunit  36.69 
 
 		 341 aa  208  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0665546  normal  0.0623841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1295  hypothetical protein  37.21 
 
 		 355 aa  207  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2782  integrase catalytic subunit  36.34 
 
 		 341 aa  203  4e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.682547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4409  integrase catalytic region  45.53 
 
 		 303 aa  203  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2864  integrase catalytic subunit  35.71 
 
 		 341 aa  201  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4653  integrase catalytic region  56.59 
 
 		 182 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0496  hypothetical protein  58.14 
 
 		 214 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2627  hypothetical protein  34.88 
 
 		 355 aa  196  7e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2551  integrase catalytic subunit  35.47 
 
 		 350 aa  193  4e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.60087  normal  0.0627465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0499  putative transposase  93.75 
 
 		 96 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4465  hypothetical protein  85.71 
 
 		 130 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3025  integrase catalytic subunit  29.82 
 
 		 364 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0419  integrase  53.85 
 
 		 185 aa  173  5e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.68554  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3084  hypothetical protein  38.28 
 
 		 316 aa  159  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3144  hypothetical protein  92.05 
 
 		 120 aa  156  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0495  putative transposase  62.02 
 
 		 130 aa  152  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4397  hypothetical protein  87.95 
 
 		 172 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.746728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3830  putative transposase  87.23 
 
 		 94 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2696  hypothetical protein  50.97 
 
 		 161 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4622  hypothetical protein  36.27 
 
 		 342 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1367  integrase  38.97 
 
 		 197 aa  129  9.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2706  integrase  39.33 
 
 		 181 aa  126  6e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0154692 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0538  hypothetical protein  57.66 
 
 		 147 aa  125  9e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4472  hypothetical protein  56.52 
 
 		 133 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.708622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2624  hypothetical protein  41.48 
 
 		 156 aa  97.8  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0319312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2699  hypothetical protein  41.48 
 
 		 156 aa  97.8  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4198 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2899  hypothetical protein  36.11 
 
 		 143 aa  96.7  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2625  transposase, IS3  35.1 
 
 		 153 aa  96.7  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.016609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2700  transposase, IS3  35.1 
 
 		 153 aa  96.7  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4658  hypothetical protein  53.61 
 
 		 153 aa  94  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49301  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0484  hypothetical protein  82.14 
 
 		 79 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.580891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3997  hypothetical protein  51.11 
 
 		 236 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630456  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2702  hypothetical protein  34.13 
 
 		 196 aa  87.8  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150142 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1131  hypothetical protein  35.4 
 
 		 171 aa  87  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.907939  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2293  hypothetical protein  22.35 
 
 		 362 aa  82  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2786  hypothetical protein  37.19 
 
 		 185 aa  82  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.987718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3120  hypothetical protein  52.63 
 
 		 198 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0210  putative insertion element protein  25.11 
 
 		 240 aa  72  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.401167 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0142  putative insertion element protein  25.11 
 
 		 240 aa  72  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0205  putative insertion element protein  25.11 
 
 		 240 aa  72  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0489  putative transposase  49.32 
 
 		 81 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2787  integrase core subunit  37.11 
 
 		 106 aa  65.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1369  integrase catalytic subunit  24.09 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4374  putative transposase  47.69 
 
 		 65 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2485  Integrase catalytic region  26.27 
 
 		 364 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.151437 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4908  integrase catalytic subunit  24.15 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168017 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0118  Integrase catalytic region  25.94 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2449  Integrase catalytic region  26.83 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.708832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1394  Integrase catalytic region  26.64 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.295612  normal  0.0489416 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2198  Integrase catalytic region  26.64 
 
 		 364 aa  59.7  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0876  Integrase catalytic region  26.64 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.506232 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0171  Integrase catalytic region  26.83 
 
 		 374 aa  59.7  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.804004  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0779  Integrase catalytic region  26.83 
 
 		 409 aa  59.7  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.89745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2064  Integrase catalytic region  26.64 
 
 		 365 aa  59.7  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3325  hypothetical protein  26.64 
 
 		 361 aa  59.7  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.683157  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3500  hypothetical protein  26.64 
 
 		 364 aa  59.3  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000000943241  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1990  Integrase catalytic region  26.64 
 
 		 360 aa  59.3  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0292285  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0455  Integrase catalytic region  26.64 
 
 		 371 aa  59.3  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.664001 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0711  Integrase catalytic region  26.64 
 
 		 359 aa  59.7  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000332452  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0748  Integrase catalytic region  26.83 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000105818  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1352  Integrase catalytic region  26.64 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3104  Integrase catalytic region  26.64 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.350781  normal  0.299563 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1887  Integrase catalytic region  33.7 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.282535 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1886  Integrase catalytic region  33.7 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3960  Integrase catalytic region  33.7 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382194  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1159  Integrase catalytic region  26.64 
 
 		 358 aa  59.7  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.565735  decreased coverage  0.00186464 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2691  Integrase catalytic region  26.64 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00149975  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1497  Integrase catalytic region  26.64 
 
 		 355 aa  59.3  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  hitchhiker  0.000449962 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3167  Integrase catalytic region  26.83 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.179309  normal  0.231083 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1178  Integrase catalytic region  26.83 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0321  Integrase catalytic region  26.83 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1779  Integrase catalytic region  26.64 
 
 		 378 aa  59.3  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1702  Integrase catalytic region  26.64 
 
 		 364 aa  59.3  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.431472  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3080  Integrase catalytic region  26.64 
 
 		 371 aa  59.3  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.459868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>