42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3144 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3144  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  242  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0441  integrase catalytic region  96.59 
 
 		 368 aa  166  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3414  integrase catalytic region  94.32 
 
 		 368 aa  162  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3039  integrase catalytic region  93.18 
 
 		 368 aa  161  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4465  hypothetical protein  77.48 
 
 		 130 aa  160  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1404  integrase catalytic region  93.18 
 
 		 368 aa  159  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.731191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3264  integrase catalytic region  92.05 
 
 		 356 aa  158  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0402  integrase catalytic region  92.05 
 
 		 368 aa  156  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3831  hypothetical protein  89.77 
 
 		 252 aa  155  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0221462 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4376  integrase catalytic region  92.94 
 
 		 395 aa  155  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3430  hypothetical protein  88.64 
 
 		 189 aa  149  8.999999999999999e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3838  integrase catalytic region  76 
 
 		 370 aa  145  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4436  hypothetical protein  91.43 
 
 		 214 aa  126  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4658  hypothetical protein  53.41 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49301  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4397  hypothetical protein  81.63 
 
 		 172 aa  80.5  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.746728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0478  integrase catalytic region  54.12 
 
 		 355 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2696  hypothetical protein  52.33 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0469  integrase catalytic region  52.94 
 
 		 355 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0484  hypothetical protein  88.64 
 
 		 79 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.580891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0496  hypothetical protein  56 
 
 		 214 aa  77  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4472  hypothetical protein  53.66 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.708622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0474  integrase catalytic region  51.76 
 
 		 355 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3035  integrase catalytic region  51.76 
 
 		 355 aa  74.3  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6713  integrase catalytic region  49.41 
 
 		 355 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0554  Integrase catalytic region  43.53 
 
 		 357 aa  65.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402049  hitchhiker  0.00292352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4141  hypothetical protein  44.94 
 
 		 296 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4409  integrase catalytic region  55.56 
 
 		 303 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0519  Integrase catalytic region  38.89 
 
 		 347 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.299528 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2624  hypothetical protein  40.3 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0319312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2699  hypothetical protein  40.3 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4198 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2548  integrase catalytic subunit  40.3 
 
 		 341 aa  50.8  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0665546  normal  0.0623841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2782  integrase catalytic subunit  39.44 
 
 		 341 aa  50.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.682547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2898  hypothetical protein  43.02 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.859242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2306  hypothetical protein  43.02 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0447  aldo/keto reductase  48.28 
 
 		 412 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2786  hypothetical protein  35.82 
 
 		 185 aa  46.2  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.987718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4652  hypothetical protein  58.7 
 
 		 54 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4622  hypothetical protein  52.17 
 
 		 342 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2874  hypothetical protein  33.63 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.110212  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2864  integrase catalytic subunit  36.23 
 
 		 341 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3410  hypothetical protein  47.92 
 
 		 51 aa  41.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.561039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3025  integrase catalytic subunit  30.88 
 
 		 364 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>