214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0130 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9017  glycoside hydrolase  65.34 
 
 
639 aa  801    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0304  glycoside hydrolase 15-related protein  64.19 
 
 
636 aa  803    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5241  glycoside hydrolase 15-related  64.96 
 
 
679 aa  812    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2670  glycoside hydrolase 15-related protein  67.52 
 
 
659 aa  809    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.206997  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4442  glycoside hydrolase 15-related  86.16 
 
 
635 aa  1108    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.807083  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2783  glycoside hydrolase 15-related protein  64.53 
 
 
662 aa  800    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.818274  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3484  glycoside hydrolase 15-related  65.7 
 
 
677 aa  832    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1555  glycoside hydrolase 15-related protein  57.53 
 
 
645 aa  713    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3547  glycoside hydrolase 15-related  65.7 
 
 
677 aa  832    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269998  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3877  glycoside hydrolase 15-related  65.54 
 
 
668 aa  828    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929233  normal  0.274692 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3218  glycoside hydrolase 15-related protein  63.81 
 
 
629 aa  772    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0130  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 
636 aa  1293    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322371  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3497  glycoside hydrolase 15-related protein  65.7 
 
 
677 aa  830    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.83213  normal  0.993865 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2676  glycoside hydrolase 15-related  64.9 
 
 
672 aa  822    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12430  hypothetical protein  65.86 
 
 
642 aa  830    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0874  glycoside hydrolase 15-related protein  55.21 
 
 
645 aa  661    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.219987  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  39.72 
 
 
613 aa  410  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  40.26 
 
 
612 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1839  glycoside hydrolase 15-like protein  39.63 
 
 
609 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2631  glycoside hydrolase 15-related protein  40.63 
 
 
610 aa  399  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.85517  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2298  glycoside hydrolase family protein  39.58 
 
 
608 aa  398  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000521372 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  40.96 
 
 
625 aa  396  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2493  glycosyl hydrolase, family 15  38.76 
 
 
608 aa  395  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  39.33 
 
 
595 aa  393  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2053  glycoside hydrolase 15-like protein  38.12 
 
 
612 aa  394  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0740  glycoside hydrolase 15-related  40.48 
 
 
594 aa  392  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000780754 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  40.03 
 
 
597 aa  394  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  40.16 
 
 
601 aa  392  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2637  glycoside hydrolase 15-related  37.38 
 
 
612 aa  386  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872982  normal  0.317086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  40 
 
 
586 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  40.58 
 
 
600 aa  387  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1262  glycoside hydrolase 15-related  41.41 
 
 
599 aa  383  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212074  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4753  glycoside hydrolase 15-related  38.03 
 
 
617 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392129  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1458  hypothetical protein  39.1 
 
 
619 aa  382  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3972  glycoside hydrolase 15-related  39.1 
 
 
594 aa  380  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6083  glycoside hydrolase 15-related  37.89 
 
 
619 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3597  glycosyl hydrolase  37.76 
 
 
613 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143916  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  39.32 
 
 
605 aa  374  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2805  glycoside hydrolase 15-related  34.57 
 
 
606 aa  375  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4178  glycoside hydrolase 15-related  39.67 
 
 
602 aa  375  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  38.9 
 
 
596 aa  375  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  37.46 
 
 
627 aa  370  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  38.19 
 
 
623 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0636  glycoside hydrolase 15-related  38.36 
 
 
596 aa  366  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.252902 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  38.85 
 
 
605 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  39.15 
 
 
602 aa  368  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0662  glycoside hydrolase 15-related  38.45 
 
 
599 aa  364  2e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.98691  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  38.85 
 
 
611 aa  364  2e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5016  glycoside hydrolase 15-related  39.17 
 
 
620 aa  364  3e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346719  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  37.74 
 
 
605 aa  363  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  37.68 
 
 
623 aa  363  7.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2739  glycoside hydrolase 15-related  37.2 
 
 
868 aa  362  1e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  37.64 
 
 
627 aa  362  1e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  38.07 
 
 
598 aa  361  2e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1889  glycoside hydrolase 15-related  36.74 
 
 
628 aa  360  3e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  38.1 
 
 
602 aa  360  6e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2304  glycoside hydrolase 15-related  38.76 
 
 
629 aa  359  8e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0495  glycoside hydrolase 15-related  37.86 
 
 
850 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0709785  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2221  glycoside hydrolase 15-related  36.94 
 
 
629 aa  357  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.47464  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4565  glycoside hydrolase 15-related protein  39.39 
 
 
623 aa  356  7.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2754  glycoside hydrolase 15-related  39.27 
 
 
607 aa  356  8.999999999999999e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.285635  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  37.58 
 
 
598 aa  355  2e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1238  glycoside hydrolase 15-like protein  39.24 
 
 
616 aa  353  5e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428683  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  37.78 
 
 
619 aa  353  5e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  37.07 
 
 
617 aa  353  7e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  37.8 
 
 
609 aa  352  8e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1144  glycoside hydrolase 15-related protein  34.02 
 
 
696 aa  352  1e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  37.17 
 
 
665 aa  352  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4963  glycoside hydrolase 15-related  37.78 
 
 
619 aa  351  2e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0703179  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  38.07 
 
 
593 aa  350  5e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4161  glycoside hydrolase 15-related  36.24 
 
 
602 aa  350  6e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0712093  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3320  glycoside hydrolase 15-related  38.17 
 
 
610 aa  349  1e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.147589 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3391  glycoside hydrolase 15-related  39.45 
 
 
617 aa  349  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  36.94 
 
 
601 aa  348  2e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3193  glycoside hydrolase 15-related  39.32 
 
 
621 aa  348  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2196  glycoside hydrolase family protein 15  36.04 
 
 
625 aa  348  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119453  decreased coverage  0.00245917 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3314  glycoside hydrolase 15-related  39.38 
 
 
617 aa  348  2e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  37.32 
 
 
609 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1640  glycoside hydrolase 15-related  34.97 
 
 
887 aa  347  3e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  37.32 
 
 
609 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  37.32 
 
 
609 aa  347  6e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  38.35 
 
 
613 aa  346  7e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1886  glycoside hydrolase 15-like protein  36.3 
 
 
601 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177282  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3676  glycoside hydrolase 15-related  36.24 
 
 
600 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  38.57 
 
 
602 aa  346  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  37 
 
 
611 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  36.83 
 
 
599 aa  345  1e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  37 
 
 
609 aa  345  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  38.57 
 
 
602 aa  344  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1271  glycoside hydrolase 15-related protein  35.74 
 
 
594 aa  344  2.9999999999999997e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3385  glycoside hydrolase 15-related  37.76 
 
 
614 aa  342  9e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.371631 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1950  glycoside hydrolase 15-related protein  39.2 
 
 
629 aa  342  1e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  37.16 
 
 
609 aa  342  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  36.61 
 
 
626 aa  341  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3936  glycoside hydrolase 15-related  37.5 
 
 
603 aa  340  4e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00859022 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  36.82 
 
 
610 aa  339  8e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  36.82 
 
 
610 aa  339  8e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  36.82 
 
 
610 aa  339  8e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  36.82 
 
 
610 aa  339  8e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  36.82 
 
 
610 aa  339  8e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>