54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3995 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3995  hypothetical protein  100 
 
 		 535 aa  1054    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1817  hypothetical protein  80.34 
 
 		 527 aa  806    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1829  hypothetical protein  79.45 
 
 		 519 aa  245  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.790785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3993  hypothetical protein  82.14 
 
 		 346 aa  237  4e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.522345  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1827  hypothetical protein  67.2 
 
 		 484 aa  232  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2840  hypothetical protein  86.67 
 
 		 503 aa  227  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2638  hypothetical protein  66.49 
 
 		 526 aa  216  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2626  hypothetical protein  77.4 
 
 		 519 aa  209  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2802  hypothetical protein  61.45 
 
 		 537 aa  185  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2698  hypothetical protein  61.22 
 
 		 514 aa  183  6e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0401  hypothetical protein  58.27 
 
 		 181 aa  156  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1131  hypothetical protein  39.37 
 
 		 491 aa  155  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2699  hypothetical protein  50.31 
 
 		 175 aa  150  7e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.979675  normal  0.518352 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2378  hypothetical protein  48.82 
 
 		 255 aa  148  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1837  hypothetical protein  62.88 
 
 		 509 aa  148  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1646  transcriptional regulator, XRE family  36.03 
 
 		 403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.24387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0051  hypothetical protein  64.75 
 
 		 565 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2029  hypothetical protein  78.57 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.775035  normal  0.520928 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3359  helix-turn-helix domain-containing protein  33.8 
 
 		 407 aa  113  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3599  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34153  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8549  transcriptional regulator, XRE family  29.51 
 
 		 410 aa  103  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123157  hitchhiker  0.000343252 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5282  hypothetical protein  29.41 
 
 		 470 aa  95.5  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4820  hypothetical protein  31.28 
 
 		 399 aa  94.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.906768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2462  XRE family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 524 aa  94  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2078  hypothetical protein  28.94 
 
 		 350 aa  82.4  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0683232  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0010  XRE family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 401 aa  79  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141867  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2579  hypothetical protein  30.34 
 
 		 562 aa  78.2  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.113551 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1528  XRE family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0669  transcriptional regulator, XRE family  30.2 
 
 		 383 aa  76.3  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2850  hypothetical protein  29.13 
 
 		 445 aa  73.9  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.431926  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30330  predicted transcriptional regulator  28.47 
 
 		 411 aa  72.8  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4570  transcriptional regulator, XRE family  34.17 
 
 		 414 aa  73.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1521  XRE family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 401 aa  70.5  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.965018 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3690  XRE family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.456142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8589  transcriptional regulator, XRE family  29.37 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00719609  normal  0.402307 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4372  transcriptional regulator, XRE family  31.02 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2778  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.32 
 
 		 401 aa  64.7  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1631  transcriptional regulator, XRE family  29.06 
 
 		 401 aa  64.3  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.182309 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1330  XRE family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 404 aa  63.5  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1360  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.47 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0194  transcriptional regulator, XRE family  31.14 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0564  hypothetical protein  34.04 
 
 		 554 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.19709 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1756  XRE family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 409 aa  58.9  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5975  hypothetical protein  34.82 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0655  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.143096 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3045  XRE family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 406 aa  55.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.181635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6329  putative transcriptional regulator, XRE family  29.68 
 
 		 407 aa  53.9  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1102  transcriptional regulator, XRE family  26.95 
 
 		 403 aa  53.9  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4908  XRE family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 402 aa  47.8  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3801  hypothetical protein  33 
 
 		 397 aa  47.4  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4555  hypothetical protein  30.26 
 
 		 372 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.922053  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0163  hypothetical protein  33.04 
 
 		 505 aa  46.6  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4158  XRE family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 403 aa  46.6  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0178123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1530  XRE family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 403 aa  43.9  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0255908 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>