More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2751 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 131 aa  262  8.999999999999999e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  56.52 
 
 		 168 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 162 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 162 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  50.48 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  50.98 
 
 		 177 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  51 
 
 		 158 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  51 
 
 		 158 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  51 
 
 		 158 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  51 
 
 		 158 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  51 
 
 		 158 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  51 
 
 		 158 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  51 
 
 		 158 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  53.26 
 
 		 168 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  50 
 
 		 212 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  49.49 
 
 		 193 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  46.61 
 
 		 177 aa  104  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  45.37 
 
 		 162 aa  104  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  51.09 
 
 		 172 aa  104  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0559  transcriptional regulator, HxlR family  51.04 
 
 		 149 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 160 aa  104  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  48.96 
 
 		 159 aa  103  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  53.76 
 
 		 161 aa  103  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2705  HxlR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2987  hypothetical protein  45.37 
 
 		 187 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  48 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  45.38 
 
 		 165 aa  100  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6614  transcriptional regulator, HxlR family  46.23 
 
 		 158 aa  100  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113914 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2048  transcriptional regulator, HxlR family  49.46 
 
 		 147 aa  99.4  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  46.53 
 
 		 290 aa  99.4  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  44.23 
 
 		 153 aa  97.1  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  47.47 
 
 		 209 aa  96.7  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 175 aa  95.1  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  45 
 
 		 155 aa  94.7  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  53.19 
 
 		 147 aa  94  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 149 aa  93.6  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  43.93 
 
 		 157 aa  94  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  42.99 
 
 		 157 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  43.43 
 
 		 157 aa  93.6  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 167 aa  93.6  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  47.87 
 
 		 188 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 171 aa  92.8  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0996  transcriptional regulator, HxlR family  48.91 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2369  transcriptional regulator, HxlR family  45.16 
 
 		 158 aa  92  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1269  HxlR family transcriptional regulator  46 
 
 		 318 aa  91.3  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.178567  decreased coverage  0.00270462 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 164 aa  90.1  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  44 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6089  transcriptional regulator, HxlR family  47.12 
 
 		 166 aa  89.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289609  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3620  hypothetical protein  46.46 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 170 aa  88.6  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46480  putative transcriptional regulator  44.21 
 
 		 168 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000073333  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4941  HxlR family transcriptional regulator  49.45 
 
 		 295 aa  88.6  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388372 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 147 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 147 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 156 aa  88.2  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5213  transcriptional regulator, HxlR family  48.42 
 
 		 229 aa  87.8  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  43 
 
 		 140 aa  87  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 145 aa  87  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  44.54 
 
 		 161 aa  87  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1663  transcriptional regulator, HxlR family  42.57 
 
 		 280 aa  87  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  42.45 
 
 		 148 aa  86.7  9e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3271  HxlR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 165 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865033 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  42.45 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  44 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5101  HxlR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5780  HxlR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 175 aa  84.7  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239726 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0959  putative transcriptional regulator  41.23 
 
 		 168 aa  84.3  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0547  HxlR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660753  normal  0.959277 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 		 160 aa  84.7  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  42.99 
 
 		 149 aa  84.3  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  41.59 
 
 		 159 aa  84  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2675  HxlR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 172 aa  84  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0277  transcriptional regulator, HxlR family  46.46 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  41.9 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  41.9 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  41.9 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1471  transcriptional regulator, HxlR family  43.43 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  41.9 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  43.75 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  41.9 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5484  HxlR family transcriptional regulator  42 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199529  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0502  HxlR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.531787 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2125  transcriptional regulator, HxlR family  38.3 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.5635  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  41.9 
 
 		 268 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3117  HxlR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 314 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0817694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  41.9 
 
 		 244 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>