139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1612 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1612  NLP/P60  100 
 
 		 200 aa  407  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.676409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5736  NLP/P60 protein  81.69 
 
 		 326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  52.88 
 
 		 366 aa  105  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  64.29 
 
 		 347 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  60 
 
 		 368 aa  95.1  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  59.21 
 
 		 392 aa  92.4  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  53.85 
 
 		 367 aa  84  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  37.5 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4554  NLP/P60 protein  43.75 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  45.31 
 
 		 306 aa  55.5  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  43.28 
 
 		 337 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  36.17 
 
 		 374 aa  53.9  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3552  NLP/P60 protein  40.85 
 
 		 297 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.01109  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  39.29 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  47.06 
 
 		 337 aa  52.8  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  42.31 
 
 		 337 aa  51.6  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  40 
 
 		 438 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  43.1 
 
 		 370 aa  51.6  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  41.94 
 
 		 417 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1293  NLP/P60  36.76 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0496746  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0198  NLP/P60 protein  39.13 
 
 		 458 aa  50.1  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.193606 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  42.25 
 
 		 325 aa  50.4  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  45.61 
 
 		 345 aa  50.1  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  31.82 
 
 		 374 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  52.27 
 
 		 531 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 180 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  39.44 
 
 		 174 aa  48.5  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  37.68 
 
 		 452 aa  48.5  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  39.66 
 
 		 432 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  40.68 
 
 		 459 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6248  NLP/P60 protein  35.56 
 
 		 285 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0809629  normal  0.153407 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0045  NlpC/P60 family domain protein  42.11 
 
 		 174 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000018046  normal  0.424193 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0926  Tn916, NLP/P60 family protein  46.15 
 
 		 333 aa  47.4  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  35.71 
 
 		 349 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  32.18 
 
 		 278 aa  47  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  43.08 
 
 		 340 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  42.37 
 
 		 388 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  40 
 
 		 487 aa  46.6  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  40.68 
 
 		 308 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  43.37 
 
 		 411 aa  46.6  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  36.23 
 
 		 332 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  40.91 
 
 		 467 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  40.91 
 
 		 467 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1072  NLP/P60 protein  37.88 
 
 		 393 aa  45.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  34.15 
 
 		 269 aa  45.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0805  cell wall-associated hydrolase  45.1 
 
 		 395 aa  45.4  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0271814  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5716  NLP/P60 protein  39.39 
 
 		 469 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2670  NLP/P60 protein  37.04 
 
 		 818 aa  45.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  37.7 
 
 		 202 aa  45.4  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0895  NLP/P60 protein  39.39 
 
 		 469 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5292  NLP/P60 protein  39.39 
 
 		 469 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308075  normal  0.186714 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  38.33 
 
 		 453 aa  45.4  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7119  NLP/P60 protein  34.95 
 
 		 182 aa  45.1  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  48.72 
 
 		 333 aa  45.1  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4520  NLP/P60 protein  39.39 
 
 		 472 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2555  NLP/P60 protein  36.99 
 
 		 199 aa  44.7  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2166  NLP/P60 protein  37.66 
 
 		 194 aa  44.7  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343346  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  34.67 
 
 		 388 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  32.53 
 
 		 267 aa  44.7  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  37.25 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  38.6 
 
 		 475 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  38.6 
 
 		 475 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  39.39 
 
 		 469 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  38.6 
 
 		 475 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4564  NLP/P60 protein  39.39 
 
 		 467 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.057013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2839  NLP/P60 protein  37.88 
 
 		 469 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.239503 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3663  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 479 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.24038  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  42.19 
 
 		 342 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01907  lipoprotein  41.94 
 
 		 133 aa  44.3  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.324405  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  32.89 
 
 		 307 aa  44.3  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  36.11 
 
 		 230 aa  44.3  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  43.4 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  38.3 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  51.11 
 
 		 318 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  33.73 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  37.31 
 
 		 331 aa  43.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  46 
 
 		 375 aa  43.5  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  34.52 
 
 		 284 aa  43.9  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2747  NLP/P60 protein  36.84 
 
 		 478 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4529  NLP/P60 protein  40 
 
 		 239 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.612016  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  50 
 
 		 334 aa  43.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  31.11 
 
 		 517 aa  43.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  36.62 
 
 		 432 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1658  hypothetical protein  41.18 
 
 		 287 aa  43.1  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110646  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  33.78 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1605  NLP/P60 protein  41.18 
 
 		 279 aa  43.1  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  46 
 
 		 391 aa  43.5  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  40.32 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  38.98 
 
 		 394 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2140  NLP/P60 protein  35.19 
 
 		 427 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000576124  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5720  NLP/P60 protein  38.81 
 
 		 257 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3652  NLP/P60 protein  38.81 
 
 		 257 aa  42.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5288  NLP/P60 protein  38.81 
 
 		 257 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.181073 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3074  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 116 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  36.71 
 
 		 295 aa  42.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  40 
 
 		 275 aa  42.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 341 aa  43.1  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  32.93 
 
 		 269 aa  43.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  36.99 
 
 		 302 aa  42.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  33.82 
 
 		 293 aa  42.7  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>