More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0900 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0900  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 145 aa  301  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2547  NUDIX hydrolase  80.71 
 
 		 143 aa  246  6e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1992  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 145 aa  151  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0853  normal  0.178194 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2817  NUDIX hydrolase  45.07 
 
 		 147 aa  140  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.30538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2614  NUDIX hydrolase  47.89 
 
 		 171 aa  139  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3237  NUDIX hydrolase  41.96 
 
 		 177 aa  121  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778002  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2666  NUDIX hydrolase  46.97 
 
 		 182 aa  121  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2270  NUDIX hydrolase  44.03 
 
 		 174 aa  117  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.792713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5523  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  49.29 
 
 		 257 aa  117  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00475491  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1811  NUDIX hydrolase  40.43 
 
 		 145 aa  115  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2195  NUDIX hydrolase  44.97 
 
 		 156 aa  114  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2246  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 		 168 aa  104  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171331  decreased coverage  0.0000730626 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1297  NUDIX hydrolase  41.33 
 
 		 182 aa  103  6e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2346  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 157 aa  103  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21040  ADP-ribose pyrophosphatase  42.55 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2398  NUDIX hydrolase  42.55 
 
 		 177 aa  99.8  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10425  normal  0.260078 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1257  NUDIX hydrolase  40.65 
 
 		 146 aa  92.8  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2406  putative Nudix hydrolase family protein  38.26 
 
 		 149 aa  92  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09350  dihydrofolate reductase  36.55 
 
 		 337 aa  80.5  0.000000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.32591  normal  0.990964 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1355  putative MutT-family protein  37.04 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1930  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.229344 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3844  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1907  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397506  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2812  hypothetical protein  42.65 
 
 		 75 aa  67  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3209  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2608  hypothetical protein  41.18 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  33.88 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  33.88 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  33.88 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5041  NUDIX hydrolase  36.79 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.216707 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0830  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2466  hypothetical protein  35.9 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2121  NUDIX hydrolase  29.13 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575199  decreased coverage  0.00514227 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06029  ADP-ribose pyrophosphatase MutT  30.25 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5001  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 156 aa  57  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28290  hypothetical protein  37.61 
 
 		 136 aa  57  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00379954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1914  NUDIX hydrolase  28.35 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.592421  normal  0.977797 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  41.76 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2429  mutT like protein  31.15 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2716  MutT/NUDIX family protein  35.8 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01990  ADP-ribose pyrophosphatase  39 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4458  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 		 334 aa  54.3  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0094  NUDIX hydrolase  26.43 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.126747  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  35.35 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  35.35 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  28.85 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0258  MutT/Nudix family protein  30.51 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  39.56 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3231  NUDIX hydrolase  27.87 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0727  NUDIX/MutT family protein  31.97 
 
 		 150 aa  52.8  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.371838  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3784  NUDIX hydrolase  32.11 
 
 		 158 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1077  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 		 244 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643191  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1522  NUDIX hydrolase  33.02 
 
 		 160 aa  51.6  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000261274 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  34.96 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2654  NUDIX hydrolase  28.97 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  30.58 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  38.89 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  38.89 
 
 		 149 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  29.52 
 
 		 136 aa  51.2  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2537  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 		 150 aa  51.2  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  38.89 
 
 		 149 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  38.89 
 
 		 149 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  38.89 
 
 		 149 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  28.32 
 
 		 261 aa  50.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  29.84 
 
 		 147 aa  50.4  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1971  mutator MutT protein  29.36 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.027425  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2686  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  32.69 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310131  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  30.69 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03438  MutT-nudix family protein  34.35 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3657  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  37.78 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3674  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 175 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78124 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  35.35 
 
 		 315 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0542  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  0.118986 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4889  hypothetical protein  33.61 
 
 		 337 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  28.97 
 
 		 386 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  28.79 
 
 		 347 aa  48.9  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3533  NUDIX family pyrophosphatase  36.11 
 
 		 334 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3203  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 182 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  30.09 
 
 		 329 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  33.33 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2072  NUDIX hydrolase  30.7 
 
 		 281 aa  49.3  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.453494  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3686  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0090  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  32.17 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0572  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546019  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0575  MutT/nudix family protein  32.38 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0762  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  31.78 
 
 		 363 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0146  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  27.55 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  28.81 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1522  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  32.69 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.596031  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2765  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000522672  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0799  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 		 148 aa  48.1  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.428384 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>