More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0964 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0964  diguanylate cyclase  100 
 
 		 778 aa  1584    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1381  GAF domain-containing protein  48.34 
 
 		 304 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.20915  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0402  putative GAF sensor protein  47.02 
 
 		 309 aa  263  1e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0441424  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0418  putative GAF sensor protein  46.03 
 
 		 309 aa  262  2e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1669  diguanylate cyclase  31.25 
 
 		 499 aa  212  2e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0532  putative GAF sensor protein  40.87 
 
 		 315 aa  210  8e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0244089  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2068  putative GAF sensor protein  61.02 
 
 		 154 aa  150  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000182132  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1447  GAF domain-containing protein  52.71 
 
 		 151 aa  137  5e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2653  putative GAF sensor protein  49.23 
 
 		 163 aa  130  8.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21320  diguanylate cyclase  30.19 
 
 		 510 aa  124  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00550  hypothetical protein  45.65 
 
 		 160 aa  122  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2363  putative GAF sensor protein  42.86 
 
 		 150 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000295026  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0620  diguanylate cyclase  30.32 
 
 		 517 aa  114  5e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089586 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  34.76 
 
 		 836 aa  110  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1694  diguanylate cyclase  44.52 
 
 		 431 aa  109  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.33 
 
 		 841 aa  108  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  34.02 
 
 		 792 aa  107  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1809  GAF domain-containing protein  40.85 
 
 		 154 aa  105  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000874323  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1774  hypothetical protein  40.85 
 
 		 154 aa  105  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00245693  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4847  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.82 
 
 		 681 aa  103  9e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0827  hypothetical protein  43.2 
 
 		 165 aa  103  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.828364  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0767  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.29 
 
 		 675 aa  103  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000798179  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3413  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.29 
 
 		 342 aa  102  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02671  predicted signal transduction protein containing a membrane domain, an EAL and a GGDEF domain  34.83 
 
 		 531 aa  103  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2497  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.61 
 
 		 355 aa  103  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000595067  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3052  GGDEF  38.61 
 
 		 523 aa  102  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.927179  normal  0.0159246 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  31.84 
 
 		 1073 aa  101  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1139  GGDEF/GAF/EAL domain-containing protein  33.18 
 
 		 781 aa  101  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0850133  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1924  diguanylate cyclase  38.36 
 
 		 492 aa  99.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268801  normal  0.495061 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6178  diguanylate cyclase  38.36 
 
 		 492 aa  99.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837587  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1139  GAF domain-containing protein  42.62 
 
 		 169 aa  99.4  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.718876  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1901  diguanylate cyclase  38.36 
 
 		 492 aa  99.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0817  diguanylate cyclase  38.41 
 
 		 1826 aa  99  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4045  diguanylate cyclase  38.36 
 
 		 492 aa  99  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1630  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.22 
 
 		 739 aa  99  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0509  diguanylate cyclase  31.16 
 
 		 498 aa  98.6  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480754 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1598  diguanylate cyclase  36.09 
 
 		 492 aa  98.6  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0273825  normal  0.888834 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0953  diguanylate cyclase  33.52 
 
 		 494 aa  98.6  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0658  diguanylate cyclase  31.36 
 
 		 547 aa  98.6  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3430  diguanylate cyclase  29.63 
 
 		 513 aa  98.6  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3606  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.15 
 
 		 757 aa  98.2  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0926  diguanylate cyclase  33.52 
 
 		 494 aa  98.2  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4771  hypothetical protein  44.92 
 
 		 159 aa  97.8  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0567  diguanylate cyclase  38.41 
 
 		 280 aa  98.2  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000656533  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4788  hypothetical protein  44.92 
 
 		 159 aa  98.2  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00635993  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4552  hypothetical protein  44.92 
 
 		 159 aa  97.8  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4905  hypothetical protein  44.92 
 
 		 159 aa  97.8  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2736  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.94 
 
 		 748 aa  97.8  7e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4503  diguanylate cyclase  37.74 
 
 		 492 aa  97.4  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4000  sensor protein  38.41 
 
 		 162 aa  97.4  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4790  hypothetical protein  44.92 
 
 		 159 aa  97.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4387  hypothetical protein  44.92 
 
 		 159 aa  97.1  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4397  hypothetical protein  44.92 
 
 		 159 aa  97.1  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0507  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.58 
 
 		 557 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1745  GAF domain-containing protein  41.32 
 
 		 170 aa  96.7  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0130  putative GAF sensor protein  42.28 
 
 		 160 aa  97.1  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2703  diguanylate cyclase  31.16 
 
 		 339 aa  97.1  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0717  putative GAF sensor protein  47.71 
 
 		 158 aa  96.7  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4694  diguanylate cyclase  36.48 
 
 		 492 aa  96.3  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3583  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.51 
 
 		 322 aa  96.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000864033 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01999  GAF domain-containing protein  41.61 
 
 		 151 aa  96.3  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.130438  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3659  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.13 
 
 		 362 aa  96.3  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3961  diguanylate cyclase  31.36 
 
 		 340 aa  96.3  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.042208 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1062  GGDEF domain-containing protein  32.52 
 
 		 438 aa  96.7  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2823  hypothetical protein  40.5 
 
 		 202 aa  95.5  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2879  hypothetical protein  40.5 
 
 		 202 aa  95.5  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2866  diguanylate cyclase  33.51 
 
 		 401 aa  95.9  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.692442 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0473  hypothetical protein  44.07 
 
 		 159 aa  95.5  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.253939  hitchhiker  3.4768e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4762  hypothetical protein  44.07 
 
 		 159 aa  95.5  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.01469  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3325  GAF domain-containing protein  43.22 
 
 		 159 aa  95.5  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.10653  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3152  diguanylate cyclase  29.26 
 
 		 653 aa  95.9  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000175722  hitchhiker  0.00223393 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4483  putative GAF sensor protein  43.22 
 
 		 159 aa  95.1  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1925  GAF domain-containing protein  38 
 
 		 160 aa  94.7  5e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000712217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1067  diguanylate cyclase  38.46 
 
 		 490 aa  94.7  5e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1276  putative sensor with GAF domain  45.1 
 
 		 166 aa  95.1  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1208 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0031  diguanylate cyclase  37.43 
 
 		 501 aa  94.7  6e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0530472  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2829  hypothetical protein  40.5 
 
 		 170 aa  94.4  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0190862  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2019  GAF domain-containing protein  40 
 
 		 171 aa  94.4  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2452  hypothetical protein  40.5 
 
 		 170 aa  94.4  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2764  hypothetical protein  40.5 
 
 		 202 aa  94.4  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0826735  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3668  putative GAF sensor protein  38.78 
 
 		 161 aa  94.4  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000365673  normal  0.0790972 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0402  diguanylate cyclase  31.71 
 
 		 866 aa  94.4  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.362695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2240  diguanylate cyclase  29.3 
 
 		 758 aa  94.4  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.365812 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0371  putative GAF sensor protein  40 
 
 		 177 aa  94  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.33263  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2333  hypothetical protein  30.36 
 
 		 565 aa  94  9e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3557  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.26 
 
 		 322 aa  94  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.457648  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1800  putative GAF sensor protein  43.59 
 
 		 152 aa  93.6  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0430664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3125  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.31 
 
 		 712 aa  93.6  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7005  GGDEF family protein  36.77 
 
 		 568 aa  93.6  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1511  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.5 
 
 		 557 aa  93.6  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00005186  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1484  diguanylate cyclase  34.08 
 
 		 615 aa  94  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2722  putative GAF sensor protein  46.85 
 
 		 159 aa  94  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1746  putative GAF sensor protein  37.84 
 
 		 152 aa  93.6  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.698368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3625  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.26 
 
 		 322 aa  94  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0894  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  30 
 
 		 482 aa  93.6  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156047 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1776  putative GAF sensor protein  37.84 
 
 		 152 aa  93.6  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0635695  normal  0.0905724 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2785  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.76 
 
 		 648 aa  92.8  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1264  diguanylate cyclase  35.54 
 
 		 512 aa  92.8  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.417106 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1471  diguanylate cyclase  31.84 
 
 		 439 aa  92.8  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3473  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.7 
 
 		 351 aa  93.2  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>