168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1139 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1139  GAF domain-containing protein  100 
 
 		 169 aa  346  8e-95  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.718876  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0827  hypothetical protein  67.07 
 
 		 165 aa  204  6e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.828364  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2508  GAF domain-containing protein  56.36 
 
 		 162 aa  174  4e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2019  GAF domain-containing protein  47.17 
 
 		 171 aa  156  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2722  putative GAF sensor protein  48.7 
 
 		 159 aa  148  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3325  GAF domain-containing protein  51.03 
 
 		 159 aa  147  8e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.10653  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4788  hypothetical protein  48.97 
 
 		 159 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00635993  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4771  hypothetical protein  48.97 
 
 		 159 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4762  hypothetical protein  48.97 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.01469  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4790  hypothetical protein  48.97 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4552  hypothetical protein  48.97 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4387  hypothetical protein  48.97 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4397  hypothetical protein  48.97 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4905  hypothetical protein  48.97 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0473  hypothetical protein  48.97 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.253939  hitchhiker  3.4768e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4483  putative GAF sensor protein  48.28 
 
 		 159 aa  141  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1784  GAF domain protein  48.99 
 
 		 160 aa  141  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1486  hypothetical protein  47.97 
 
 		 160 aa  140  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1925  GAF domain-containing protein  45.7 
 
 		 160 aa  140  7e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000712217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1452  hypothetical protein  48.99 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.944894  normal  0.188383 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1877  GAF domain-containing protein  48.32 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.187928 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1720  GAF domain-containing protein  48.25 
 
 		 152 aa  136  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000034795  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0097  putative GAF sensor protein  45.58 
 
 		 147 aa  136  1e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.060889 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1774  hypothetical protein  46.85 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00245693  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3838  GAF domain-containing protein  48.32 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.220762  normal  0.353602 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1809  GAF domain-containing protein  46.85 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000874323  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1933  putative GAF sensor protein  47.55 
 
 		 152 aa  137  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1282  GAF domain-containing protein  46.85 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000115739  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0475  GAF domain-containing protein  48.61 
 
 		 152 aa  135  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000747602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4000  sensor protein  46.21 
 
 		 162 aa  134  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6399  putative GAF sensor protein  46.26 
 
 		 163 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.568608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1106  hypothetical protein  45.91 
 
 		 192 aa  134  9e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124108  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3834  putative GAF sensor protein  46.21 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.385875  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0464  putative GAF sensor protein  46.31 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000576778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1276  putative sensor with GAF domain  44.67 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1208 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2230  putative GAF sensor protein  48.23 
 
 		 154 aa  132  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149787  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0717  putative GAF sensor protein  49.34 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0820  putative GAF sensor protein  42 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.180323 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1800  putative GAF sensor protein  44.97 
 
 		 152 aa  131  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0430664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3977  sensor protein  46.31 
 
 		 160 aa  130  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.911623 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3274  sensor protein  44.67 
 
 		 166 aa  131  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.622071 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2131  putative GAF sensor protein  47.52 
 
 		 152 aa  131  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00114775  normal  0.0484243 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3610  hypothetical protein  50.37 
 
 		 160 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0239404  normal  0.514803 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1913  putative GAF sensor protein  50.37 
 
 		 160 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0613802  normal  0.650392 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2204  putative GAF sensor protein  48.94 
 
 		 152 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.707038  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2117  putative GAF sensor protein  47.52 
 
 		 165 aa  130  7.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00785932  hitchhiker  0.000244904 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1745  GAF domain-containing protein  44 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1583  GAF domain-containing protein  44.22 
 
 		 153 aa  128  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.705571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1746  putative GAF sensor protein  48.23 
 
 		 152 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.698368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1776  putative GAF sensor protein  48.23 
 
 		 152 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0635695  normal  0.0905724 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1902  putative GAF sensor protein  48.94 
 
 		 152 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.044127  normal  0.123566 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2879  hypothetical protein  44 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1671  putative GAF sensor protein  47.52 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000389411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2823  hypothetical protein  44 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1775  hypothetical protein  44 
 
 		 170 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2452  hypothetical protein  44 
 
 		 170 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2829  hypothetical protein  44 
 
 		 170 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0190862  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1826  GAF domain-containing protein  42.47 
 
 		 148 aa  125  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2485  putative GAF sensor protein  45.71 
 
 		 159 aa  125  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000612704  normal  0.330047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4732  gafA; GAF domain-containing protein  43.24 
 
 		 159 aa  125  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.264042  decreased coverage  0.000031438 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1028  putative GAF sensor protein  40.99 
 
 		 167 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519451  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2764  hypothetical protein  44 
 
 		 202 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0826735  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2603  hypothetical protein  46.1 
 
 		 152 aa  124  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2442  putative GAF sensor protein  48.94 
 
 		 152 aa  124  5e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.229254  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2562  putative GAF sensor protein  48.94 
 
 		 152 aa  124  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.408148  normal  0.0780392 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0130  putative GAF sensor protein  41.26 
 
 		 160 aa  124  6e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4262  putative GAF sensor protein  42.21 
 
 		 167 aa  124  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1542  hypothetical protein  43.26 
 
 		 150 aa  124  7e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1032  putative GAF sensor protein  40.99 
 
 		 167 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.936669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3668  putative GAF sensor protein  38.99 
 
 		 161 aa  124  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000365673  normal  0.0790972 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2076  putative GAF sensor protein  42.86 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.924433  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2040  gafA; GAF domain-containing protein  43.87 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.102086  hitchhiker  0.00649969 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1851  putative GAF sensor protein  43.23 
 
 		 168 aa  123  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.181642  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0671  putative GAF sensor protein  40.99 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1150  putative GAF sensor protein  40.99 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2155  putative GAF sensor protein  41.83 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0330363  normal  0.417247 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1126  putative GAF sensor protein  40.99 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00168904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0178  putative GAF sensor protein  43.15 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.343183  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2449  putative GAF sensor protein  47.59 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.580676  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1990  putative GAF sensor protein  41.96 
 
 		 154 aa  122  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0273929  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003429  free methionine-(R)-sulfoxide reductase fRMsr  45 
 
 		 157 aa  121  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000333189  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2139  putative GAF sensor protein  42.58 
 
 		 168 aa  121  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02348  hypothetical protein  43.57 
 
 		 157 aa  121  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01999  GAF domain-containing protein  43.62 
 
 		 151 aa  121  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.130438  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19110  GAF domain-containing protein  48.92 
 
 		 162 aa  120  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000206028  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1670  hypothetical protein  45.32 
 
 		 165 aa  120  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000032114  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2665  hypothetical protein  45.32 
 
 		 165 aa  120  8e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000471553  normal  0.0325611 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1781  hypothetical protein  45.32 
 
 		 165 aa  120  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.222367  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2333  sensor protein  47.41 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0648081  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27570  GAF domain-containing protein  48.89 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.759844  decreased coverage  0.00184503 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4412  GAF domain-containing protein  38.56 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.122983  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07668  GAF domain nucleotide-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_2G01360)  36.05 
 
 		 190 aa  118  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.156532 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2111  GAF domain-containing protein  43.71 
 
 		 157 aa  117  6e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.779042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03142  possible Sensor with GAF domain  43.62 
 
 		 162 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1057  GAF domain-containing protein  44.06 
 
 		 174 aa  116  9.999999999999999e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.36357  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48539  predicted protein  36.36 
 
 		 177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.07066 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5928  GAF domain-containing protein  36.31 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1488  GAF domain-containing protein  43.97 
 
 		 150 aa  114  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320818  normal  0.116131 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1990  GAF domain protein  40.85 
 
 		 165 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00416581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2048  GAF domain-containing protein  40.85 
 
 		 165 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.325107  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>