More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0432 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0432  DNA primase  100 
 
 		 560 aa  1134    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.728386  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1030  DNA primase  50.45 
 
 		 530 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1344  DNA primase  42.88 
 
 		 565 aa  414  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0114942  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1342  DNA primase  42.88 
 
 		 565 aa  414  1e-114  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000143  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  44.48 
 
 		 539 aa  286  7e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  32.11 
 
 		 587 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0799  DNA primase  31.9 
 
 		 579 aa  281  2e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.7446  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  36.28 
 
 		 587 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  40.53 
 
 		 596 aa  274  3e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  40.21 
 
 		 617 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  39.24 
 
 		 595 aa  272  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  33.19 
 
 		 588 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  32.11 
 
 		 583 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  34.66 
 
 		 588 aa  265  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  32.04 
 
 		 582 aa  261  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  36.95 
 
 		 605 aa  258  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  37.44 
 
 		 601 aa  258  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  35.29 
 
 		 601 aa  257  5e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  35.62 
 
 		 598 aa  256  6e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  35.62 
 
 		 598 aa  256  6e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  35.62 
 
 		 598 aa  256  6e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  35.62 
 
 		 598 aa  256  6e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  35.62 
 
 		 598 aa  256  6e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  35.62 
 
 		 598 aa  256  7e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1531  DNA primase  39.84 
 
 		 535 aa  256  9e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  35.62 
 
 		 571 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  35.37 
 
 		 598 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  35.44 
 
 		 600 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  35.37 
 
 		 598 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0264  DNA primase  34.39 
 
 		 594 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.822275  normal  0.137236 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  40.85 
 
 		 646 aa  253  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  40.85 
 
 		 646 aa  253  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  39.13 
 
 		 613 aa  252  1e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  35.11 
 
 		 598 aa  249  7e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  33.41 
 
 		 604 aa  249  8e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  36.54 
 
 		 605 aa  249  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  36.54 
 
 		 605 aa  249  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  34.98 
 
 		 619 aa  248  2e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  37.81 
 
 		 703 aa  248  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  36.26 
 
 		 598 aa  247  4e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  38.12 
 
 		 584 aa  246  6e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  32.51 
 
 		 587 aa  246  8e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  37.53 
 
 		 614 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  36.36 
 
 		 595 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  39.51 
 
 		 577 aa  246  9.999999999999999e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5107  DNA primase  35.32 
 
 		 634 aa  246  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1835  DNA primase  31.8 
 
 		 623 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  34.34 
 
 		 645 aa  244  3e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  36.12 
 
 		 595 aa  243  5e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2387  DNA primase  36.1 
 
 		 565 aa  242  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2421  DNA primase  36.93 
 
 		 603 aa  242  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  36.64 
 
 		 600 aa  242  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  32.72 
 
 		 592 aa  241  2e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0023  DNA primase  37.27 
 
 		 550 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2028  DNA primase  32.6 
 
 		 603 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  32.37 
 
 		 598 aa  241  4e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3686  DNA primase  33.33 
 
 		 636 aa  240  4e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1345  DNA primase  30.56 
 
 		 595 aa  240  5e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  37.47 
 
 		 599 aa  240  5e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  32.61 
 
 		 578 aa  239  5.999999999999999e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2282  DNA primase  31.56 
 
 		 578 aa  239  8e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2309  DNA primase  38.2 
 
 		 577 aa  239  1e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1502  DNA primase  37.25 
 
 		 583 aa  238  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00809258  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0735  DNA primase  39.08 
 
 		 675 aa  238  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0733  hypothetical protein  31.67 
 
 		 593 aa  236  6e-61  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0659  DNA primase  32.72 
 
 		 583 aa  235  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250836  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2561  DNA primase  37.5 
 
 		 598 aa  235  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296311 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1629  DNA primase  31.28 
 
 		 614 aa  235  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.332155  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1810  DNA primase  31.28 
 
 		 605 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  37.32 
 
 		 604 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1895  DNA primase  29.37 
 
 		 573 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.158344  normal  0.0137969 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1998  DNA primase  32.13 
 
 		 605 aa  234  3e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1978  DNA primase  37.8 
 
 		 552 aa  234  3e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  36.62 
 
 		 663 aa  234  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  33.33 
 
 		 664 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  36.74 
 
 		 651 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0806  DNA primase  33.02 
 
 		 655 aa  233  7.000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0702707 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  32.89 
 
 		 663 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  36.59 
 
 		 660 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0527  DNA primase  36.75 
 
 		 578 aa  233  9e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  32.16 
 
 		 599 aa  233  9e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  36.31 
 
 		 660 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3790  DNA primase  37.75 
 
 		 640 aa  232  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  33.5 
 
 		 676 aa  232  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  32.48 
 
 		 638 aa  232  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  36.19 
 
 		 652 aa  232  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  36.59 
 
 		 660 aa  232  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0887  DNA primase  36.04 
 
 		 604 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.612944  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  33.5 
 
 		 660 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2607  DNA primase  31.59 
 
 		 613 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.496345  normal  0.674189 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0044  DNA primase  30.03 
 
 		 574 aa  231  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.723286  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  35.73 
 
 		 582 aa  231  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0288  DNA primase  30.78 
 
 		 651 aa  231  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.375271  normal  0.0229545 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1261  DNA primase  34.99 
 
 		 588 aa  231  3e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  35.14 
 
 		 694 aa  231  4e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  36.26 
 
 		 684 aa  230  5e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07990  DNA primase, catalytic core  34.61 
 
 		 642 aa  230  5e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.160485 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  34.53 
 
 		 666 aa  230  5e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  36.03 
 
 		 660 aa  230  6e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  36.44 
 
 		 626 aa  229  8e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>