45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0296 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0296  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  100 
 
 		 484 aa  1001    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  44.89 
 
 		 648 aa  414  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4153  glucosylceramidase  49.15 
 
 		 472 aa  411  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450582  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2067  glycoside hydrolase family protein  43.68 
 
 		 480 aa  404  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0826948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5601  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  44.03 
 
 		 505 aa  395  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1106  glycoside hydrolase family protein  43.62 
 
 		 488 aa  386  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0729101  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6250  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  43.27 
 
 		 627 aa  387  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3590  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  40.52 
 
 		 486 aa  364  2e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00155681  hitchhiker  0.000521994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6736  glycoside hydrolase family 30  39.19 
 
 		 485 aa  333  4e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.338177 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2261  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  40.7 
 
 		 514 aa  331  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103038  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1566  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  41.85 
 
 		 474 aa  329  7e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3714  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  37.96 
 
 		 666 aa  329  8e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00391353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  40 
 
 		 634 aa  325  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3362  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  39.33 
 
 		 497 aa  316  7e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2994  glucosylceramidase  40.27 
 
 		 481 aa  303  4.0000000000000003e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389806  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4356  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  37.82 
 
 		 603 aa  302  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.641869  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5017  glycoside hydrolase family 30  35.19 
 
 		 484 aa  287  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000784671  normal  0.283576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  43.86 
 
 		 603 aa  286  8e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  36.88 
 
 		 647 aa  274  3e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  40 
 
 		 695 aa  268  1e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1516  glycoside hydrolase family 30  31.98 
 
 		 481 aa  256  6e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1268  glucosylceramidase  34.68 
 
 		 475 aa  247  3e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6735  glycoside hydrolase family 30  35.36 
 
 		 485 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.39769 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1563  glycoside hydrolase family protein  32.67 
 
 		 487 aa  239  8e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.361336  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04190  glycoside hydrolase family 30  34.83 
 
 		 445 aa  239  9e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0097  Glucosylceramidase  35.04 
 
 		 446 aa  238  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1562  glycoside hydrolase family protein  35.26 
 
 		 487 aa  226  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1287  glucosylceramidase  32.76 
 
 		 476 aa  225  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3404  glycoside hydrolase family protein  33.99 
 
 		 441 aa  218  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.316905  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0858  glycoside hydrolase family protein  31.63 
 
 		 445 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0445  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  29 
 
 		 501 aa  213  3.9999999999999995e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4708  O-Glycosyl hydrolase family 30  30.57 
 
 		 447 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.319201  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  33.18 
 
 		 982 aa  200  3.9999999999999996e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1833  O-glycosyl hydrolase  30.6 
 
 		 445 aa  165  2.0000000000000002e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3714  glycosy hydrolase family protein  29.72 
 
 		 567 aa  156  9e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.171767  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34530  O-glycosyl hydrolase  27.34 
 
 		 447 aa  155  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0928159  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54536  predicted protein  24.36 
 
 		 859 aa  116  8.999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  27.19 
 
 		 532 aa  101  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2134  Glucuronoarabinoxylan endo-1,4-beta-xylanase  26.04 
 
 		 413 aa  91.7  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.300272  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  23.11 
 
 		 726 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  24.57 
 
 		 688 aa  88.6  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04558  xylanase  24.52 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.992142  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  22.22 
 
 		 982 aa  58.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  26.26 
 
 		 630 aa  52.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  25.26 
 
 		 629 aa  49.7  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>