100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0931 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0931  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 
130 aa  267  4e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4566  Fur family transcriptional regulator protein  39.02 
 
 
136 aa  92  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5541  ferric uptake regulator, Fur family  35.77 
 
 
138 aa  80.9  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.713771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0533  ferric uptake regulator, Fur family  34.17 
 
 
141 aa  79.7  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3496  ferric uptake regulator, Fur family  30.83 
 
 
152 aa  79.7  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3379  ferric uptake regulator, Fur family  31.54 
 
 
175 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3702  ferric uptake regulator, Fur family  31.54 
 
 
175 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2512  ferric uptake regulator family protein  28.68 
 
 
201 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.450617  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1233  ferric uptake regulator family protein  35.43 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0128  ferric uptake regulator family protein  30.3 
 
 
169 aa  72  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.1335 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2685  ferric uptake regulator family protein  30.4 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0992523 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1604  putative transcription regulator protein  26.92 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000436344  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0164  putative transcription regulator protein  28.03 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1930  ferric uptake regulator, Fur family  28 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0048  putative transcription regulator protein  28.46 
 
 
172 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0025  ferric uptake regulator family protein  32.82 
 
 
149 aa  63.5  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344249  normal  0.157034 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1183  ferric uptake regulator, Fur family  28.68 
 
 
158 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.837957 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1467  transcriptional regulator, Fur family  28.68 
 
 
158 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11678  putative transcription regulator  29.27 
 
 
137 aa  62  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0519  ferric uptake regulator family protein  28.57 
 
 
135 aa  61.2  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.639512  normal  0.494415 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2141  ferric uptake regulator family protein  27.07 
 
 
137 aa  57  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2211  ferric uptake regulator family protein  32.82 
 
 
150 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.395667  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0546  ferric uptake regulator family protein  30 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4179  ferric uptake regulator family protein  28.46 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.458354  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3018  ferric uptake regulator, Fur family  30.16 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0481144  normal  0.294593 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3951  ferric uptake regulator family protein  25.17 
 
 
165 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.781008  normal  0.0311151 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1125  FUR family transcriptional regulator  27.69 
 
 
145 aa  49.7  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.858412  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3601  ferric uptake regulator, Fur family  28.99 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0116  ferric uptake regulator, Fur family  28.68 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.241411 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3535  ferric uptake regulator, Fur family  27.54 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1030  FUR family transcriptional regulator  27.69 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.718199  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1728  ferric uptake regulator family protein  27.69 
 
 
164 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.597021 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0734  ferric uptake regulator family protein  24.82 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000194517  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0747  ferric-uptake regulator  27.56 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0132  ferric-uptake regulator  24.47 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4742  ferric uptake regulator, Fur family  27.27 
 
 
154 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1144  ferric uptake regulator family protein  25.37 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0515  ferric uptake regulator, Fur family  27.82 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3640  hypothetical protein  28.57 
 
 
155 aa  47.8  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2381  putative ferric uptake regulator, Fur family  24.06 
 
 
132 aa  47.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.972498  normal  0.534577 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1772  ferric uptake regulator, Fur family  25.58 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.431388  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2715  zinc uptake transcriptional regulator protein, Fur family  24.06 
 
 
132 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0294  ferric uptake regulator, Fur family  27.61 
 
 
170 aa  46.6  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.774382  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4496  ferric uptake regulator family protein  26.32 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1934  zinc uptake regulator  25 
 
 
135 aa  45.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395595  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13391  hypothetical protein  28.36 
 
 
186 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  25 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0059  zinc uptake regulation protein, putative  27.01 
 
 
162 aa  45.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3054  ferric uptake regulator, Fur family  25.76 
 
 
157 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0060  zinc uptake regulation protein, putative  28.68 
 
 
160 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0297  ferric uptake regulator family protein  30.3 
 
 
159 aa  45.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0684  ferric uptake regulator family protein  27.82 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564127  normal  0.74996 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1713  FUR family transcriptional regulator  24.62 
 
 
136 aa  44.3  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0366911  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3775  ferric uptake regulator family protein  25 
 
 
163 aa  44.7  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2432  ferric uptake regulator, Fur family  27.66 
 
 
156 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00932127  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1145  ferric uptake regulator family protein  21.43 
 
 
168 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0119  FUR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.723813  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2638  zinc uptake regulator  27.13 
 
 
154 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2095  ferric uptake regulator family protein  29.1 
 
 
166 aa  43.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.509153  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0276  zinc uptake regulation protein, putative  30.85 
 
 
160 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2983  ferric uptake regulator family protein  28.06 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.319363  normal  0.752016 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2424  ferric-uptake regulator  25.19 
 
 
163 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.688654  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2813  ferric uptake regulator family protein  31.87 
 
 
167 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.162605  normal  0.605747 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1729  ferric uptake regulator family protein  23.13 
 
 
164 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0738  ferric uptake regulator family protein  26.67 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.376687  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00840  zinc uptake transcriptional regulator, Fur family  25.56 
 
 
161 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0092  metallo-beta-lactamase family protein  27.05 
 
 
119 aa  43.5  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.019878  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72560  transcriptional regulator np20  25.93 
 
 
167 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640017  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1677  ferric uptake regulator family protein  19.21 
 
 
210 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.531485  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1795  SsrA-binding protein  26.83 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.248367  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0136  ferric uptake regulator family protein  26.67 
 
 
161 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1694  ferric uptake regulator family protein  25.56 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.924713  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3820  ferric uptake regulator family protein  22.96 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.396621  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1445  FUR family transcriptional regulator  23.85 
 
 
136 aa  42  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0423256  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2705  ferric uptake regulator, Fur family  25.58 
 
 
139 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.344666 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0184  ferric uptake regulator, Fur family  24.39 
 
 
143 aa  42  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.567959  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0352  ferric uptake regulator, Fur family  26.67 
 
 
131 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0134  ferric uptake regulator family protein  27.27 
 
 
161 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74995  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1974  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase, subtype 1  28.36 
 
 
155 aa  41.6  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1469  ferric uptake regulator, Fur family  23.85 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0185274  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2054  ferric uptake regulator family protein  24.3 
 
 
181 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5267  zinc uptake regulation protein, putative  29.79 
 
 
160 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07451  ferric uptake regulator family protein  24.44 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0979772 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0621  putative ferric uptake regulator, Fur family  24.81 
 
 
155 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.776664  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2373  ferric uptake regulator, Fur family  29.67 
 
 
154 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000416204 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3007  ferric uptake regulator, Fur family  25.78 
 
 
143 aa  41.2  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2668  ferric uptake regulator family protein  26.77 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0237  Fur family ferric uptake regulator  24.82 
 
 
161 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0939  ferric uptake regulator family protein  23.44 
 
 
158 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3648  ferric uptake regulator family protein  23.81 
 
 
133 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0129314  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1138  ferric uptake regulator, Fur family  27.42 
 
 
143 aa  40.8  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716078  normal  0.825565 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2188  transcriptional regulator Fur family  20.98 
 
 
133 aa  40.8  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0800466  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  21.8 
 
 
152 aa  40.8  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1143  ferric uptake regulator, Fur family  30.77 
 
 
150 aa  40.8  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000124537  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0387  zinc uptake regulation protein  27.27 
 
 
149 aa  40.8  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.183946  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  21.8 
 
 
152 aa  40.4  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21120  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  25.19 
 
 
139 aa  40.4  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07800  zinc uptake regulator, Fur family  23.26 
 
 
148 aa  40  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2360  ferric uptake regulator family protein  28.12 
 
 
156 aa  40  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.930624  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13650  zinc uptake regulator, Fur family  28.09 
 
 
136 aa  40  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.357837 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>