263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3379 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3379  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 		 175 aa  353  5e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3702  ferric uptake regulator, Fur family  97.71 
 
 		 175 aa  343  5e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0048  putative transcription regulator protein  83.43 
 
 		 172 aa  268  4e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0164  putative transcription regulator protein  54.17 
 
 		 172 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0128  ferric uptake regulator family protein  57.24 
 
 		 169 aa  171  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.1335 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1233  ferric uptake regulator family protein  39.86 
 
 		 147 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2512  ferric uptake regulator family protein  36.6 
 
 		 201 aa  108  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.450617  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3496  ferric uptake regulator, Fur family  47.18 
 
 		 152 aa  107  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1467  transcriptional regulator, Fur family  39.87 
 
 		 158 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1183  ferric uptake regulator, Fur family  39.87 
 
 		 158 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.837957 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4566  Fur family transcriptional regulator protein  35 
 
 		 136 aa  85.1  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1604  putative transcription regulator protein  35.56 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000436344  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0025  ferric uptake regulator family protein  35.56 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344249  normal  0.157034 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0931  ferric uptake regulator family protein  31.54 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0533  ferric uptake regulator, Fur family  32.84 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1930  ferric uptake regulator, Fur family  30.65 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0621  putative ferric uptake regulator, Fur family  34.04 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.776664  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2685  ferric uptake regulator family protein  32.59 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0992523 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0116  ferric uptake regulator, Fur family  37.96 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.241411 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3018  ferric uptake regulator, Fur family  35.04 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0481144  normal  0.294593 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5541  ferric uptake regulator, Fur family  32.84 
 
 		 138 aa  70.5  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.713771 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2211  ferric uptake regulator family protein  37.41 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.395667  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3640  hypothetical protein  34.94 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0747  ferric-uptake regulator  31.78 
 
 		 152 aa  63.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1728  ferric uptake regulator family protein  31.65 
 
 		 164 aa  63.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.597021 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0438  ferric uptake regulation protein  35.66 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0414  ferric uptake regulation protein  35.66 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0734  ferric uptake regulator family protein  24.68 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000194517  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2623  ferric uptake regulation protein  30.61 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.376677  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11678  putative transcription regulator  28.68 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2813  ferric uptake regulator family protein  35.2 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.162605  normal  0.605747 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1411  ferric uptake regulator family protein  25.9 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1194  ferric-uptake regulator  34.46 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  31.16 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  25.87 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0132  ferric-uptake regulator  29.17 
 
 		 123 aa  53.5  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1481  ferric uptake regulator family protein  34.04 
 
 		 140 aa  53.9  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.268678  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0515  ferric uptake regulator, Fur family  23.74 
 
 		 142 aa  53.1  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3951  ferric uptake regulator family protein  30.52 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.781008  normal  0.0311151 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2141  ferric uptake regulator family protein  33.08 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3389  ferric uptake regulator family protein  30.07 
 
 		 145 aa  53.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.261962  normal  0.0261677 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13391  hypothetical protein  30.22 
 
 		 186 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1469  ferric uptake regulator, Fur family  30.77 
 
 		 130 aa  52.4  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0185274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3240  ferric uptake regulator family protein  30.94 
 
 		 148 aa  52.4  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000230922  hitchhiker  0.00191408 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07451  ferric uptake regulator family protein  31.34 
 
 		 148 aa  52  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0979772 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06641  ferric uptake regulator family protein  28.36 
 
 		 150 aa  52  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3272  ferric uptake regulator, Fur family  28.87 
 
 		 138 aa  52  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.710175  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0059  zinc uptake regulation protein, putative  27.7 
 
 		 162 aa  51.6  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0519  ferric uptake regulator family protein  35 
 
 		 135 aa  52  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.639512  normal  0.494415 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2053  ferric-uptake regulator  29.61 
 
 		 201 aa  51.6  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3924  ferric uptake regulator family protein  28.87 
 
 		 149 aa  51.6  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07031  ferric uptake regulator family protein  27.41 
 
 		 150 aa  52  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0821588  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36340  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  32 
 
 		 151 aa  52  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06931  ferric uptake regulator family protein  28.36 
 
 		 150 aa  51.6  0.000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.247961  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6009  ferric uptake regulator family protein  28.28 
 
 		 155 aa  51.2  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.964976 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  24.14 
 
 		 152 aa  50.8  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2124  ferric uptake regulator, Fur family  31.51 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.506102  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2054  ferric uptake regulator family protein  34.86 
 
 		 181 aa  50.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24980  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  30.99 
 
 		 153 aa  50.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4555  ferric uptake regulator family protein  28.29 
 
 		 145 aa  50.4  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1145  ferric uptake regulator family protein  32.1 
 
 		 168 aa  50.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0247  ferric uptake transcriptional (FUR)-like transcription regulator protein  31.69 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.406535  normal  0.140515 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1451  ferric uptake regulation protein  32.41 
 
 		 155 aa  50.1  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000060196  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  31.94 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0637  ferric uptake regulator family protein  28.36 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.835222  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1648  ferric uptake regulator family protein  27.59 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.499744 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  32.64 
 
 		 144 aa  50.1  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1905  ferric uptake regulator family protein  31.94 
 
 		 140 aa  50.1  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1389  ferric uptake regulation protein  32.41 
 
 		 145 aa  50.1  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000498211  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3965  ferric uptake regulator, Fur family  31.69 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2050  ferric uptake regulator, Fur family  31.91 
 
 		 141 aa  49.3  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3365  ferric uptake regulator family protein  32.35 
 
 		 139 aa  49.3  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.019724  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2432  ferric uptake regulator, Fur family  30.83 
 
 		 156 aa  48.9  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00932127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  27.74 
 
 		 146 aa  48.5  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0768  iron ABC transporter  27.03 
 
 		 145 aa  48.9  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000612083  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0489  ferric uptake regulator family protein  33.58 
 
 		 167 aa  48.5  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.574052  normal  0.122535 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3367  ferric uptake regulator family protein  27.59 
 
 		 149 aa  48.5  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0734  zinc uptake transcriptional repressor  30 
 
 		 171 aa  48.5  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.660786  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0603  ferric uptake regulator family protein  26.39 
 
 		 138 aa  48.1  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.401566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1211  ferric uptake regulation protein  26.24 
 
 		 148 aa  48.1  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0179394  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004126  ferric uptake regulation protein FUR  30.94 
 
 		 149 aa  48.1  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2401  ferric uptake regulator, Fur family  29.05 
 
 		 141 aa  48.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  27.4 
 
 		 148 aa  47.8  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  27.4 
 
 		 148 aa  47.8  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0170  ferric uptake regulator, Fur family  29.63 
 
 		 139 aa  47.8  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4057  ferric uptake regulator, Fur family  30.28 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3292  FUR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 121 aa  47  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000231053  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4279  ferric uptake regulator, Fur family  26.28 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000762776  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4551  zinc uptake transcriptional repressor  30.6 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3944  ferric uptake regulator, Fur family  30.28 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  32.17 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0839  ferric-uptake regulator  32.35 
 
 		 143 aa  47.4  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3523  zinc uptake transcriptional repressor  30.88 
 
 		 169 aa  47.4  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01339  ferric uptake regulator  30.94 
 
 		 149 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1991  ferric uptake regulator family protein  31.11 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3982  zinc uptake transcriptional repressor  30.6 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.224982 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0077  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  28.38 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0967  ferric uptake regulator, Fur family  30.99 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.924679  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3503  ferric uptake regulator family protein  29.58 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.248398 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4286  zinc uptake transcriptional repressor  30.6 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>