More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3018 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3018  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 		 145 aa  295  1e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0481144  normal  0.294593 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0747  ferric-uptake regulator  42.86 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1183  ferric uptake regulator, Fur family  40.6 
 
 		 158 aa  89.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.837957 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1467  transcriptional regulator, Fur family  40.6 
 
 		 158 aa  89.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1233  ferric uptake regulator family protein  37.4 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0128  ferric uptake regulator family protein  37.78 
 
 		 169 aa  84  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.1335 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1930  ferric uptake regulator, Fur family  34.56 
 
 		 144 aa  84  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0164  putative transcription regulator protein  35.42 
 
 		 172 aa  83.6  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3496  ferric uptake regulator, Fur family  39.13 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2512  ferric uptake regulator family protein  30.71 
 
 		 201 aa  72  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.450617  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3379  ferric uptake regulator, Fur family  35.04 
 
 		 175 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3702  ferric uptake regulator, Fur family  35.04 
 
 		 175 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0025  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344249  normal  0.157034 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0048  putative transcription regulator protein  36.5 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4566  Fur family transcriptional regulator protein  29.79 
 
 		 136 aa  67  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0132  ferric-uptake regulator  28.8 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2859  ferric-uptake regulator  33.58 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.141734 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24980  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  38.06 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2211  ferric uptake regulator family protein  32.31 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.395667  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0533  ferric uptake regulator, Fur family  28.38 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1991  ferric uptake regulator family protein  31.85 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1728  ferric uptake regulator family protein  32.09 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.597021 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4742  ferric uptake regulator, Fur family  36.09 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3640  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  31.43 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0621  putative ferric uptake regulator, Fur family  33.08 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.776664  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  30.41 
 
 		 148 aa  60.1  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  30.41 
 
 		 148 aa  60.1  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2685  ferric uptake regulator family protein  27.34 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0992523 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  25.69 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0474  ferric uptake regulator family protein  36.28 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0116  ferric uptake regulator, Fur family  36.96 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.241411 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0939  ferric uptake regulator family protein  33.64 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  31.06 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  32.03 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21120  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  35.07 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  33.09 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0847  ferric uptake regulator, Fur family  29.27 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1188  ferric uptake regulator, Fur family  26.32 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4192  ferric uptake regulator, Fur family  35.71 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1144  ferric uptake regulator family protein  32.8 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  27.21 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  31.25 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  31.25 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  36.46 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  26.8 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2366  ferric uptake regulator family protein  31.53 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171245 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20420  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  33.83 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.375668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1604  putative transcription regulator protein  29.41 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000436344  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  31.62 
 
 		 144 aa  52.8  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0466  ferric uptake regulator family protein  30.08 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000190383  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2620  ferric uptake regulator, Fur family  32.32 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1879  ferric uptake regulator, Fur family  38.95 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00751157  normal  0.013308 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  30.15 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0468  ferric-uptake regulator  39.6 
 
 		 173 aa  52.8  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0931  ferric uptake regulator family protein  30.16 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2053  ferric-uptake regulator  31.29 
 
 		 201 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01070  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  34.48 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0294  ferric uptake regulator, Fur family  31.79 
 
 		 170 aa  52  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.774382  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0931  ferric uptake regulator family protein  33.03 
 
 		 151 aa  51.6  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3389  ferric uptake regulator family protein  30.23 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.261962  normal  0.0261677 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1905  ferric uptake regulator family protein  29.63 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0734  ferric uptake regulator family protein  23.45 
 
 		 155 aa  51.2  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000194517  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1995  ferric uptake regulator, Fur family  28.47 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.134138  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1389  ferric uptake regulation protein  36.08 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000498211  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0145  fur family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51439  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1123  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.488583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1451  ferric uptake regulation protein  36.08 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000060196  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3531  ferric uptake regulator, Fur family  28.26 
 
 		 132 aa  50.8  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4578  ferric uptake regulator, Fur family  28.28 
 
 		 166 aa  51.2  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.622664  normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  31.25 
 
 		 147 aa  50.8  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0314  ferric uptake regulator family protein  29.09 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0295931  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  25.35 
 
 		 152 aa  50.4  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0753  ferric uptake regulator family protein  35.34 
 
 		 144 aa  50.8  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3601  ferric uptake regulator, Fur family  29.58 
 
 		 144 aa  50.8  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0515  zinc uptake regulation protein  26.72 
 
 		 117 aa  50.8  0.000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0873  ferric uptake regulator, Fur family protein  34.34 
 
 		 142 aa  50.4  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3535  ferric uptake regulator, Fur family  29.58 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1641  FUR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 136 aa  50.4  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.600696  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2705  ferric uptake regulator, Fur family  34.29 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.344666 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11678  putative transcription regulator  24.31 
 
 		 137 aa  50.1  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0615  ferric uptake regulator, Fur family  27.54 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.12884  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0874  ferric-uptake regulator  35.78 
 
 		 146 aa  50.1  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.250116  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4803  ferric uptake regulator, Fur family  38.14 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1411  ferric uptake regulator family protein  22.06 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0519  ferric uptake regulator family protein  31.2 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.639512  normal  0.494415 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1230  FUR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0757057  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0515  ferric uptake regulator, Fur family  26.03 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2712  ferric uptake regulator family protein  34.51 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.673301 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0367  FUR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.596718  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1453  ferric uptake regulator, Fur family  31.63 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.023883  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2681  ferric uptake regulator family protein  34.51 
 
 		 195 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.445944  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2726  ferric uptake regulator family protein  34.51 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.20346 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  24.46 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1937  ferric uptake regulator, Fur family  33.8 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0166827  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36340  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  39.42 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3367  ferric uptake regulator family protein  28.97 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0603  ferric uptake regulator family protein  29.37 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.401566  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>