More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4192 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4192  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 		 141 aa  281  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0874  ferric-uptake regulator  76.47 
 
 		 146 aa  208  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.250116  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2159  ferric uptake regulator family protein  70.59 
 
 		 146 aa  203  7e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00488582 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1532  ferric uptake regulator family protein  72.06 
 
 		 174 aa  202  9e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0229059 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2714  ferric-uptake regulator  72.46 
 
 		 147 aa  201  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352648  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11938  ferric uptake regulation protein furA (fur)  71.43 
 
 		 150 aa  202  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2053  ferric-uptake regulator  69.34 
 
 		 201 aa  201  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2705  ferric uptake regulator, Fur family  71.97 
 
 		 139 aa  196  6e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.344666 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2983  ferric uptake regulator family protein  71.01 
 
 		 149 aa  196  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.319363  normal  0.752016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2681  ferric uptake regulator family protein  68.57 
 
 		 195 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.445944  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2726  ferric uptake regulator family protein  68.57 
 
 		 157 aa  194  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.20346 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2712  ferric uptake regulator family protein  68.57 
 
 		 157 aa  194  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.673301 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3452  ferric uptake regulator family protein  64.29 
 
 		 145 aa  189  8e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3814  ferric uptake regulator, Fur family  64.75 
 
 		 146 aa  183  7e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000136698  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3209  ferric uptake regulator family protein  63.31 
 
 		 147 aa  181  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.829925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3313  ferric uptake regulator, Fur family  65.22 
 
 		 146 aa  180  7e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.977689  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20420  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  64.75 
 
 		 140 aa  177  4.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.375668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0294  ferric uptake regulator, Fur family  65.12 
 
 		 170 aa  176  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.774382  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21120  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  61.07 
 
 		 139 aa  175  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22450  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  66.15 
 
 		 159 aa  171  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1102  ferric uptake regulator, Fur family  56.83 
 
 		 140 aa  170  6.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.387055  normal  0.912899 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0738  ferric uptake regulator family protein  63.43 
 
 		 142 aa  167  6e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.376687  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0145  fur family transcriptional regulator  62.31 
 
 		 140 aa  166  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51439  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0684  ferric uptake regulator family protein  63.43 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564127  normal  0.74996 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2124  ferric uptake regulator, Fur family  58.96 
 
 		 157 aa  163  5.9999999999999996e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.506102  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4454  ferric uptake regulator, Fur family  63.5 
 
 		 147 aa  163  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1879  ferric uptake regulator, Fur family  60.61 
 
 		 139 aa  163  8e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00751157  normal  0.013308 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1623  ferric uptake regulator, Fur family  62.41 
 
 		 137 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0839  ferric-uptake regulator  61.54 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3965  ferric uptake regulator, Fur family  56.93 
 
 		 138 aa  160  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4803  ferric uptake regulator, Fur family  63.78 
 
 		 154 aa  160  6e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0468  ferric-uptake regulator  54.74 
 
 		 173 aa  159  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0518  ferric ion uptake regulator  58.33 
 
 		 139 aa  158  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01070  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  59.23 
 
 		 142 aa  157  5e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2725  ferric uptake regulator, Fur family  60.16 
 
 		 152 aa  155  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122956  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36340  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  60.63 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2095  ferric uptake regulator family protein  61.07 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.509153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24980  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  57.78 
 
 		 153 aa  154  4e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0237  Fur family ferric uptake regulator  61.24 
 
 		 161 aa  153  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1937  ferric uptake regulator, Fur family  57.25 
 
 		 137 aa  147  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0166827  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0866  ferric uptake regulator, Fur family  55.64 
 
 		 154 aa  140  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0758878  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3239  ferric uptake regulator, Fur family  54.69 
 
 		 173 aa  138  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0517924 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5253  ferric uptake regulator family protein  66.02 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3077  ferric uptake regulator family protein  51.49 
 
 		 155 aa  134  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4885  ferric uptake regulator family protein  67.37 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0503467  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4974  ferric uptake regulator family protein  67.37 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2781  ferric uptake regulator, Fur family  49.25 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.028886 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4279  ferric uptake regulator, Fur family  46.97 
 
 		 183 aa  120  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000762776  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2141  ferric uptake regulator family protein  40.94 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1143  ferric uptake regulator, Fur family  30.83 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000124537  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2668  ferric uptake regulator family protein  32.58 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  28.36 
 
 		 138 aa  73.6  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3240  ferric uptake regulator family protein  36.09 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000230922  hitchhiker  0.00191408 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0726  ferric uptake regulator, Fur family  35.2 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.787789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2524  ferric uptake regulator, Fur family  32.03 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.568134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0122  ferric uptake regulation protein  31.78 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00816522  normal  0.910281 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  30.88 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1648  ferric uptake regulator family protein  34.06 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.499744 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3662  ferric uptake regulator, Fur family  30.08 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3769  ferric uptake regulator, Fur family  30.08 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  28.46 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  28.46 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  28.46 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  28.46 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  28.46 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  28.79 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  28.46 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  28.46 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  28.46 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2366  ferric uptake regulator, Fur family  34.13 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.437919 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0734  ferric uptake regulator family protein  26.09 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000194517  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0105  ferric uptake regulator family protein  29.41 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.013681  normal  0.263297 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3292  FUR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000231053  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  29.77 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2145  ferric-uptake regulator  29.71 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0418  ferric-uptake regulator  25.93 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00383086  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  28.47 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4251  FUR family nickel uptake regulator  31.16 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0966436  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  28.68 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0438  ferric uptake regulation protein  31.85 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0414  ferric uptake regulation protein  31.85 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0061  FUR family nickel uptake regulator  32.85 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2620  ferric uptake regulator, Fur family  33.02 
 
 		 164 aa  63.5  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3278  ferric uptake regulator, Fur family  30.65 
 
 		 149 aa  63.5  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.351465 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4099  ferric uptake regulator family protein  31.91 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0347  ferric uptake regulator, Fur family  29.58 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2513  ferric uptake regulator, Fur family  32.59 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275348  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0406  ferric uptake regulator, Fur family  25.56 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1597  ferric uptake regulator, Fur family  31.58 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1388  ferric uptake regulator, Fur family  32.26 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00327608  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0149  ferric uptake regulator, Fur family  28.7 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000946287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0375  ferric uptake regulator family protein  30.94 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  28.12 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1966  ferric uptake regulator family protein  28.57 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00359557  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  28.79 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1982  ferric uptake regulator family protein  35 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  28.79 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>