More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4279 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4279  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 
183 aa  365  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000762776  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0468  ferric-uptake regulator  43.1 
 
 
173 aa  140  9e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2983  ferric uptake regulator family protein  50.7 
 
 
149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.319363  normal  0.752016 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11938  ferric uptake regulation protein furA (fur)  48.59 
 
 
150 aa  134  5e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01070  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  51.11 
 
 
142 aa  130  7.999999999999999e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1532  ferric uptake regulator family protein  42.26 
 
 
174 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0229059 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3965  ferric uptake regulator, Fur family  49.26 
 
 
138 aa  130  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0738  ferric uptake regulator family protein  50 
 
 
142 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.376687  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0294  ferric uptake regulator, Fur family  48.51 
 
 
170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.774382  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3452  ferric uptake regulator family protein  44.22 
 
 
145 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604214  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2705  ferric uptake regulator, Fur family  46.43 
 
 
139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.344666 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3209  ferric uptake regulator family protein  46.32 
 
 
147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.829925  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2053  ferric-uptake regulator  45.77 
 
 
201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4192  ferric uptake regulator, Fur family  46.97 
 
 
141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0684  ferric uptake regulator family protein  48.51 
 
 
142 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564127  normal  0.74996 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0839  ferric-uptake regulator  47.01 
 
 
143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0518  ferric ion uptake regulator  48.85 
 
 
139 aa  125  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1879  ferric uptake regulator, Fur family  47.45 
 
 
139 aa  124  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00751157  normal  0.013308 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2124  ferric uptake regulator, Fur family  44.59 
 
 
157 aa  123  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.506102  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0145  fur family transcriptional regulator  47.45 
 
 
140 aa  124  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51439  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2681  ferric uptake regulator family protein  44.83 
 
 
195 aa  123  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.445944  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2712  ferric uptake regulator family protein  44.22 
 
 
157 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.673301 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36340  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  48.46 
 
 
151 aa  122  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2726  ferric uptake regulator family protein  44.22 
 
 
157 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20346 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20420  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  47.01 
 
 
140 aa  121  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.375668  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3313  ferric uptake regulator, Fur family  45.99 
 
 
146 aa  120  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.977689  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1623  ferric uptake regulator, Fur family  48.2 
 
 
137 aa  120  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1102  ferric uptake regulator, Fur family  42.14 
 
 
140 aa  120  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.387055  normal  0.912899 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2095  ferric uptake regulator family protein  47.06 
 
 
166 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.509153  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2159  ferric uptake regulator family protein  43.97 
 
 
146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00488582 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4454  ferric uptake regulator, Fur family  48.59 
 
 
147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2725  ferric uptake regulator, Fur family  45.71 
 
 
152 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122956  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0237  Fur family ferric uptake regulator  42.57 
 
 
161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4803  ferric uptake regulator, Fur family  45.31 
 
 
154 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2714  ferric-uptake regulator  44.37 
 
 
147 aa  118  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352648  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22450  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  41.78 
 
 
159 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3239  ferric uptake regulator, Fur family  44.97 
 
 
173 aa  118  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0517924 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3814  ferric uptake regulator, Fur family  41.79 
 
 
146 aa  117  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000136698  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21120  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  43.41 
 
 
139 aa  117  9e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0874  ferric-uptake regulator  45.8 
 
 
146 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.250116  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0866  ferric uptake regulator, Fur family  46.15 
 
 
154 aa  115  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0758878  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24980  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  42.57 
 
 
153 aa  114  8.999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5253  ferric uptake regulator family protein  48.7 
 
 
158 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1937  ferric uptake regulator, Fur family  40.6 
 
 
137 aa  99.4  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0166827  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4885  ferric uptake regulator family protein  49.44 
 
 
108 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0503467  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4974  ferric uptake regulator family protein  49.44 
 
 
108 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2781  ferric uptake regulator, Fur family  39.39 
 
 
164 aa  89.4  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.028886 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3077  ferric uptake regulator family protein  37.69 
 
 
155 aa  87.4  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2141  ferric uptake regulator family protein  40.16 
 
 
137 aa  73.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  31.85 
 
 
138 aa  70.5  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0282  ferric uptake regulation protein  26.71 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0458  ferric uptake regulator, Fur family  26.71 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000485327 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  21.64 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  29.77 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0529  ferric uptake regulator, Fur family  26.67 
 
 
143 aa  64.3  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000605392  normal  0.102669 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  27.54 
 
 
150 aa  63.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2623  ferric uptake regulation protein  28.26 
 
 
143 aa  63.5  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.376677  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  27.82 
 
 
144 aa  62.8  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1405  ferric uptake regulator family protein  30.53 
 
 
137 aa  62.8  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  22.86 
 
 
146 aa  62.4  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0375  ferric uptake regulator family protein  31.39 
 
 
143 aa  62  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  27.91 
 
 
148 aa  61.6  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  27.91 
 
 
148 aa  61.6  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6009  ferric uptake regulator family protein  29.45 
 
 
155 aa  61.2  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.964976 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0312  ferric uptake regulator family protein  31.16 
 
 
174 aa  61.6  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  27.54 
 
 
150 aa  61.2  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2259  ferric uptake regulator, Fur family  29.37 
 
 
154 aa  61.2  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  26.87 
 
 
144 aa  61.2  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  26.87 
 
 
144 aa  61.2  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  26.87 
 
 
144 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  26.87 
 
 
142 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  26.87 
 
 
144 aa  61.2  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  26.87 
 
 
142 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  26.87 
 
 
142 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2798  Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins  31.85 
 
 
146 aa  60.5  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.1309500000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  27.07 
 
 
144 aa  60.8  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  26.87 
 
 
142 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  26.87 
 
 
142 aa  60.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  26.87 
 
 
142 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  26.87 
 
 
143 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3272  ferric uptake regulator, Fur family  31.11 
 
 
138 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.710175  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4610  ferric uptake regulator family protein  26.03 
 
 
181 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  31.82 
 
 
142 aa  60.1  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2668  ferric uptake regulator family protein  26 
 
 
146 aa  60.1  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3791  ferric uptake regulator family protein  25.85 
 
 
152 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3924  ferric uptake regulator family protein  31.11 
 
 
149 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1279  transcriptional regulator, Fur family  28.35 
 
 
141 aa  59.3  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000471651  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4555  ferric uptake regulator family protein  29.08 
 
 
145 aa  59.3  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1389  ferric uptake regulation protein  28.36 
 
 
145 aa  58.9  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000498211  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2050  ferric uptake regulator, Fur family  26.62 
 
 
141 aa  58.5  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1451  ferric uptake regulation protein  28.36 
 
 
155 aa  58.5  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000060196  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0406  ferric uptake regulator, Fur family  25.38 
 
 
139 aa  58.2  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0365  ferric uptake regulator, Fur family  29.41 
 
 
150 aa  58.2  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3627  ferric uptake regulator family protein  30.08 
 
 
139 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1295  ferric uptake regulator family protein  29.13 
 
 
141 aa  57.8  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000494544  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1905  ferric uptake regulator family protein  27.69 
 
 
140 aa  57.8  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4185  ferric uptake regulator, Fur family  27.34 
 
 
139 aa  57.8  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.421488  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  27.91 
 
 
150 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0967  ferric uptake regulator, Fur family  25.98 
 
 
142 aa  57.4  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.924679  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1453  ferric uptake regulator, Fur family  34.27 
 
 
151 aa  57.4  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.023883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>