More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1398 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  100 
 
 		 150 aa  314  3e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  88.51 
 
 		 148 aa  285  2e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  88.51 
 
 		 148 aa  285  2e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  73.43 
 
 		 150 aa  231  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  69.72 
 
 		 150 aa  225  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  63.77 
 
 		 142 aa  199  9e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  63.04 
 
 		 144 aa  197  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  63.04 
 
 		 144 aa  197  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  63.04 
 
 		 144 aa  197  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  63.04 
 
 		 142 aa  197  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  63.04 
 
 		 144 aa  197  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  63.04 
 
 		 142 aa  197  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  63.77 
 
 		 143 aa  198  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  63.04 
 
 		 142 aa  197  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  63.04 
 
 		 142 aa  197  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  63.04 
 
 		 142 aa  197  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4078  ferric uptake regulator, Fur family  52.27 
 
 		 144 aa  152  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000739269  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  41.43 
 
 		 166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  37.68 
 
 		 142 aa  124  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08960  ferric uptake regulator, Fur family  41.86 
 
 		 134 aa  123  7e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1300  ferric uptake regulator family protein  40.14 
 
 		 151 aa  123  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0391  FUR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0543  ferric uptake regulator, Fur family  41.94 
 
 		 139 aa  120  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.70942 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0768  iron ABC transporter  40.74 
 
 		 145 aa  117  3.9999999999999996e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000612083  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0101  ferric uptake regulator, Fur family  39.84 
 
 		 139 aa  115  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133113  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1241  ferric uptake regulator, Fur family  38.69 
 
 		 170 aa  114  6e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00903138 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0754  ferric uptake regulator family protein  37.1 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.354602  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  38.17 
 
 		 146 aa  111  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0149  ferric uptake regulator, Fur family  38.71 
 
 		 139 aa  111  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000946287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0822  ferric uptake regulator family protein  40.65 
 
 		 126 aa  110  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000300093  normal  0.0104511 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0153  ferric uptake regulator, Fur family  37.98 
 
 		 139 aa  110  7.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000104646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0135  ferric uptake regulator, Fur family  37.4 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000297915  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2644  ferric uptake regulator family protein  35.77 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1722  ferric uptake regulator family protein  39.55 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.907916 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1966  ferric uptake regulator family protein  35.86 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1230  FUR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 139 aa  104  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0757057  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0584  ferric uptake regulator family protein  36.03 
 
 		 149 aa  102  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.274905  normal  0.220198 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4185  ferric uptake regulator, Fur family  32.12 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.421488  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4160  FUR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4001  FUR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000832394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3832  FUR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3848  FUR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000844204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4115  transcriptional regulator, Fur family  33.1 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5116299999999997e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4313  FUR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4224  transcriptional regulator, Fur family  33.1 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00546613  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1420  FUR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 139 aa  101  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0522352  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2513  ferric uptake regulator, Fur family  38.89 
 
 		 137 aa  100  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275348  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0931  ferric uptake regulator family protein  33.57 
 
 		 151 aa  100  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  29.66 
 
 		 146 aa  100  9e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3531  ferric uptake regulator, Fur family  35.43 
 
 		 132 aa  100  9e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  33.33 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3674  ferric uptake regulator family protein  41.13 
 
 		 129 aa  99.4  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2790  ferric uptake regulator family protein  32.41 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000512773  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  32.17 
 
 		 147 aa  99.4  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1036  transcriptional regulator, Fur family  32.41 
 
 		 151 aa  99  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0163253  normal  0.210334 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  31.33 
 
 		 154 aa  99  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4201  transcriptional regulator, Fur family  32.41 
 
 		 151 aa  99  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0217905  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0365  ferric uptake regulator, Fur family  31.62 
 
 		 150 aa  98.2  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3922  ferric uptake regulator family protein  32.41 
 
 		 151 aa  98.6  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000572819  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  32.03 
 
 		 143 aa  97.8  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2198  ferric uptake regulator, Fur family  35.77 
 
 		 169 aa  97.8  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  31.39 
 
 		 149 aa  97.4  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  31.39 
 
 		 149 aa  97.4  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0347  ferric uptake regulator, Fur family  35.42 
 
 		 149 aa  97.1  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1806  ferric uptake regulator family protein  33.86 
 
 		 141 aa  97.1  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.696064  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2798  Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins  31.65 
 
 		 146 aa  97.1  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.1309500000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0141  ferric uptake regulator, Fur family  40.32 
 
 		 133 aa  96.3  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.896296  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  32.28 
 
 		 143 aa  96.7  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0844  ferric uptake regulator, Fur family  36.3 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000126283  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  30 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1792  ferric uptake regulator, Fur family  31.62 
 
 		 150 aa  96.7  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000306351  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2809  FUR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 152 aa  95.5  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.110848  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  30.71 
 
 		 153 aa  95.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  30.71 
 
 		 143 aa  94.7  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  31.11 
 
 		 152 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2058  ferric uptake regulator, Fur family  31.62 
 
 		 145 aa  94.4  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  34.35 
 
 		 148 aa  94  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  30.94 
 
 		 145 aa  94  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2005  ferric uptake regulator, Fur family  34.68 
 
 		 128 aa  93.6  9e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0208  ferric uptake regulator family protein  31.47 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3292  FUR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000231053  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1645  ferric uptake regulation protein (ferric uptake regulator)  31.72 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1354  ferric uptake regulator, Fur family  36.07 
 
 		 133 aa  92.4  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000236384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3278  ferric uptake regulator, Fur family  38.74 
 
 		 149 aa  92  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.351465 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1224  ferric uptake regulator family protein  30.5 
 
 		 147 aa  92.8  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.293203  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3815  ferric uptake regulator family protein  38.46 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000025471  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0615  ferric uptake regulator, Fur family  35.11 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.12884  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  28.86 
 
 		 157 aa  91.7  3e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  28.86 
 
 		 157 aa  92  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  33.58 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0753  ferric uptake regulator family protein  32.8 
 
 		 144 aa  92  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  28.86 
 
 		 157 aa  92  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  29.63 
 
 		 154 aa  92  3e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0122  ferric uptake regulation protein  36.22 
 
 		 154 aa  91.3  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00816522  normal  0.910281 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  30.71 
 
 		 155 aa  91.3  4e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1147  ferric uptake regulator family protein  32.06 
 
 		 155 aa  91.3  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1143  ferric uptake regulator, Fur family  40.16 
 
 		 150 aa  90.9  5e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000124537  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1963  ferric uptake regulator family protein  32.84 
 
 		 157 aa  90.9  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0876725  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2366  ferric uptake regulator, Fur family  36.07 
 
 		 131 aa  90.5  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.437919 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>