More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0650 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 
144 aa  293  7e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1006  ferric uptake regulator, Fur family  63.19 
 
 
152 aa  176  9e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000144475 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  55.07 
 
 
154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  54.29 
 
 
146 aa  157  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  50 
 
 
149 aa  155  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4201  transcriptional regulator, Fur family  51.39 
 
 
151 aa  155  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0217905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1036  transcriptional regulator, Fur family  51.39 
 
 
151 aa  155  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0163253  normal  0.210334 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2790  ferric uptake regulator family protein  51.39 
 
 
151 aa  154  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000512773  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3922  ferric uptake regulator family protein  51.39 
 
 
151 aa  154  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000572819  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4224  transcriptional regulator, Fur family  51.39 
 
 
151 aa  153  8e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00546613  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4115  transcriptional regulator, Fur family  51.39 
 
 
151 aa  153  8e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5116299999999997e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4160  FUR family transcriptional regulator  51.39 
 
 
151 aa  153  8e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4001  FUR family transcriptional regulator  51.39 
 
 
151 aa  153  8e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000832394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3832  FUR family transcriptional regulator  51.39 
 
 
151 aa  153  8e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3848  FUR family transcriptional regulator  51.39 
 
 
151 aa  153  8e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000844204  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4313  FUR family transcriptional regulator  51.39 
 
 
151 aa  153  8e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  48.61 
 
 
149 aa  152  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  48.61 
 
 
149 aa  152  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0365  ferric uptake regulator, Fur family  50 
 
 
150 aa  148  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1147  ferric uptake regulator family protein  53.85 
 
 
155 aa  148  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  45.71 
 
 
147 aa  144  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  48.61 
 
 
145 aa  142  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2259  ferric uptake regulator, Fur family  50 
 
 
154 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1138  ferric uptake regulator, Fur family  53.12 
 
 
143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716078  normal  0.825565 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  47.79 
 
 
159 aa  133  7.000000000000001e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1995  ferric uptake regulator, Fur family  45.19 
 
 
146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.134138  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0660  Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins  49.64 
 
 
146 aa  122  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2867  ferric uptake regulator, Fur family  48.06 
 
 
149 aa  122  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000960204  decreased coverage  0.0000000000000181287 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  44.06 
 
 
143 aa  118  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  44.09 
 
 
153 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  45.67 
 
 
143 aa  115  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  44.09 
 
 
143 aa  114  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  45.67 
 
 
143 aa  114  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  40 
 
 
143 aa  114  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1272  ferric uptake regulator family protein  41.38 
 
 
158 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2029  FUR family transcriptional regulator  47.41 
 
 
150 aa  113  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1746  FUR family transcriptional regulator  47.41 
 
 
150 aa  113  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  37.59 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0019  ferric uptake regulator family protein  38.13 
 
 
142 aa  110  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  37.59 
 
 
152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  39.73 
 
 
148 aa  110  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  45.45 
 
 
138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0020  FUR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
142 aa  107  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147149  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4185  ferric uptake regulator, Fur family  40.88 
 
 
139 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.421488  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  37.67 
 
 
144 aa  105  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  37.67 
 
 
152 aa  104  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_19  transcriptional regulator, Fur family  38.41 
 
 
142 aa  104  5e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.677591  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  39.52 
 
 
146 aa  104  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1411  ferric uptake regulator family protein  39.42 
 
 
150 aa  103  7e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0577  ferric-uptake regulator  37.32 
 
 
156 aa  102  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  38.81 
 
 
155 aa  102  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  38.81 
 
 
155 aa  103  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  38.06 
 
 
157 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  38.06 
 
 
142 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  38.06 
 
 
144 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  38.06 
 
 
144 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  38.06 
 
 
144 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  38.06 
 
 
142 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  38.06 
 
 
144 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  38.06 
 
 
142 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  38.06 
 
 
157 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  38.06 
 
 
157 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1415  ferric uptake regulator family protein  36.3 
 
 
140 aa  101  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000163802  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  38.06 
 
 
142 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  38.06 
 
 
142 aa  102  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2612  ferric uptake regulator, Fur family  33.57 
 
 
146 aa  101  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0529  ferric uptake regulator, Fur family  40.31 
 
 
143 aa  100  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000605392  normal  0.102669 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
142 aa  100  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1315  transcriptional regulator, TrmB  36.99 
 
 
151 aa  100  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  37.31 
 
 
143 aa  100  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4234  ferric uptake regulator family protein  36.11 
 
 
167 aa  100  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0343972  normal  0.519768 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  37.31 
 
 
154 aa  99.8  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  37.96 
 
 
147 aa  99.8  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0603  ferric uptake regulator family protein  36.57 
 
 
138 aa  99  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.401566  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6009  ferric uptake regulator family protein  36.57 
 
 
155 aa  98.6  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.964976 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  35.82 
 
 
151 aa  98.2  3e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  38.41 
 
 
150 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  38.41 
 
 
150 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  38.41 
 
 
150 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  38.41 
 
 
150 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00640  ferric uptake regulator  38.41 
 
 
148 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0211931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  38.41 
 
 
148 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  38.41 
 
 
148 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  38.41 
 
 
148 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  38.41 
 
 
148 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  38.41 
 
 
150 aa  97.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  38.41 
 
 
148 aa  97.8  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  38.41 
 
 
148 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177584  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  38.41 
 
 
148 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  38.41 
 
 
148 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4555  ferric uptake regulator family protein  37.31 
 
 
145 aa  97.8  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2058  ferric uptake regulator, Fur family  36.36 
 
 
145 aa  96.7  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0753  ferric uptake regulator family protein  37.23 
 
 
148 aa  96.7  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.629039  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4078  ferric uptake regulator, Fur family  38.06 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000739269  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0322  ferric uptake regulator  38.24 
 
 
148 aa  95.9  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135806  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4610  ferric uptake regulator family protein  36.17 
 
 
181 aa  95.1  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2644  ferric uptake regulator family protein  38.81 
 
 
146 aa  95.9  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3791  ferric uptake regulator family protein  37.59 
 
 
152 aa  95.1  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  38.24 
 
 
148 aa  94.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1806  ferric uptake regulator family protein  38.17 
 
 
141 aa  94.4  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.696064  normal  0.171205 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>