More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1587 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 		 143 aa  293  5e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  97.9 
 
 		 143 aa  290  6e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  81.12 
 
 		 153 aa  245  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  80.42 
 
 		 143 aa  243  6e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  80.28 
 
 		 143 aa  241  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  66.2 
 
 		 147 aa  197  5e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  63.5 
 
 		 146 aa  187  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  63.5 
 
 		 143 aa  178  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3769  ferric uptake regulator, Fur family  51.41 
 
 		 151 aa  152  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  53.33 
 
 		 167 aa  150  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  53.33 
 
 		 167 aa  150  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  53.33 
 
 		 167 aa  150  5e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3662  ferric uptake regulator, Fur family  50.7 
 
 		 151 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  47.06 
 
 		 144 aa  143  6e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  49.26 
 
 		 148 aa  144  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  45.19 
 
 		 152 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5908  ferric uptake regulator, Fur family  49.63 
 
 		 165 aa  137  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  50 
 
 		 176 aa  137  6e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0753  ferric uptake regulator family protein  44.03 
 
 		 144 aa  127  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  47.76 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  43.07 
 
 		 151 aa  123  9e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  39.85 
 
 		 143 aa  120  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  41.91 
 
 		 157 aa  120  9e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  41.91 
 
 		 157 aa  119  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0577  ferric-uptake regulator  41.61 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  41.91 
 
 		 157 aa  119  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3367  ferric uptake regulator family protein  40.56 
 
 		 149 aa  118  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  39.1 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  39.1 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  39.1 
 
 		 142 aa  118  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  39.1 
 
 		 142 aa  118  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  39.04 
 
 		 147 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  41.61 
 
 		 146 aa  117  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  38.35 
 
 		 142 aa  116  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  38.35 
 
 		 142 aa  116  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  38.35 
 
 		 142 aa  116  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  40.44 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  45.67 
 
 		 144 aa  115  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1272  ferric uptake regulator family protein  40.69 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  41.61 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 142 aa  115  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1645  ferric uptake regulation protein (ferric uptake regulator)  40.15 
 
 		 155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0603  ferric uptake regulator family protein  43.94 
 
 		 138 aa  114  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.401566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  39.42 
 
 		 154 aa  114  5e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2576  ferric uptake regulator, Fur family  49.19 
 
 		 143 aa  113  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.710249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2986  ferric uptake regulator, Fur family  49.19 
 
 		 143 aa  113  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.105319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  40.88 
 
 		 155 aa  113  8.999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2747  ferric uptake transcriptional repressor transcription regulator protein  49.19 
 
 		 143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1995  ferric uptake regulator, Fur family  43.08 
 
 		 146 aa  111  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.134138  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0406  ferric uptake regulator, Fur family  42.42 
 
 		 139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1799  FUR family manganese uptake regulator  44.88 
 
 		 137 aa  110  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4057  ferric uptake regulator, Fur family  43.41 
 
 		 151 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3944  ferric uptake regulator, Fur family  43.41 
 
 		 151 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2976  ferric uptake regulator family protein  48.39 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  35.34 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3272  ferric uptake regulator, Fur family  41.79 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.710175  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2837  ferric uptake regulator family protein  48.39 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6009  ferric uptake regulator family protein  42.42 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.964976 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1194  ferric-uptake regulator  46.97 
 
 		 159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3924  ferric uptake regulator family protein  41.79 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3031  ferric uptake regulator family protein  45.9 
 
 		 139 aa  109  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1147  ferric uptake regulator family protein  43.51 
 
 		 155 aa  107  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  34.59 
 
 		 150 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 149 aa  107  7.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2623  ferric uptake regulation protein  44.36 
 
 		 143 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.376677  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  36.17 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0247  ferric uptake transcriptional (FUR)-like transcription regulator protein  42.31 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.406535  normal  0.140515 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0229  ferric uptake regulator family protein  45.52 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4234  ferric uptake regulator family protein  42.97 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0343972  normal  0.519768 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4555  ferric uptake regulator family protein  40.91 
 
 		 145 aa  104  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0223  transcriptional regulator  44.12 
 
 		 145 aa  105  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2142  putative ferric uptake regulation protein  42.62 
 
 		 137 aa  104  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1727  ferric uptake regulator, Fur family  47.97 
 
 		 146 aa  104  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0616  ferric uptake regulator family protein  45.97 
 
 		 142 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.740565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2737  ferric uptake regulator family protein  45.97 
 
 		 142 aa  103  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348547  normal  0.830954 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0166  ferric uptake regulator family protein  45.97 
 
 		 142 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0435  ferric uptake regulator  45.16 
 
 		 135 aa  103  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0649  ferric uptake regulator family protein  45.97 
 
 		 142 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0570  ferric uptake regulator family protein  45.97 
 
 		 142 aa  103  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.233033 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0544  ferric uptake regulator family protein  45.97 
 
 		 142 aa  103  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0596927  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3455  ferric uptake regulator  45.97 
 
 		 142 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114286  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2645  ferric uptake regulator  45.97 
 
 		 142 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0375  ferric uptake regulator  45.97 
 
 		 142 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3420  ferric uptake regulator  45.97 
 
 		 142 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133952  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2458  ferric uptake regulator  45.97 
 
 		 142 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3457  ferric uptake regulator  45.97 
 
 		 142 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0984  ferric uptake regulator family protein  43.55 
 
 		 140 aa  103  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1234  ferric uptake regulator  45.97 
 
 		 142 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0251  ferric uptake regulator, Fur family  45.86 
 
 		 167 aa  103  9e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4610  ferric uptake regulator family protein  43.85 
 
 		 181 aa  103  9e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  37.59 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  39.1 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2790  ferric uptake regulator family protein  36.3 
 
 		 151 aa  102  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000512773  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3735  ferric uptake regulator family protein  45.97 
 
 		 142 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.345676 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0019  ferric uptake regulator family protein  35.77 
 
 		 142 aa  103  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1206  ferric uptake regulator  45.97 
 
 		 142 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3385  ferric uptake regulator, Fur family  46.77 
 
 		 142 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.514247  hitchhiker  0.0000888993 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  39.1 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>