More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1230 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1230  FUR family transcriptional regulator  100 
 
 
139 aa  289  1e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0757057  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1420  FUR family transcriptional regulator  97.84 
 
 
139 aa  284  2e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0522352  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  52.55 
 
 
166 aa  163  6.9999999999999995e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08960  ferric uptake regulator, Fur family  41.54 
 
 
134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  34.62 
 
 
148 aa  115  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  34.62 
 
 
148 aa  115  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  39.84 
 
 
142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  39.53 
 
 
144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  39.53 
 
 
144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  39.84 
 
 
142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  39.53 
 
 
142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  39.84 
 
 
142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  39.53 
 
 
142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  39.84 
 
 
142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  39.06 
 
 
143 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0584  ferric uptake regulator family protein  39.06 
 
 
149 aa  106  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.274905  normal  0.220198 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  35.66 
 
 
150 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  36.92 
 
 
150 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1722  ferric uptake regulator family protein  36.23 
 
 
146 aa  105  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.907916 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  32.03 
 
 
150 aa  104  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0480  ferric uptake regulator, Fur family  29.2 
 
 
164 aa  103  9e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4078  ferric uptake regulator, Fur family  35.38 
 
 
144 aa  102  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000739269  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0844  ferric uptake regulator, Fur family  36.64 
 
 
150 aa  100  5e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000126283  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1597  ferric uptake regulator, Fur family  38.69 
 
 
139 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0391  FUR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
159 aa  98.6  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1806  ferric uptake regulator family protein  36.43 
 
 
141 aa  98.2  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.696064  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3815  ferric uptake regulator family protein  39.52 
 
 
132 aa  98.2  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000025471  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
149 aa  97.8  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  33.1 
 
 
149 aa  97.4  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  33.1 
 
 
149 aa  97.4  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1224  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 
147 aa  97.1  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.293203  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2002  ferric uptake regulator family protein  34.4 
 
 
159 aa  95.5  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0758566  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0768  iron ABC transporter  38.52 
 
 
145 aa  95.5  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000612083  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1963  ferric uptake regulator family protein  30.66 
 
 
157 aa  95.5  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0876725  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0222  ferric-uptake regulator  44.55 
 
 
139 aa  94.7  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0105  ferric uptake regulator family protein  37.31 
 
 
147 aa  94.4  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.013681  normal  0.263297 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0822  ferric uptake regulator family protein  38.4 
 
 
126 aa  94.4  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000300093  normal  0.0104511 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0141  ferric uptake regulator, Fur family  32.81 
 
 
133 aa  93.6  7e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.896296  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1300  ferric uptake regulator family protein  35.07 
 
 
151 aa  93.6  8e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0149  ferric uptake regulator, Fur family  34.75 
 
 
139 aa  93.2  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000946287  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0365  ferric uptake regulator, Fur family  41.04 
 
 
150 aa  93.2  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2198  ferric uptake regulator, Fur family  30.71 
 
 
169 aa  92.8  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2790  ferric uptake regulator family protein  37.01 
 
 
151 aa  92  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000512773  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0153  ferric uptake regulator, Fur family  33.05 
 
 
139 aa  91.7  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000104646  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2259  ferric uptake regulator, Fur family  35.42 
 
 
154 aa  91.7  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  33.6 
 
 
146 aa  91.3  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2644  ferric uptake regulator family protein  36.36 
 
 
146 aa  90.9  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  32.85 
 
 
154 aa  90.1  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0543  ferric uptake regulator, Fur family  36.36 
 
 
139 aa  89.7  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.70942 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2798  Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins  29.69 
 
 
146 aa  89.7  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.1309500000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0101  ferric uptake regulator, Fur family  29.23 
 
 
139 aa  89.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133113  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3531  ferric uptake regulator, Fur family  34.88 
 
 
132 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2058  ferric uptake regulator, Fur family  30.15 
 
 
145 aa  88.6  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1415  ferric uptake regulator family protein  34.11 
 
 
140 aa  89  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000163802  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4071  ferric uptake regulator, Fur family  36.5 
 
 
138 aa  89  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000323892  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2668  ferric uptake regulator family protein  32.59 
 
 
146 aa  88.2  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0135  ferric uptake regulator, Fur family  29.46 
 
 
139 aa  87.8  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000297915  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1354  ferric uptake regulator, Fur family  35.2 
 
 
133 aa  87.8  4e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000236384  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1966  ferric uptake regulator family protein  33.09 
 
 
149 aa  87.8  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3251  ferric uptake regulator family protein  28.68 
 
 
158 aa  87.8  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1036  transcriptional regulator, Fur family  34.65 
 
 
151 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0163253  normal  0.210334 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1792  ferric uptake regulator, Fur family  33.09 
 
 
150 aa  87  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000306351  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4201  transcriptional regulator, Fur family  34.65 
 
 
151 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0217905  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2513  ferric uptake regulator, Fur family  31.54 
 
 
137 aa  86.3  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275348  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  34.33 
 
 
142 aa  86.3  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3922  ferric uptake regulator family protein  34.65 
 
 
151 aa  86.3  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000572819  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1241  ferric uptake regulator, Fur family  31.01 
 
 
170 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00903138 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1648  ferric uptake regulator family protein  34.65 
 
 
149 aa  85.9  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.499744 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0615  ferric uptake regulator, Fur family  36.15 
 
 
139 aa  85.5  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.12884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4160  FUR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
151 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4001  FUR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
151 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000832394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3832  FUR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
151 aa  85.1  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3848  FUR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
151 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000844204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4115  transcriptional regulator, Fur family  34.65 
 
 
151 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5116299999999997e-20 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  30.99 
 
 
159 aa  85.1  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4313  FUR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
151 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4224  transcriptional regulator, Fur family  34.65 
 
 
151 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00546613  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0284  ferric uptake regulator family protein  34.43 
 
 
128 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0246387 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  32.14 
 
 
147 aa  84.7  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  33.58 
 
 
143 aa  84.3  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2366  ferric uptake regulator, Fur family  30.53 
 
 
131 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.437919 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  33.08 
 
 
152 aa  84.3  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0754  ferric uptake regulator family protein  27.13 
 
 
143 aa  84  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.354602  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1388  ferric uptake regulator, Fur family  29.84 
 
 
136 aa  83.6  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00327608  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1147  ferric uptake regulator family protein  32.17 
 
 
155 aa  84  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0352  ferric uptake regulator, Fur family  36.29 
 
 
131 aa  83.6  8e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  32.33 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2005  ferric uptake regulator, Fur family  33.06 
 
 
128 aa  82.8  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3240  ferric uptake regulator family protein  32.31 
 
 
148 aa  82  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000230922  hitchhiker  0.00191408 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0753  ferric uptake regulator family protein  34.09 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2809  FUR family transcriptional regulator  32.03 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.110848  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  30.95 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0263  FUR family transcriptional regulator  42.55 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3674  ferric uptake regulator family protein  32.54 
 
 
129 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3112  ferric uptake regulator family protein  32.28 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.966736  normal  0.35423 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  32.28 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0945  ferric uptake regulator, Fur family  35.04 
 
 
134 aa  81.3  0.000000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  32.56 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>