More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1364 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 		 152 aa  315  1e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  85.82 
 
 		 144 aa  258  2e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  73.47 
 
 		 148 aa  228  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  49.26 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  54.35 
 
 		 167 aa  154  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  54.35 
 
 		 167 aa  154  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  49.63 
 
 		 143 aa  154  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  54.01 
 
 		 167 aa  151  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  50 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  47.89 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  45.93 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0753  ferric uptake regulator family protein  46.53 
 
 		 144 aa  143  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  45.99 
 
 		 154 aa  143  9e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  43.48 
 
 		 147 aa  139  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  45.19 
 
 		 143 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  45.19 
 
 		 143 aa  138  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  49.63 
 
 		 176 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3367  ferric uptake regulator family protein  44.29 
 
 		 149 aa  137  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5908  ferric uptake regulator, Fur family  48.53 
 
 		 165 aa  122  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1645  ferric uptake regulation protein (ferric uptake regulator)  36.3 
 
 		 155 aa  111  4.0000000000000004e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3769  ferric uptake regulator, Fur family  38.73 
 
 		 151 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3662  ferric uptake regulator, Fur family  38.03 
 
 		 151 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0984  ferric uptake regulator family protein  44.44 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1799  FUR family manganese uptake regulator  45.52 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3031  ferric uptake regulator family protein  44.96 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0577  ferric-uptake regulator  39.72 
 
 		 156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1138  ferric uptake regulator, Fur family  39.68 
 
 		 143 aa  107  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716078  normal  0.825565 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0842  ferric uptake regulator, Fur family  34.72 
 
 		 152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  38.85 
 
 		 154 aa  107  4.0000000000000004e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  39.29 
 
 		 157 aa  107  5e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2494  FUR family manganese uptake regulator  47.93 
 
 		 137 aa  107  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360985  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  39.29 
 
 		 157 aa  107  5e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1161  ferric uptake regulator family protein  47.93 
 
 		 137 aa  107  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.13561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  38.73 
 
 		 155 aa  107  5e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  39.29 
 
 		 157 aa  107  5e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0932  ferric uptake regulator family protein  47.93 
 
 		 137 aa  107  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2142  putative ferric uptake regulation protein  47.2 
 
 		 137 aa  107  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  38.41 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2968  ferric uptake regulator family protein  43.7 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1315  transcriptional regulator, TrmB  40 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  38.73 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2385  ferric uptake regulator family protein  42.45 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0013  ferric uptake regulator family protein  45.08 
 
 		 135 aa  104  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00124444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  37.67 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1820  ferric uptake regulator family protein  44.7 
 
 		 144 aa  104  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.168146 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1806  ferric uptake regulator family protein  38.13 
 
 		 141 aa  103  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.696064  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1995  ferric uptake regulator, Fur family  43.41 
 
 		 146 aa  103  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.134138  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  38.57 
 
 		 146 aa  103  9e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1272  ferric uptake regulator family protein  37.76 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  38.52 
 
 		 154 aa  102  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  32.64 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  33.59 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3767  ferric uptake regulator family protein  43.44 
 
 		 140 aa  102  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  37.86 
 
 		 159 aa  101  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 144 aa  101  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  33.59 
 
 		 144 aa  101  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  33.59 
 
 		 144 aa  101  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  33.59 
 
 		 142 aa  101  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 144 aa  101  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  33.59 
 
 		 142 aa  101  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 149 aa  100  7e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  33.59 
 
 		 142 aa  100  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  33.59 
 
 		 142 aa  100  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  33.59 
 
 		 142 aa  100  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0630  FUR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  34.46 
 
 		 149 aa  100  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  34.46 
 
 		 149 aa  100  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0342  ferric uptake regulator family protein  34.59 
 
 		 237 aa  99.8  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.087099  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0244  ferric-uptake regulator  45.16 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0020  ferric uptake regulator family protein  45.16 
 
 		 149 aa  99.4  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0165645  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0454  ferric uptake regulator, Fur family  45.16 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4436  ferric uptake regulator family protein  38.35 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  40 
 
 		 161 aa  100  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000031646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2058  ferric uptake regulator, Fur family  36.17 
 
 		 145 aa  99.4  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3615  ferric uptake regulator family protein  41.79 
 
 		 168 aa  99  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0406  ferric uptake regulator, Fur family  38.46 
 
 		 139 aa  98.6  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1147  ferric uptake regulator family protein  35.71 
 
 		 155 aa  99.4  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  33.09 
 
 		 152 aa  99  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1661  ferric uptake regulator  39.1 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000966153  normal  0.373988 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0928  FUR family manganese uptake regulator  45.08 
 
 		 138 aa  99.4  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0044  ferric uptake regulator family protein  44.35 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.496747  normal  0.591839 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3924  ferric uptake regulator family protein  35.57 
 
 		 182 aa  98.2  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.567476 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1680  ferric uptake regulator, Fur family  34.97 
 
 		 167 aa  98.2  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  39.86 
 
 		 148 aa  98.2  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  39.86 
 
 		 148 aa  98.2  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0013  ferric-uptake regulator  44.35 
 
 		 156 aa  98.2  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0292053 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0588  ferric uptake regulator family protein  45.16 
 
 		 165 aa  98.2  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  32.85 
 
 		 152 aa  98.2  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0435  ferric uptake regulator  43.31 
 
 		 135 aa  98.2  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  33.81 
 
 		 143 aa  97.8  5e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  38.46 
 
 		 143 aa  97.8  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  40.74 
 
 		 148 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  40.74 
 
 		 148 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  40.74 
 
 		 150 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  40.74 
 
 		 148 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  40.74 
 
 		 150 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  40.74 
 
 		 150 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  40.74 
 
 		 150 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  40.74 
 
 		 148 aa  97.4  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>