More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0487 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  100 
 
 
151 aa  312  9e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  78.81 
 
 
157 aa  255  2e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  79.87 
 
 
157 aa  255  2e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  79.87 
 
 
157 aa  255  2e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  71.81 
 
 
154 aa  242  9.999999999999999e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  73.65 
 
 
155 aa  239  7e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  73.65 
 
 
155 aa  238  2.9999999999999997e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1645  ferric uptake regulation protein (ferric uptake regulator)  71.33 
 
 
155 aa  228  3e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0577  ferric-uptake regulator  68.46 
 
 
156 aa  214  4e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1272  ferric uptake regulator family protein  60.96 
 
 
158 aa  184  4e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  45.32 
 
 
143 aa  134  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  43.07 
 
 
143 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  44.44 
 
 
143 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  43.07 
 
 
143 aa  123  9e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  43.07 
 
 
153 aa  122  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  42.34 
 
 
143 aa  122  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  41.35 
 
 
176 aa  121  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  41.01 
 
 
145 aa  119  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  38.93 
 
 
167 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  38.93 
 
 
167 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  38.93 
 
 
167 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  43.8 
 
 
146 aa  117  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5908  ferric uptake regulator, Fur family  41.5 
 
 
165 aa  115  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616966  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0753  ferric uptake regulator family protein  37.5 
 
 
144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0438  ferric uptake regulation protein  41.35 
 
 
136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0414  ferric uptake regulation protein  41.35 
 
 
136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  41.84 
 
 
148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  38.36 
 
 
154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4078  ferric uptake regulator, Fur family  37.04 
 
 
144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000739269  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0873  ferric uptake regulator, Fur family protein  43.31 
 
 
142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3367  ferric uptake regulator family protein  37.68 
 
 
149 aa  108  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  41.22 
 
 
143 aa  107  6e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  37.78 
 
 
147 aa  107  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  38.41 
 
 
152 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  39.23 
 
 
144 aa  105  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0940  ferric uptake regulator, Fur family  37.59 
 
 
145 aa  105  3e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  39.44 
 
 
146 aa  105  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  38.93 
 
 
144 aa  105  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01339  ferric uptake regulator  41.18 
 
 
149 aa  104  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1690  ferric uptake regulator  41.54 
 
 
150 aa  104  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000286155  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1575  ferric uptake regulator  43.75 
 
 
147 aa  103  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004126  ferric uptake regulation protein FUR  41.54 
 
 
149 aa  103  8e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  39.16 
 
 
147 aa  102  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1661  ferric uptake regulator  41.54 
 
 
143 aa  102  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000966153  normal  0.373988 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1481  ferric uptake regulator family protein  38.64 
 
 
140 aa  102  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.268678  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1799  FUR family manganese uptake regulator  40.16 
 
 
137 aa  101  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  43.08 
 
 
148 aa  101  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1641  ferric uptake regulator  40.77 
 
 
143 aa  101  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1716  ferric uptake regulator  40.77 
 
 
143 aa  101  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000280206  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0101  ferric uptake regulator, Fur family  38.28 
 
 
139 aa  101  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133113  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  43.08 
 
 
148 aa  101  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  35.82 
 
 
150 aa  101  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  37.68 
 
 
144 aa  101  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1842  ferric uptake regulator  40.77 
 
 
143 aa  100  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000122874  normal  0.0218944 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  40.77 
 
 
143 aa  100  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0365  ferric uptake regulator, Fur family  35.42 
 
 
150 aa  100  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2810  ferric uptake regulator  41.09 
 
 
143 aa  100  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.644684  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2145  ferric-uptake regulator  30.66 
 
 
164 aa  100  7e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0322  ferric uptake regulator  43.08 
 
 
148 aa  100  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135806  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0833  ferric uptake regulator  40.77 
 
 
147 aa  100  9e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  31.79 
 
 
148 aa  99.4  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1937  ferric uptake regulator  40 
 
 
143 aa  99.8  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  35.61 
 
 
150 aa  99.4  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  31.79 
 
 
148 aa  99.4  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  34.07 
 
 
138 aa  99.4  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  40 
 
 
143 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000468341  normal  0.147817 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
149 aa  99.4  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4057  ferric uptake regulator, Fur family  39.85 
 
 
151 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3944  ferric uptake regulator, Fur family  39.85 
 
 
151 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1383  ferric uptake regulation protein (ferric uptake regulator)  41.32 
 
 
147 aa  99  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  39.23 
 
 
161 aa  99.4  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000031646  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1451  ferric uptake regulation protein  37.31 
 
 
155 aa  98.6  3e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000060196  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1236  ferric uptake regulator  41.09 
 
 
148 aa  98.6  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000206726  normal  0.895859 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2913  ferric uptake regulator family protein  35.71 
 
 
142 aa  98.2  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1389  ferric uptake regulation protein  37.31 
 
 
145 aa  98.2  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000498211  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2790  ferric uptake regulator family protein  35.42 
 
 
151 aa  97.8  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000512773  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  35.82 
 
 
144 aa  98.2  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3806  ferric uptake regulator family protein  34.75 
 
 
152 aa  98.2  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3863  ferric uptake regulator, Fur family  34.75 
 
 
160 aa  97.8  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199126  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2623  ferric uptake regulation protein  37.04 
 
 
143 aa  97.4  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.376677  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  39.23 
 
 
143 aa  97.4  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000255764  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0149  ferric uptake regulator, Fur family  36.22 
 
 
139 aa  97.8  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000946287  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  39.23 
 
 
143 aa  97.4  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000743772  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  39.23 
 
 
143 aa  97.4  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000739379  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1203  ferric-uptake regulator  37.68 
 
 
164 aa  97.8  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238976  normal  0.43174 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3769  ferric uptake regulator, Fur family  35.71 
 
 
151 aa  97.4  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2152  ferric uptake regulator  38.46 
 
 
140 aa  97.8  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  39.23 
 
 
143 aa  97.4  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2263  ferric uptake regulator  39.23 
 
 
143 aa  97.4  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  39.69 
 
 
150 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  39.69 
 
 
150 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  39.69 
 
 
148 aa  97.4  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  39.69 
 
 
150 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  39.69 
 
 
150 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  39.69 
 
 
150 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2968  ferric uptake regulator family protein  36.36 
 
 
151 aa  97.4  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2593  ferric uptake regulator family protein  42.19 
 
 
142 aa  97.4  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000283641 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  39.69 
 
 
148 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  39.69 
 
 
148 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  39.69 
 
 
148 aa  97.1  7e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>