More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4057 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_3944  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 		 151 aa  306  5e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4057  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 		 151 aa  306  5e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0247  ferric uptake transcriptional (FUR)-like transcription regulator protein  88.74 
 
 		 151 aa  277  3e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.406535  normal  0.140515 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5530  ferric uptake regulator family protein  64.75 
 
 		 146 aa  185  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5746  ferric uptake regulator, DNA-binding transcriptional dual regulator of siderophore biosynthesis and transport  65.91 
 
 		 157 aa  184  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3455  ferric uptake regulator  61.19 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114286  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2645  ferric uptake regulator  61.19 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0375  ferric uptake regulator  61.19 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2458  ferric uptake regulator  61.19 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0570  ferric uptake regulator family protein  61.19 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.233033 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3457  ferric uptake regulator  61.19 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1206  ferric uptake regulator  61.19 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1234  ferric uptake regulator  61.19 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3420  ferric uptake regulator  61.19 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133952  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0544  ferric uptake regulator family protein  61.19 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0596927  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3385  ferric uptake regulator, Fur family  62.69 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.514247  hitchhiker  0.0000888993 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0616  ferric uptake regulator family protein  61.19 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.740565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2737  ferric uptake regulator family protein  61.19 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348547  normal  0.830954 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0166  ferric uptake regulator family protein  61.19 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0649  ferric uptake regulator family protein  61.19 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0406  ferric uptake regulator, Fur family  56.93 
 
 		 139 aa  173  7e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2976  ferric uptake regulator family protein  61.19 
 
 		 143 aa  173  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4555  ferric uptake regulator family protein  56.74 
 
 		 145 aa  173  8e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3735  ferric uptake regulator family protein  60.45 
 
 		 142 aa  173  8e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.345676 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0603  ferric uptake regulator family protein  56.2 
 
 		 138 aa  173  8e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.401566  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2747  ferric uptake transcriptional repressor transcription regulator protein  60.45 
 
 		 143 aa  173  9e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2576  ferric uptake regulator, Fur family  60.45 
 
 		 143 aa  173  9e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.710249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0571  ferric uptake regulator family protein  61.94 
 
 		 142 aa  173  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2986  ferric uptake regulator, Fur family  60.45 
 
 		 143 aa  173  9e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.105319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2837  ferric uptake regulator family protein  60.45 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2593  ferric uptake regulator family protein  61.94 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000283641 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6009  ferric uptake regulator family protein  55.32 
 
 		 155 aa  171  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.964976 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3924  ferric uptake regulator family protein  56.2 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3272  ferric uptake regulator, Fur family  56.2 
 
 		 138 aa  169  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.710175  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0934  ferric uptake regulator family protein  55 
 
 		 147 aa  166  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.634788  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2623  ferric uptake regulation protein  52.17 
 
 		 143 aa  164  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.376677  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0438  ferric uptake regulation protein  56.52 
 
 		 136 aa  163  9e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0414  ferric uptake regulation protein  56.52 
 
 		 136 aa  163  9e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1905  ferric uptake regulator family protein  57.55 
 
 		 140 aa  161  4.0000000000000004e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0223  transcriptional regulator  58.33 
 
 		 145 aa  160  6e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1727  ferric uptake regulator, Fur family  56.06 
 
 		 146 aa  159  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1481  ferric uptake regulator family protein  57.25 
 
 		 140 aa  159  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.268678  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4610  ferric uptake regulator family protein  55.97 
 
 		 181 aa  159  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0474  ferric uptake regulator family protein  55.22 
 
 		 143 aa  158  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1123  ferric uptake regulator family protein  54.48 
 
 		 148 aa  158  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.488583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0753  ferric uptake regulator family protein  56.72 
 
 		 148 aa  156  8e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.629039  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0475  ferric uptake regulator family protein  52.78 
 
 		 149 aa  156  9e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3791  ferric uptake regulator family protein  55.22 
 
 		 152 aa  155  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0967  ferric uptake regulator, Fur family  55.15 
 
 		 142 aa  154  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.924679  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1194  ferric-uptake regulator  51.06 
 
 		 159 aa  154  6e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4234  ferric uptake regulator family protein  57.89 
 
 		 167 aa  154  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0343972  normal  0.519768 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0458  ferric uptake regulator, Fur family  51.39 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000485327 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1389  ferric uptake regulation protein  51.88 
 
 		 145 aa  149  1e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000498211  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1451  ferric uptake regulation protein  51.88 
 
 		 155 aa  149  1e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000060196  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0282  ferric uptake regulation protein  51.39 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3097  ferric uptake regulator family protein  54.61 
 
 		 150 aa  149  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00640  ferric uptake regulator  53.03 
 
 		 148 aa  147  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0211931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  53.03 
 
 		 148 aa  147  5e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  53.03 
 
 		 150 aa  147  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  53.03 
 
 		 150 aa  147  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  53.03 
 
 		 148 aa  147  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  53.03 
 
 		 150 aa  147  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  53.03 
 
 		 148 aa  147  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  53.03 
 
 		 150 aa  147  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  53.03 
 
 		 150 aa  147  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  53.03 
 
 		 148 aa  147  5e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  53.03 
 
 		 148 aa  147  5e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  53.03 
 
 		 148 aa  147  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  53.03 
 
 		 148 aa  147  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177584  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1117  ferric uptake regulator, Fur family  53.03 
 
 		 148 aa  147  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  53.03 
 
 		 148 aa  147  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  53.03 
 
 		 148 aa  147  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  51.45 
 
 		 143 aa  147  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2810  ferric uptake regulator  56.25 
 
 		 143 aa  147  6e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.644684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2050  ferric uptake regulator, Fur family  53.79 
 
 		 141 aa  147  7e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1842  ferric uptake regulator  52.94 
 
 		 143 aa  147  7e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000122874  normal  0.0218944 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0251  ferric uptake regulator, Fur family  53.62 
 
 		 167 aa  147  7e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2152  ferric uptake regulator  51.49 
 
 		 140 aa  146  9e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1236  ferric uptake regulator  52.24 
 
 		 148 aa  146  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000206726  normal  0.895859 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5484  ferric uptake regulation protein  53.44 
 
 		 134 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2939  ferric uptake regulator, Fur family  51.49 
 
 		 148 aa  145  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0253838  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63020  ferric uptake regulation protein  53.44 
 
 		 134 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  50.71 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0229  ferric uptake regulator family protein  51.82 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  51.09 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  54.69 
 
 		 143 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000743772  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  54.69 
 
 		 143 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  54.69 
 
 		 143 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000739379  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  54.69 
 
 		 143 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000255764  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  51.09 
 
 		 144 aa  144  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1206  ferric uptake regulator  52.27 
 
 		 149 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000560641  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3125  ferric uptake regulator  52.27 
 
 		 149 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  53.91 
 
 		 161 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000031646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0894  ferric uptake regulator family protein  53.44 
 
 		 152 aa  144  5e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572753 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3627  ferric uptake regulator family protein  54.2 
 
 		 139 aa  142  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1575  ferric uptake regulator  50.36 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1937  ferric uptake regulator  53.91 
 
 		 143 aa  142  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1661  ferric uptake regulator  50 
 
 		 143 aa  142  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000966153  normal  0.373988 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2736  helix-turn-helix, AraC type  53.12 
 
 		 135 aa  141  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000081899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  53.91 
 
 		 143 aa  142  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000468341  normal  0.147817 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>