More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2913 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2913  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 142 aa  285  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1243  ferric uptake regulator family protein  62.4 
 
 		 141 aa  169  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1260  ferric uptake regulator family protein  63.5 
 
 		 140 aa  165  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3947  FUR family manganese uptake regulator  63.24 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.960435  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0360  ferric uptake regulation protein  55.15 
 
 		 138 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1654  ferric uptake regulation protein, putative  59.84 
 
 		 141 aa  159  9e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.179894  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4436  ferric uptake regulator family protein  55.47 
 
 		 144 aa  156  7e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1601  putative ferric uptake regulation protein  59.06 
 
 		 141 aa  156  9e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248674  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2968  ferric uptake regulator family protein  52.63 
 
 		 151 aa  146  9e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0020  ferric uptake regulator family protein  57.14 
 
 		 149 aa  144  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0165645  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0013  ferric-uptake regulator  55.83 
 
 		 156 aa  144  5e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0292053 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0466  ferric uptake regulator family protein  53.12 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.549538 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0021  ferric uptake regulator, Fur family  53.17 
 
 		 142 aa  139  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.531166 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0033  ferric uptake regulator, Fur family  53.17 
 
 		 142 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.968997  normal  0.145253 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0454  ferric uptake regulator, Fur family  50.75 
 
 		 143 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0588  ferric uptake regulator family protein  49.64 
 
 		 165 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0044  ferric uptake regulator family protein  53.78 
 
 		 150 aa  138  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.496747  normal  0.591839 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3615  ferric uptake regulator family protein  48.12 
 
 		 168 aa  137  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0244  ferric-uptake regulator  50 
 
 		 143 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1820  ferric uptake regulator family protein  55.46 
 
 		 144 aa  135  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.168146 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3767  ferric uptake regulator family protein  52.54 
 
 		 140 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0435  ferric uptake regulator  52.38 
 
 		 135 aa  134  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0984  ferric uptake regulator family protein  48.46 
 
 		 140 aa  134  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3031  ferric uptake regulator family protein  52.54 
 
 		 139 aa  134  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2385  ferric uptake regulator family protein  49.61 
 
 		 140 aa  132  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0013  ferric uptake regulator family protein  48.84 
 
 		 135 aa  133  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00124444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2066  ferric uptake regulator family protein  48.03 
 
 		 141 aa  130  3.9999999999999996e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.779744  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0932  ferric uptake regulator family protein  51.22 
 
 		 137 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2494  FUR family manganese uptake regulator  50 
 
 		 137 aa  127  6e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360985  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1161  ferric uptake regulator family protein  50 
 
 		 137 aa  127  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.13561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0928  FUR family manganese uptake regulator  51.69 
 
 		 138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2142  putative ferric uptake regulation protein  49.15 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2101  ferric uptake regulator, Fur family  45.08 
 
 		 158 aa  118  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1799  FUR family manganese uptake regulator  48.31 
 
 		 137 aa  117  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0702  ferric uptake regulator family protein  46.09 
 
 		 134 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.49525  hitchhiker  0.0000821406 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4508  ferric uptake regulation protein  44.53 
 
 		 135 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.358038  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4198  ferric-uptake regulator  44.53 
 
 		 135 aa  110  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2736  helix-turn-helix, AraC type  42.97 
 
 		 135 aa  110  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000081899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4731  ferric uptake regulator family protein  45.31 
 
 		 134 aa  110  9e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63020  ferric uptake regulation protein  45.31 
 
 		 134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4730  ferric uptake regulator, Fur family  44.53 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4596  ferric uptake regulator family protein  44.53 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.209502 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0760  ferric uptake regulator family protein  43.75 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.809862  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5484  ferric uptake regulation protein  44.53 
 
 		 134 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1516  FUR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 146 aa  107  5e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.995871  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1459  ferric uptake regulator family protein  42.64 
 
 		 146 aa  107  5e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.773495  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3967  ferric uptake regulator family protein  46.88 
 
 		 136 aa  106  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.706026 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3627  ferric uptake regulator family protein  44.09 
 
 		 139 aa  105  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1594  ferric uptake regulator, Fur family  41.86 
 
 		 135 aa  103  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43000  Ferric-uptake regulator, fur  43.31 
 
 		 134 aa  103  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01181  ferric uptake regulator Fur  41.86 
 
 		 136 aa  103  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0678895  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1690  ferric uptake regulator  41.09 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000286155  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1645  ferric uptake regulation protein (ferric uptake regulator)  36.76 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  39.69 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  39.69 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  39.69 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1334  ferric uptake regulator family protein  40.5 
 
 		 150 aa  100  8e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3365  ferric uptake regulator family protein  42.97 
 
 		 139 aa  99.8  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.019724  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3097  ferric uptake regulator family protein  42.19 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01339  ferric uptake regulator  40.65 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  41.46 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  41.46 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  35.92 
 
 		 154 aa  99  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00640  ferric uptake regulator  42.28 
 
 		 148 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0211931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  42.28 
 
 		 148 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  42.28 
 
 		 148 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  42.28 
 
 		 148 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  42.28 
 
 		 148 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  42.28 
 
 		 148 aa  98.2  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  42.28 
 
 		 148 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  42.28 
 
 		 150 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  42.28 
 
 		 148 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  42.28 
 
 		 148 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177584  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  35.71 
 
 		 151 aa  98.2  3e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  42.28 
 
 		 150 aa  98.2  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  42.28 
 
 		 150 aa  98.2  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  43.09 
 
 		 144 aa  97.8  4e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  42.28 
 
 		 150 aa  98.2  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  42.28 
 
 		 150 aa  98.2  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  42.28 
 
 		 143 aa  97.8  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004126  ferric uptake regulation protein FUR  39.84 
 
 		 149 aa  97.4  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0577  ferric-uptake regulator  37.9 
 
 		 156 aa  97.4  6e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  41.46 
 
 		 161 aa  97.4  6e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000031646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  37.5 
 
 		 155 aa  96.7  9e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  37.4 
 
 		 155 aa  96.7  9e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0322  ferric uptake regulator  41.46 
 
 		 148 aa  96.7  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  42.28 
 
 		 144 aa  96.7  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1661  ferric uptake regulator  40.65 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000966153  normal  0.373988 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4234  ferric uptake regulator family protein  44.72 
 
 		 167 aa  95.5  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0343972  normal  0.519768 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0833  ferric uptake regulator  40.65 
 
 		 147 aa  95.1  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1842  ferric uptake regulator  40.65 
 
 		 143 aa  94.4  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000122874  normal  0.0218944 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  38.21 
 
 		 143 aa  92.8  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000743772  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2810  ferric uptake regulator  40.65 
 
 		 143 aa  92.8  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.644684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3125  ferric uptake regulator  40.65 
 
 		 149 aa  92.8  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1206  ferric uptake regulator  40.65 
 
 		 149 aa  92.8  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000560641  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  38.21 
 
 		 143 aa  92.8  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000255764  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  38.21 
 
 		 143 aa  92.8  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000739379  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  38.21 
 
 		 143 aa  92.8  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  39.84 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  37.4 
 
 		 143 aa  92  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000468341  normal  0.147817 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>