More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2445 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 143 aa  293  4e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  87.32 
 
 		 143 aa  262  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  83.1 
 
 		 153 aa  246  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  82.39 
 
 		 143 aa  245  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  80.28 
 
 		 143 aa  241  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  69.06 
 
 		 147 aa  208  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  64.23 
 
 		 146 aa  196  7.999999999999999e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  64.75 
 
 		 143 aa  187  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  51.11 
 
 		 144 aa  155  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  49.26 
 
 		 152 aa  155  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  52.55 
 
 		 148 aa  154  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3769  ferric uptake regulator, Fur family  51.05 
 
 		 151 aa  153  7e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3662  ferric uptake regulator, Fur family  52.11 
 
 		 151 aa  152  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  52.27 
 
 		 167 aa  151  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  52.27 
 
 		 167 aa  151  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  52.27 
 
 		 167 aa  151  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  51.91 
 
 		 176 aa  144  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5908  ferric uptake regulator, Fur family  48.53 
 
 		 165 aa  138  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0753  ferric uptake regulator family protein  45.93 
 
 		 144 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  48.15 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  44.44 
 
 		 151 aa  128  2.0000000000000002e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0577  ferric-uptake regulator  45.19 
 
 		 156 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3367  ferric uptake regulator family protein  40.43 
 
 		 149 aa  124  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  43.38 
 
 		 146 aa  120  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  43.7 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  40.88 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  40.88 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  40.88 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  40.44 
 
 		 154 aa  117  7e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  42.22 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0842  ferric uptake regulator, Fur family  40.71 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1799  FUR family manganese uptake regulator  44.7 
 
 		 137 aa  114  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  38.17 
 
 		 143 aa  115  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  40 
 
 		 144 aa  114  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  44.88 
 
 		 154 aa  114  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1645  ferric uptake regulation protein (ferric uptake regulator)  39.26 
 
 		 155 aa  111  3e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2142  putative ferric uptake regulation protein  44.8 
 
 		 137 aa  110  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1995  ferric uptake regulator, Fur family  43.41 
 
 		 146 aa  110  7.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.134138  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  34.97 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  34.97 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1272  ferric uptake regulator family protein  40.44 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0603  ferric uptake regulator family protein  42.42 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.401566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1147  ferric uptake regulator family protein  47.2 
 
 		 155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  35.88 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  35.88 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  35.11 
 
 		 142 aa  107  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  35.11 
 
 		 142 aa  107  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  35.11 
 
 		 142 aa  107  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0406  ferric uptake regulator, Fur family  40.91 
 
 		 139 aa  107  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6009  ferric uptake regulator family protein  41.79 
 
 		 155 aa  106  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.964976 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3031  ferric uptake regulator family protein  44.8 
 
 		 139 aa  106  9.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0932  ferric uptake regulator family protein  44 
 
 		 137 aa  105  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0021  ferric uptake regulator, Fur family  41.79 
 
 		 142 aa  105  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.531166 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0033  ferric uptake regulator, Fur family  41.79 
 
 		 142 aa  105  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.968997  normal  0.145253 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  36.55 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0342  ferric uptake regulator family protein  36.09 
 
 		 237 aa  105  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.087099  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0435  ferric uptake regulator  43.41 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1661  ferric uptake regulator  44.96 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000966153  normal  0.373988 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  34.09 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2576  ferric uptake regulator, Fur family  45.6 
 
 		 143 aa  104  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.710249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1138  ferric uptake regulator, Fur family  43.65 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716078  normal  0.825565 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2986  ferric uptake regulator, Fur family  45.6 
 
 		 143 aa  104  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.105319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  41.35 
 
 		 138 aa  105  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  37.23 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2152  ferric uptake regulator  45.67 
 
 		 140 aa  104  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2338  ferric uptake regulator  42.55 
 
 		 169 aa  104  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.807618  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2747  ferric uptake transcriptional repressor transcription regulator protein  45.6 
 
 		 143 aa  104  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  44.19 
 
 		 143 aa  104  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0458  ferric uptake regulator, Fur family  42.65 
 
 		 158 aa  103  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000485327 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0282  ferric uptake regulation protein  42.65 
 
 		 158 aa  103  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  36.23 
 
 		 152 aa  103  6e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3767  ferric uptake regulator family protein  43.44 
 
 		 140 aa  103  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0928  FUR family manganese uptake regulator  44.35 
 
 		 138 aa  103  6e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 150 aa  103  7e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 149 aa  103  8e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5530  ferric uptake regulator family protein  41.35 
 
 		 146 aa  103  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3924  ferric uptake regulator family protein  40.91 
 
 		 149 aa  103  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3615  ferric uptake regulator family protein  45.08 
 
 		 168 aa  103  8e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3272  ferric uptake regulator, Fur family  40.91 
 
 		 138 aa  103  9e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.710175  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2494  FUR family manganese uptake regulator  43.8 
 
 		 137 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360985  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1161  ferric uptake regulator family protein  43.8 
 
 		 137 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.13561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  33.57 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2623  ferric uptake regulation protein  42.54 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.376677  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  34.72 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1084  ferric uptake regulator, Fur family  41.67 
 
 		 144 aa  101  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.784641  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  40.43 
 
 		 161 aa  101  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000031646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  43.41 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000739379  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  43.41 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000255764  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2263  ferric uptake regulator  44.19 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  43.41 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  37.67 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  43.41 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000743772  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  37.67 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1593  ferric uptake regulator  44.19 
 
 		 143 aa  100  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000083166  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2790  ferric uptake regulator family protein  39.37 
 
 		 151 aa  100  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000512773  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4555  ferric uptake regulator family protein  40.15 
 
 		 145 aa  100  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0247  ferric uptake transcriptional (FUR)-like transcription regulator protein  39.39 
 
 		 151 aa  100  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.406535  normal  0.140515 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>