More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2142 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2142  putative ferric uptake regulation protein  100 
 
 		 137 aa  276  5e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1799  FUR family manganese uptake regulator  80.88 
 
 		 137 aa  227  4e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0928  FUR family manganese uptake regulator  77.21 
 
 		 138 aa  222  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0932  ferric uptake regulator family protein  73.53 
 
 		 137 aa  213  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1161  ferric uptake regulator family protein  72.79 
 
 		 137 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.13561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2494  FUR family manganese uptake regulator  72.79 
 
 		 137 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360985  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3767  ferric uptake regulator family protein  64.96 
 
 		 140 aa  186  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0984  ferric uptake regulator family protein  67.19 
 
 		 140 aa  179  8.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1820  ferric uptake regulator family protein  65.62 
 
 		 144 aa  179  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.168146 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3031  ferric uptake regulator family protein  66.67 
 
 		 139 aa  178  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0013  ferric uptake regulator family protein  66.41 
 
 		 135 aa  177  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00124444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2066  ferric uptake regulator family protein  65.12 
 
 		 141 aa  176  8e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.779744  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0033  ferric uptake regulator, Fur family  60.71 
 
 		 142 aa  173  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.968997  normal  0.145253 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2385  ferric uptake regulator family protein  67.19 
 
 		 140 aa  173  9e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0020  ferric uptake regulator family protein  64.89 
 
 		 149 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0165645  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0435  ferric uptake regulator  62.5 
 
 		 135 aa  170  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0021  ferric uptake regulator, Fur family  60.45 
 
 		 142 aa  170  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.531166 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0013  ferric-uptake regulator  63.36 
 
 		 156 aa  169  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0292053 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0244  ferric-uptake regulator  63.85 
 
 		 143 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3615  ferric uptake regulator family protein  62.79 
 
 		 168 aa  168  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0588  ferric uptake regulator family protein  63.08 
 
 		 165 aa  167  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0044  ferric uptake regulator family protein  63.08 
 
 		 150 aa  166  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.496747  normal  0.591839 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0454  ferric uptake regulator, Fur family  60.31 
 
 		 143 aa  164  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0466  ferric uptake regulator family protein  60.77 
 
 		 151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.549538 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2968  ferric uptake regulator family protein  57.48 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2101  ferric uptake regulator, Fur family  58.02 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4436  ferric uptake regulator family protein  51.88 
 
 		 144 aa  147  7e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3947  FUR family manganese uptake regulator  49.65 
 
 		 142 aa  141  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.960435  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1334  ferric uptake regulator family protein  56.1 
 
 		 150 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1243  ferric uptake regulator family protein  53.39 
 
 		 141 aa  131  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1654  ferric uptake regulation protein, putative  51.22 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.179894  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0360  ferric uptake regulation protein  48.78 
 
 		 138 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1601  putative ferric uptake regulation protein  50.41 
 
 		 141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248674  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2913  ferric uptake regulator family protein  49.15 
 
 		 142 aa  119  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  45.8 
 
 		 167 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  43.97 
 
 		 154 aa  114  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  45.8 
 
 		 167 aa  113  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  45.8 
 
 		 167 aa  113  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  44.8 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  47.2 
 
 		 147 aa  110  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  44.8 
 
 		 143 aa  110  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  46.34 
 
 		 176 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  47.2 
 
 		 152 aa  107  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  44.26 
 
 		 143 aa  106  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  46.72 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1260  ferric uptake regulator family protein  48.31 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  42.62 
 
 		 143 aa  104  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  44.63 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  44.17 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  44.7 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  44.17 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  44.26 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3125  ferric uptake regulator  45.83 
 
 		 149 aa  100  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1206  ferric uptake regulator  45.83 
 
 		 149 aa  100  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000560641  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00640  ferric uptake regulator  45.83 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0211931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  45.83 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  45.83 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  45.83 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  41.8 
 
 		 157 aa  99.8  1e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0322  ferric uptake regulator  44.17 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  41.8 
 
 		 157 aa  99.8  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  45.83 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  41.8 
 
 		 157 aa  99.8  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  45.83 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  45.83 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  45.83 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  45.83 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  45.83 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  45.83 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  45.83 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  45.83 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177584  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  45.83 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2736  helix-turn-helix, AraC type  41.94 
 
 		 135 aa  99  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000081899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1117  ferric uptake regulator, Fur family  44.17 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2939  ferric uptake regulator, Fur family  44.17 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0253838  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  44.17 
 
 		 148 aa  98.6  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1594  ferric uptake regulator, Fur family  45.67 
 
 		 135 aa  97.4  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  40.5 
 
 		 144 aa  97.1  8e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3967  ferric uptake regulator family protein  43.2 
 
 		 136 aa  96.3  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.706026 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  40.5 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01181  ferric uptake regulator Fur  45 
 
 		 136 aa  96.7  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0678895  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  43.8 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5908  ferric uptake regulator, Fur family  41.09 
 
 		 165 aa  95.5  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1842  ferric uptake regulator  43.8 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000122874  normal  0.0218944 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1236  ferric uptake regulator  42.5 
 
 		 148 aa  94.7  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000206726  normal  0.895859 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4508  ferric uptake regulation protein  40.8 
 
 		 135 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.358038  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4198  ferric-uptake regulator  40.8 
 
 		 135 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  40.5 
 
 		 143 aa  94.4  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0229  ferric uptake regulator family protein  41.54 
 
 		 151 aa  94.4  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  36.76 
 
 		 154 aa  94  6e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1661  ferric uptake regulator  42.15 
 
 		 143 aa  93.6  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000966153  normal  0.373988 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  40.5 
 
 		 143 aa  93.6  8e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1459  ferric uptake regulator family protein  42.5 
 
 		 146 aa  93.6  8e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.773495  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1516  FUR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 146 aa  93.6  8e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.995871  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1641  ferric uptake regulator  42.5 
 
 		 143 aa  93.6  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1716  ferric uptake regulator  42.5 
 
 		 143 aa  93.6  9e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000280206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  42.5 
 
 		 143 aa  93.2  9e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000468341  normal  0.147817 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0753  ferric uptake regulator family protein  38.58 
 
 		 144 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2810  ferric uptake regulator  41.35 
 
 		 143 aa  93.2  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.644684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2152  ferric uptake regulator  42.5 
 
 		 140 aa  92.8  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>