More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2576 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2986  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 		 143 aa  298  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.105319  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2576  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 		 143 aa  298  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.710249  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2747  ferric uptake transcriptional repressor transcription regulator protein  98.6 
 
 		 143 aa  294  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2976  ferric uptake regulator family protein  93.71 
 
 		 143 aa  283  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2837  ferric uptake regulator family protein  93.71 
 
 		 143 aa  281  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0616  ferric uptake regulator family protein  80 
 
 		 142 aa  241  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.740565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0166  ferric uptake regulator family protein  80 
 
 		 142 aa  241  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0649  ferric uptake regulator family protein  80 
 
 		 142 aa  241  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2737  ferric uptake regulator family protein  80 
 
 		 142 aa  241  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348547  normal  0.830954 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0570  ferric uptake regulator family protein  79.29 
 
 		 142 aa  240  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.233033 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0544  ferric uptake regulator family protein  79.29 
 
 		 142 aa  240  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0596927  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0375  ferric uptake regulator  80 
 
 		 142 aa  240  5e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2458  ferric uptake regulator  80 
 
 		 142 aa  240  5e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3455  ferric uptake regulator  80 
 
 		 142 aa  240  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114286  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3457  ferric uptake regulator  80 
 
 		 142 aa  240  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3385  ferric uptake regulator, Fur family  81.43 
 
 		 142 aa  240  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.514247  hitchhiker  0.0000888993 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3420  ferric uptake regulator  80 
 
 		 142 aa  240  5e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133952  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2645  ferric uptake regulator  80 
 
 		 142 aa  240  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1234  ferric uptake regulator  80 
 
 		 142 aa  240  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0571  ferric uptake regulator family protein  81.43 
 
 		 142 aa  239  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3735  ferric uptake regulator family protein  79.29 
 
 		 142 aa  239  7.999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.345676 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1206  ferric uptake regulator  79.29 
 
 		 142 aa  238  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2593  ferric uptake regulator family protein  79.29 
 
 		 142 aa  236  9e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000283641 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4610  ferric uptake regulator family protein  70.71 
 
 		 181 aa  223  8e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0934  ferric uptake regulator family protein  72.14 
 
 		 147 aa  220  6e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.634788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0474  ferric uptake regulator family protein  71.43 
 
 		 143 aa  219  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3791  ferric uptake regulator family protein  70 
 
 		 152 aa  217  3.9999999999999997e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0753  ferric uptake regulator family protein  67.38 
 
 		 148 aa  213  9e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.629039  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0406  ferric uptake regulator, Fur family  71.97 
 
 		 139 aa  210  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1123  ferric uptake regulator family protein  67.14 
 
 		 148 aa  209  1e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.488583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1727  ferric uptake regulator, Fur family  71.64 
 
 		 146 aa  208  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0475  ferric uptake regulator family protein  67.86 
 
 		 149 aa  207  4e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0223  transcriptional regulator  71.97 
 
 		 145 aa  204  4e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4555  ferric uptake regulator family protein  68.18 
 
 		 145 aa  204  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6009  ferric uptake regulator family protein  64.34 
 
 		 155 aa  204  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.964976 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0603  ferric uptake regulator family protein  63.57 
 
 		 138 aa  202  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.401566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3924  ferric uptake regulator family protein  68.18 
 
 		 149 aa  199  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3272  ferric uptake regulator, Fur family  68.18 
 
 		 138 aa  199  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.710175  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0229  ferric uptake regulator family protein  62.07 
 
 		 151 aa  189  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0894  ferric uptake regulator family protein  65.93 
 
 		 152 aa  186  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572753 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0251  ferric uptake regulator, Fur family  62.5 
 
 		 167 aa  184  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2050  ferric uptake regulator, Fur family  60.58 
 
 		 141 aa  181  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0967  ferric uptake regulator, Fur family  57.66 
 
 		 142 aa  180  7e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.924679  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0247  ferric uptake transcriptional (FUR)-like transcription regulator protein  60.56 
 
 		 151 aa  174  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.406535  normal  0.140515 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5530  ferric uptake regulator family protein  62.88 
 
 		 146 aa  174  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4057  ferric uptake regulator, Fur family  60.45 
 
 		 151 aa  173  9e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3944  ferric uptake regulator, Fur family  60.45 
 
 		 151 aa  173  9e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4234  ferric uptake regulator family protein  56.62 
 
 		 167 aa  167  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0343972  normal  0.519768 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0438  ferric uptake regulation protein  57.58 
 
 		 136 aa  164  4e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0414  ferric uptake regulation protein  57.58 
 
 		 136 aa  164  4e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3653  ferric uptake regulator family protein  55.47 
 
 		 149 aa  163  9e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188238  normal  0.295199 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0458  ferric uptake regulator, Fur family  59.06 
 
 		 158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000485327 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0282  ferric uptake regulation protein  59.06 
 
 		 158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1905  ferric uptake regulator family protein  58.14 
 
 		 140 aa  162  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5484  ferric uptake regulation protein  57.36 
 
 		 134 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63020  ferric uptake regulation protein  57.36 
 
 		 134 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1593  ferric uptake regulator  56.39 
 
 		 143 aa  161  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000083166  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2623  ferric uptake regulation protein  57.36 
 
 		 143 aa  160  6e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.376677  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1481  ferric uptake regulator family protein  57.81 
 
 		 140 aa  160  7e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.268678  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5746  ferric uptake regulator, DNA-binding transcriptional dual regulator of siderophore biosynthesis and transport  59.52 
 
 		 157 aa  160  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1405  ferric uptake regulator family protein  54.81 
 
 		 137 aa  159  8.000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1194  ferric-uptake regulator  55.3 
 
 		 159 aa  159  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1641  ferric uptake regulator  56.72 
 
 		 143 aa  159  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1716  ferric uptake regulator  56.72 
 
 		 143 aa  159  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000280206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  56.72 
 
 		 143 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000743772  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  56.72 
 
 		 143 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  56.72 
 
 		 143 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000255764  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3627  ferric uptake regulator family protein  56.59 
 
 		 139 aa  158  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  56.72 
 
 		 143 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000739379  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2263  ferric uptake regulator  55.88 
 
 		 143 aa  158  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2152  ferric uptake regulator  54.07 
 
 		 140 aa  157  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  56.72 
 
 		 143 aa  157  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000468341  normal  0.147817 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  57.14 
 
 		 161 aa  157  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000031646  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1937  ferric uptake regulator  55.88 
 
 		 143 aa  157  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1451  ferric uptake regulation protein  55.91 
 
 		 155 aa  157  5e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000060196  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1389  ferric uptake regulation protein  55.91 
 
 		 145 aa  157  5e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000498211  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1236  ferric uptake regulator  55.73 
 
 		 148 aa  156  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000206726  normal  0.895859 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2810  ferric uptake regulator  56.39 
 
 		 143 aa  156  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.644684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1117  ferric uptake regulator, Fur family  55.73 
 
 		 148 aa  155  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  56.39 
 
 		 143 aa  156  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00640  ferric uptake regulator  54.96 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0211931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  54.96 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  54.96 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177584  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  54.96 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  54.96 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  54.96 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0322  ferric uptake regulator  54.96 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2939  ferric uptake regulator, Fur family  54.96 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0253838  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  54.96 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  54.96 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  54.96 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3967  ferric uptake regulator family protein  56.45 
 
 		 136 aa  155  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.706026 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  54.96 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  54.96 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  54.96 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  54.96 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  54.96 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2338  ferric uptake regulator  54.89 
 
 		 169 aa  155  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.807618  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  54.96 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  50 
 
 		 144 aa  154  3e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>