More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3615 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3615  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 168 aa  343  5e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3767  ferric uptake regulator family protein  75.56 
 
 		 140 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3031  ferric uptake regulator family protein  76.69 
 
 		 139 aa  213  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0013  ferric uptake regulator family protein  75.19 
 
 		 135 aa  210  7.999999999999999e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00124444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0021  ferric uptake regulator, Fur family  74.44 
 
 		 142 aa  208  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.531166 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0033  ferric uptake regulator, Fur family  74.44 
 
 		 142 aa  208  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.968997  normal  0.145253 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0435  ferric uptake regulator  72.39 
 
 		 135 aa  206  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0466  ferric uptake regulator family protein  70.8 
 
 		 151 aa  202  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.549538 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0020  ferric uptake regulator family protein  66.22 
 
 		 149 aa  198  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0165645  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0588  ferric uptake regulator family protein  67.61 
 
 		 165 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0013  ferric-uptake regulator  63.58 
 
 		 156 aa  194  3e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0292053 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1820  ferric uptake regulator family protein  67.41 
 
 		 144 aa  195  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.168146 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0244  ferric-uptake regulator  70.15 
 
 		 143 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2066  ferric uptake regulator family protein  68.66 
 
 		 141 aa  194  5.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.779744  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0454  ferric uptake regulator, Fur family  68.66 
 
 		 143 aa  194  7e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0044  ferric uptake regulator family protein  70.23 
 
 		 150 aa  193  8.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.496747  normal  0.591839 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2385  ferric uptake regulator family protein  70.15 
 
 		 140 aa  191  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0984  ferric uptake regulator family protein  67.67 
 
 		 140 aa  190  9e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1799  FUR family manganese uptake regulator  65.41 
 
 		 137 aa  177  8e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0932  ferric uptake regulator family protein  64.34 
 
 		 137 aa  170  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2142  putative ferric uptake regulation protein  62.79 
 
 		 137 aa  168  4e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1161  ferric uptake regulator family protein  64.34 
 
 		 137 aa  167  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.13561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2494  FUR family manganese uptake regulator  64.34 
 
 		 137 aa  167  6e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360985  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2101  ferric uptake regulator, Fur family  64.06 
 
 		 158 aa  165  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2968  ferric uptake regulator family protein  58.33 
 
 		 151 aa  164  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0928  FUR family manganese uptake regulator  62.02 
 
 		 138 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4436  ferric uptake regulator family protein  53.19 
 
 		 144 aa  154  8e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1243  ferric uptake regulator family protein  53.33 
 
 		 141 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1654  ferric uptake regulation protein, putative  55.08 
 
 		 141 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.179894  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1334  ferric uptake regulator family protein  52.05 
 
 		 150 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2913  ferric uptake regulator family protein  48.12 
 
 		 142 aa  137  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0360  ferric uptake regulation protein  49.21 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1601  putative ferric uptake regulation protein  54.24 
 
 		 141 aa  135  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248674  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3947  FUR family manganese uptake regulator  54.62 
 
 		 142 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.960435  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  48.36 
 
 		 147 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  45.53 
 
 		 153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1260  ferric uptake regulator family protein  44.7 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  41.18 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  41.18 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  41.18 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  42.42 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  45.9 
 
 		 146 aa  104  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  44.63 
 
 		 176 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  45.16 
 
 		 143 aa  104  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  43.33 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  43.33 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  45.08 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  43.55 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  44.63 
 
 		 143 aa  102  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0322  ferric uptake regulator  43.33 
 
 		 148 aa  101  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1459  ferric uptake regulator family protein  40.3 
 
 		 146 aa  100  9e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.773495  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1516  FUR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 146 aa  100  9e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.995871  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0873  ferric uptake regulator, Fur family protein  39.23 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3097  ferric uptake regulator family protein  43.9 
 
 		 150 aa  99.8  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  41.79 
 
 		 152 aa  99  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3365  ferric uptake regulator family protein  41.41 
 
 		 139 aa  98.6  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.019724  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  41.67 
 
 		 144 aa  98.6  4e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  41.67 
 
 		 144 aa  98.6  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  38.13 
 
 		 157 aa  97.8  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  38.13 
 
 		 157 aa  97.8  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  38.13 
 
 		 157 aa  97.8  7e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2736  helix-turn-helix, AraC type  41.22 
 
 		 135 aa  97.8  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000081899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  40.74 
 
 		 146 aa  97.4  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  44.17 
 
 		 144 aa  97.1  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0475  ferric uptake regulator family protein  37.5 
 
 		 149 aa  97.1  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5908  ferric uptake regulator, Fur family  38.41 
 
 		 165 aa  96.7  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616966  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4508  ferric uptake regulation protein  40.31 
 
 		 135 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.358038  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4198  ferric-uptake regulator  40.31 
 
 		 135 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1117  ferric uptake regulator, Fur family  39.23 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43000  Ferric-uptake regulator, fur  41.18 
 
 		 134 aa  95.5  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0406  ferric uptake regulator, Fur family  42.74 
 
 		 139 aa  95.1  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0247  ferric uptake transcriptional (FUR)-like transcription regulator protein  39.86 
 
 		 151 aa  94.7  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.406535  normal  0.140515 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1206  ferric uptake regulator  42.98 
 
 		 149 aa  94.4  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000560641  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3125  ferric uptake regulator  42.98 
 
 		 149 aa  94.4  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2747  ferric uptake transcriptional repressor transcription regulator protein  43.33 
 
 		 143 aa  94.4  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  42.5 
 
 		 150 aa  94.4  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  42.5 
 
 		 150 aa  94.4  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  42.5 
 
 		 150 aa  94.4  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  42.5 
 
 		 150 aa  94.4  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  42.5 
 
 		 150 aa  94.4  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00640  ferric uptake regulator  42.5 
 
 		 148 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0211931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  42.5 
 
 		 148 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  42.5 
 
 		 148 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  42.5 
 
 		 148 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177584  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  42.5 
 
 		 148 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  42.5 
 
 		 148 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  42.5 
 
 		 148 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  42.5 
 
 		 148 aa  94.4  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  42.5 
 
 		 148 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2576  ferric uptake regulator, Fur family  43.33 
 
 		 143 aa  94  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.710249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2986  ferric uptake regulator, Fur family  43.33 
 
 		 143 aa  94  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.105319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63020  ferric uptake regulation protein  42.86 
 
 		 134 aa  94  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5484  ferric uptake regulation protein  42.86 
 
 		 134 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0934  ferric uptake regulator family protein  37.33 
 
 		 147 aa  94  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.634788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  37.31 
 
 		 143 aa  93.6  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1690  ferric uptake regulator  40.83 
 
 		 150 aa  93.6  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000286155  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  34.04 
 
 		 154 aa  93.6  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3627  ferric uptake regulator family protein  42.02 
 
 		 139 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2837  ferric uptake regulator family protein  40.15 
 
 		 143 aa  92.8  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1236  ferric uptake regulator  40.83 
 
 		 148 aa  92.8  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000206726  normal  0.895859 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>