More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2494 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2494  FUR family manganese uptake regulator  100 
 
 		 137 aa  273  5e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360985  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1161  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 137 aa  273  5e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.13561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0932  ferric uptake regulator family protein  96.35 
 
 		 137 aa  265  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1799  FUR family manganese uptake regulator  78.83 
 
 		 137 aa  222  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0928  FUR family manganese uptake regulator  76.64 
 
 		 138 aa  217  5e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2142  putative ferric uptake regulation protein  72.79 
 
 		 137 aa  212  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0984  ferric uptake regulator family protein  73.17 
 
 		 140 aa  187  4e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3767  ferric uptake regulator family protein  64.18 
 
 		 140 aa  184  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3031  ferric uptake regulator family protein  68.15 
 
 		 139 aa  184  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2066  ferric uptake regulator family protein  74.8 
 
 		 141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.779744  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0013  ferric uptake regulator family protein  69.84 
 
 		 135 aa  182  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00124444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2385  ferric uptake regulator family protein  70.73 
 
 		 140 aa  177  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1820  ferric uptake regulator family protein  66.67 
 
 		 144 aa  172  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.168146 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0033  ferric uptake regulator, Fur family  64.84 
 
 		 142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.968997  normal  0.145253 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0021  ferric uptake regulator, Fur family  64.06 
 
 		 142 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.531166 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0244  ferric-uptake regulator  63.08 
 
 		 143 aa  169  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0588  ferric uptake regulator family protein  62.31 
 
 		 165 aa  169  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0454  ferric uptake regulator, Fur family  63.08 
 
 		 143 aa  168  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0020  ferric uptake regulator family protein  62.6 
 
 		 149 aa  168  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0165645  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0435  ferric uptake regulator  64.84 
 
 		 135 aa  167  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3615  ferric uptake regulator family protein  64.34 
 
 		 168 aa  167  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0013  ferric-uptake regulator  61.07 
 
 		 156 aa  167  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0292053 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0044  ferric uptake regulator family protein  62.31 
 
 		 150 aa  167  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.496747  normal  0.591839 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0466  ferric uptake regulator family protein  60.77 
 
 		 151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.549538 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2101  ferric uptake regulator, Fur family  61.36 
 
 		 158 aa  156  8e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2968  ferric uptake regulator family protein  58.14 
 
 		 151 aa  156  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4436  ferric uptake regulator family protein  48.85 
 
 		 144 aa  142  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1334  ferric uptake regulator family protein  56.06 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3947  FUR family manganese uptake regulator  52.42 
 
 		 142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.960435  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2913  ferric uptake regulator family protein  50 
 
 		 142 aa  127  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0360  ferric uptake regulation protein  45.97 
 
 		 138 aa  124  5e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1243  ferric uptake regulator family protein  48.39 
 
 		 141 aa  122  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  49.6 
 
 		 167 aa  120  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  49.6 
 
 		 167 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  49.6 
 
 		 167 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  48.82 
 
 		 176 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_004310  BR1654  ferric uptake regulation protein, putative  47.15 
 
 		 141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.179894  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1601  putative ferric uptake regulation protein  46.34 
 
 		 141 aa  114  6e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248674  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1260  ferric uptake regulator family protein  50 
 
 		 140 aa  112  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  45.45 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  47.93 
 
 		 152 aa  107  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  46.72 
 
 		 148 aa  104  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  44.63 
 
 		 154 aa  103  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  43.8 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  44.8 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  44.63 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  43.33 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  42.98 
 
 		 143 aa  100  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  44.63 
 
 		 146 aa  99.8  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  44.63 
 
 		 144 aa  99.4  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  42.62 
 
 		 143 aa  98.2  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  38.52 
 
 		 154 aa  97.8  4e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5908  ferric uptake regulator, Fur family  42.86 
 
 		 165 aa  96.7  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616966  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  38.84 
 
 		 157 aa  95.9  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0753  ferric uptake regulator family protein  40.5 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  38.84 
 
 		 157 aa  95.9  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  38.84 
 
 		 157 aa  95.9  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  37.19 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1645  ferric uptake regulation protein (ferric uptake regulator)  36.36 
 
 		 155 aa  93.6  8e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1722  ferric uptake regulator family protein  37.88 
 
 		 146 aa  92.4  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.907916 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00640  ferric uptake regulator  42.5 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0211931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  42.5 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  42.5 
 
 		 150 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  42.5 
 
 		 150 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  42.5 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  42.5 
 
 		 150 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  42.5 
 
 		 150 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  42.5 
 
 		 150 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  42.5 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  42.5 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177584  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  42.5 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  42.5 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  42.5 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  42.5 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  41.67 
 
 		 154 aa  91.3  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  38.02 
 
 		 155 aa  90.9  5e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  42.28 
 
 		 146 aa  90.5  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  41.67 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2736  helix-turn-helix, AraC type  40.16 
 
 		 135 aa  89.7  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000081899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  38.02 
 
 		 155 aa  89  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  39.17 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1690  ferric uptake regulator  38.84 
 
 		 150 aa  88.6  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000286155  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0873  ferric uptake regulator, Fur family protein  38.21 
 
 		 142 aa  88.6  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  39.17 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3367  ferric uptake regulator family protein  39.67 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 159 aa  87.8  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1272  ferric uptake regulator family protein  37.7 
 
 		 158 aa  87.4  6e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1241  ferric uptake regulator, Fur family  36.72 
 
 		 170 aa  87  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00903138 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1206  ferric uptake regulator  40.83 
 
 		 149 aa  87  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000560641  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3125  ferric uptake regulator  40.83 
 
 		 149 aa  87  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0322  ferric uptake regulator  39.17 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3365  ferric uptake regulator family protein  37.9 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.019724  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43000  Ferric-uptake regulator, fur  38.02 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004126  ferric uptake regulation protein FUR  38.02 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1117  ferric uptake regulator, Fur family  37.4 
 
 		 148 aa  84.7  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0247  ferric uptake regulator, Fur family  34.96 
 
 		 165 aa  85.1  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0833  ferric uptake regulator  36.59 
 
 		 147 aa  84.7  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4508  ferric uptake regulation protein  38.28 
 
 		 135 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.358038  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4198  ferric-uptake regulator  39.34 
 
 		 135 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2939  ferric uptake regulator, Fur family  38.33 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0253838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>