More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0932 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0932  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 
137 aa  272  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2494  FUR family manganese uptake regulator  96.35 
 
 
137 aa  265  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360985  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1161  ferric uptake regulator family protein  96.35 
 
 
137 aa  265  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.13561  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1799  FUR family manganese uptake regulator  78.83 
 
 
137 aa  222  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0928  FUR family manganese uptake regulator  75.91 
 
 
138 aa  214  2.9999999999999998e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2142  putative ferric uptake regulation protein  73.53 
 
 
137 aa  213  5e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0984  ferric uptake regulator family protein  71.09 
 
 
140 aa  187  5.999999999999999e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3767  ferric uptake regulator family protein  64.93 
 
 
140 aa  186  9e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2066  ferric uptake regulator family protein  72.66 
 
 
141 aa  184  4e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.779744  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3031  ferric uptake regulator family protein  67.41 
 
 
139 aa  183  6e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0013  ferric uptake regulator family protein  66.17 
 
 
135 aa  182  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00124444  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2385  ferric uptake regulator family protein  68.75 
 
 
140 aa  178  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1820  ferric uptake regulator family protein  67.72 
 
 
144 aa  175  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.168146 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0033  ferric uptake regulator, Fur family  64.06 
 
 
142 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.968997  normal  0.145253 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0454  ferric uptake regulator, Fur family  63.36 
 
 
143 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0021  ferric uptake regulator, Fur family  63.28 
 
 
142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.531166 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0244  ferric-uptake regulator  63.85 
 
 
143 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0020  ferric uptake regulator family protein  63.36 
 
 
149 aa  171  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0165645  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0588  ferric uptake regulator family protein  63.08 
 
 
165 aa  170  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3615  ferric uptake regulator family protein  64.34 
 
 
168 aa  170  7.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0013  ferric-uptake regulator  61.83 
 
 
156 aa  169  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0292053 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0435  ferric uptake regulator  64.06 
 
 
135 aa  169  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0044  ferric uptake regulator family protein  63.08 
 
 
150 aa  169  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.496747  normal  0.591839 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0466  ferric uptake regulator family protein  61.54 
 
 
151 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.549538 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2101  ferric uptake regulator, Fur family  62.12 
 
 
158 aa  158  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2968  ferric uptake regulator family protein  58.91 
 
 
151 aa  156  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4436  ferric uptake regulator family protein  50.38 
 
 
144 aa  144  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1334  ferric uptake regulator family protein  56.82 
 
 
150 aa  140  4e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3947  FUR family manganese uptake regulator  53.23 
 
 
142 aa  133  9e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.960435  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2913  ferric uptake regulator family protein  51.22 
 
 
142 aa  130  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0360  ferric uptake regulation protein  45.97 
 
 
138 aa  124  5e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1243  ferric uptake regulator family protein  47.97 
 
 
141 aa  120  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1654  ferric uptake regulation protein, putative  47.97 
 
 
141 aa  118  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.179894  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  48 
 
 
167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  49.18 
 
 
167 aa  114  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  49.18 
 
 
167 aa  114  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1601  putative ferric uptake regulation protein  47.15 
 
 
141 aa  114  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248674  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  48.03 
 
 
176 aa  114  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  46.4 
 
 
153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1260  ferric uptake regulator family protein  50 
 
 
140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  47.93 
 
 
152 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  47.54 
 
 
148 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  44 
 
 
143 aa  105  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  45 
 
 
143 aa  104  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  45.45 
 
 
154 aa  105  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  46.72 
 
 
147 aa  105  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  46.28 
 
 
144 aa  103  7e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  45.45 
 
 
143 aa  103  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  45.45 
 
 
146 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  43.8 
 
 
143 aa  101  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5908  ferric uptake regulator, Fur family  43.61 
 
 
165 aa  100  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616966  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  43.2 
 
 
143 aa  100  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  39.34 
 
 
154 aa  99.8  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  38.84 
 
 
157 aa  96.3  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  38.84 
 
 
157 aa  96.3  1e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  38.84 
 
 
157 aa  96.3  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1645  ferric uptake regulation protein (ferric uptake regulator)  37.19 
 
 
155 aa  95.5  2e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0753  ferric uptake regulator family protein  40.5 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  36.89 
 
 
151 aa  95.1  3e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  38.84 
 
 
155 aa  94  6e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  42.52 
 
 
146 aa  94  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  38.84 
 
 
155 aa  92  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3367  ferric uptake regulator family protein  40.5 
 
 
149 aa  92.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1722  ferric uptake regulator family protein  37.88 
 
 
146 aa  92  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.907916 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00640  ferric uptake regulator  41.67 
 
 
148 aa  88.6  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0211931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  41.67 
 
 
148 aa  88.6  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  41.67 
 
 
148 aa  88.6  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  41.67 
 
 
150 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  41.67 
 
 
148 aa  88.6  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  41.67 
 
 
148 aa  88.6  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  41.67 
 
 
148 aa  88.6  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177584  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  41.67 
 
 
148 aa  88.6  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  41.67 
 
 
150 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  41.67 
 
 
150 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  41.67 
 
 
150 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  41.67 
 
 
150 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  41.67 
 
 
148 aa  88.6  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  41.67 
 
 
148 aa  88.6  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1272  ferric uptake regulator family protein  37.7 
 
 
158 aa  87.8  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  39.52 
 
 
154 aa  88.2  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2736  helix-turn-helix, AraC type  39.52 
 
 
135 aa  88.2  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000081899  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  40.83 
 
 
148 aa  87.4  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1241  ferric uptake regulator, Fur family  36.72 
 
 
170 aa  87.4  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00903138 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 
159 aa  87  8e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  38.33 
 
 
148 aa  86.3  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  38.33 
 
 
148 aa  86.3  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1842  ferric uptake regulator  38.33 
 
 
143 aa  85.5  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000122874  normal  0.0218944 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0873  ferric uptake regulator, Fur family protein  36.59 
 
 
142 aa  85.9  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3365  ferric uptake regulator family protein  38.71 
 
 
139 aa  85.1  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.019724  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1937  ferric uptake regulator  35.48 
 
 
143 aa  84.7  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3125  ferric uptake regulator  40 
 
 
149 aa  84.7  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1206  ferric uptake regulator  40 
 
 
149 aa  84.7  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000560641  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  35.48 
 
 
143 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000468341  normal  0.147817 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2810  ferric uptake regulator  37.5 
 
 
143 aa  84.3  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.644684  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0322  ferric uptake regulator  38.33 
 
 
148 aa  84  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135806  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0247  ferric uptake regulator, Fur family  34.96 
 
 
165 aa  84.3  6e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1690  ferric uptake regulator  37.19 
 
 
150 aa  84  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000286155  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2263  ferric uptake regulator  35.48 
 
 
143 aa  83.6  8e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1641  ferric uptake regulator  35.48 
 
 
143 aa  83.6  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1716  ferric uptake regulator  35.48 
 
 
143 aa  83.6  8e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000280206  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>