More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2295 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 159 aa  330  6e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  52.82 
 
 		 146 aa  154  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  49.66 
 
 		 147 aa  144  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0365  ferric uptake regulator, Fur family  44.9 
 
 		 150 aa  137  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  47.79 
 
 		 144 aa  133  9e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  43.87 
 
 		 154 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 149 aa  132  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  40.54 
 
 		 149 aa  130  9e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  40.54 
 
 		 149 aa  130  9e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4201  transcriptional regulator, Fur family  43.54 
 
 		 151 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0217905  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2790  ferric uptake regulator family protein  43.54 
 
 		 151 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000512773  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1036  transcriptional regulator, Fur family  43.54 
 
 		 151 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0163253  normal  0.210334 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3922  ferric uptake regulator family protein  43.54 
 
 		 151 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000572819  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4160  FUR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 151 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4001  FUR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 151 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000832394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3832  FUR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 151 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3848  FUR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 151 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000844204  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4224  transcriptional regulator, Fur family  43.54 
 
 		 151 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00546613  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4115  transcriptional regulator, Fur family  43.54 
 
 		 151 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5116299999999997e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4313  FUR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 151 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  37.84 
 
 		 145 aa  127  7.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2259  ferric uptake regulator, Fur family  43.54 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1272  ferric uptake regulator family protein  40.97 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1995  ferric uptake regulator, Fur family  42.14 
 
 		 146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.134138  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1147  ferric uptake regulator family protein  43.36 
 
 		 155 aa  117  9e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1138  ferric uptake regulator, Fur family  43.85 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716078  normal  0.825565 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  36.73 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  37.67 
 
 		 143 aa  107  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  35.71 
 
 		 143 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  36.17 
 
 		 143 aa  106  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2029  FUR family transcriptional regulator  49.29 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1746  FUR family transcriptional regulator  50 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0529  ferric uptake regulator, Fur family  38.57 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000605392  normal  0.102669 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  34.75 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  33.57 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  35.71 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  38.26 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  38.26 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  36.05 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  38.26 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1006  ferric uptake regulator, Fur family  41.13 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000144475 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  38.26 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00640  ferric uptake regulator  38.26 
 
 		 148 aa  102  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0211931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  38.26 
 
 		 148 aa  102  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  38.26 
 
 		 148 aa  102  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  38.26 
 
 		 148 aa  102  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  38.26 
 
 		 148 aa  102  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177584  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  38.26 
 
 		 150 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  38.26 
 
 		 148 aa  102  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  38.26 
 
 		 148 aa  102  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  38.26 
 
 		 148 aa  102  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  38.26 
 
 		 148 aa  102  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0247  ferric uptake transcriptional (FUR)-like transcription regulator protein  36.81 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.406535  normal  0.140515 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  32.17 
 
 		 153 aa  101  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  37.86 
 
 		 152 aa  101  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  34.42 
 
 		 155 aa  100  8e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  38.1 
 
 		 148 aa  100  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  34.59 
 
 		 161 aa  100  9e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000031646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0660  Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins  41.91 
 
 		 146 aa  100  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2810  ferric uptake regulator  33.83 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.644684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  37.78 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004126  ferric uptake regulation protein FUR  37.68 
 
 		 149 aa  98.6  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2939  ferric uptake regulator, Fur family  38.24 
 
 		 148 aa  98.2  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0253838  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1842  ferric uptake regulator  33.83 
 
 		 143 aa  98.2  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000122874  normal  0.0218944 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  33.77 
 
 		 155 aa  98.2  4e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  33.08 
 
 		 143 aa  97.8  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000255764  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  33.08 
 
 		 143 aa  97.8  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000739379  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  33.08 
 
 		 143 aa  97.8  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  33.08 
 
 		 143 aa  97.8  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000743772  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2623  ferric uptake regulation protein  36.17 
 
 		 143 aa  97.4  6e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.376677  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  33.83 
 
 		 143 aa  97.4  6e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  36.43 
 
 		 144 aa  97.8  6e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1236  ferric uptake regulator  38.97 
 
 		 148 aa  97.8  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000206726  normal  0.895859 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0577  ferric-uptake regulator  36.88 
 
 		 156 aa  97.8  6e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1690  ferric uptake regulator  35.82 
 
 		 150 aa  97.4  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000286155  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3125  ferric uptake regulator  38.52 
 
 		 149 aa  97.4  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5530  ferric uptake regulator family protein  35.77 
 
 		 146 aa  97.1  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1206  ferric uptake regulator  38.52 
 
 		 149 aa  97.1  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000560641  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0438  ferric uptake regulation protein  33.82 
 
 		 136 aa  97.1  9e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0414  ferric uptake regulation protein  33.82 
 
 		 136 aa  97.1  9e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0322  ferric uptake regulator  37.86 
 
 		 148 aa  97.1  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3944  ferric uptake regulator, Fur family  34.03 
 
 		 151 aa  96.7  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1389  ferric uptake regulation protein  36.03 
 
 		 145 aa  96.7  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000498211  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1451  ferric uptake regulation protein  36.03 
 
 		 155 aa  96.7  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000060196  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01339  ferric uptake regulator  36.96 
 
 		 149 aa  96.7  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  37.86 
 
 		 148 aa  96.3  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4057  ferric uptake regulator, Fur family  34.03 
 
 		 151 aa  96.7  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  37.86 
 
 		 148 aa  96.3  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  33.57 
 
 		 157 aa  96.3  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  33.57 
 
 		 157 aa  95.9  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1937  ferric uptake regulator  32.33 
 
 		 143 aa  95.5  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  33.57 
 
 		 157 aa  96.3  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0546  ferric uptake regulator family protein  34.72 
 
 		 139 aa  95.9  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1661  ferric uptake regulator  33.08 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000966153  normal  0.373988 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  32.33 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000468341  normal  0.147817 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0987  ferric uptake regulator family protein  33.11 
 
 		 147 aa  94.7  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00388915 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1481  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 140 aa  94.7  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.268678  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1641  ferric uptake regulator  32.33 
 
 		 143 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1716  ferric uptake regulator  32.33 
 
 		 143 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000280206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1117  ferric uptake regulator, Fur family  38.06 
 
 		 148 aa  94.7  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>