More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0101 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0101  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 		 139 aa  295  1e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133113  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0754  ferric uptake regulator family protein  83.45 
 
 		 143 aa  255  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.354602  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0135  ferric uptake regulator, Fur family  80.58 
 
 		 139 aa  249  1e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000297915  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0149  ferric uptake regulator, Fur family  66.19 
 
 		 139 aa  207  5e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000946287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0153  ferric uptake regulator, Fur family  63.31 
 
 		 139 aa  201  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000104646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08960  ferric uptake regulator, Fur family  38.64 
 
 		 134 aa  121  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4078  ferric uptake regulator, Fur family  41.35 
 
 		 144 aa  120  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000739269  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  41.6 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  41.6 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0543  ferric uptake regulator, Fur family  41.94 
 
 		 139 aa  118  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.70942 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 150 aa  115  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3815  ferric uptake regulator family protein  39.69 
 
 		 132 aa  114  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000025471  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  39.37 
 
 		 150 aa  114  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0141  ferric uptake regulator, Fur family  44 
 
 		 133 aa  113  6.9999999999999995e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.896296  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  39.84 
 
 		 150 aa  111  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  39.84 
 
 		 143 aa  110  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0822  ferric uptake regulator family protein  36.8 
 
 		 126 aa  110  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000300093  normal  0.0104511 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 142 aa  110  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  39.84 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  39.84 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  39.84 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  39.84 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  39.84 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  39.84 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  39.84 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2524  ferric uptake regulator, Fur family  37.68 
 
 		 138 aa  105  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.568134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  41.09 
 
 		 155 aa  103  8e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  39.84 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  33.83 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  40.8 
 
 		 157 aa  101  3e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  40.8 
 
 		 157 aa  101  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  38.28 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  40.8 
 
 		 157 aa  101  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  40.31 
 
 		 155 aa  100  5e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2366  ferric uptake regulator, Fur family  38.89 
 
 		 131 aa  99.4  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.437919 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2141  ferric uptake regulator family protein  35.61 
 
 		 137 aa  98.2  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0352  ferric uptake regulator, Fur family  34.15 
 
 		 131 aa  97.8  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0284  ferric uptake regulator family protein  39.68 
 
 		 128 aa  97.1  8e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0246387 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3674  ferric uptake regulator family protein  38.1 
 
 		 129 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2513  ferric uptake regulator, Fur family  36.92 
 
 		 137 aa  95.9  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275348  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  31.85 
 
 		 146 aa  95.5  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1241  ferric uptake regulator, Fur family  38.21 
 
 		 170 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00903138 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  35.2 
 
 		 143 aa  94.4  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1354  ferric uptake regulator, Fur family  32.54 
 
 		 133 aa  94.4  5e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000236384  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2005  ferric uptake regulator, Fur family  36.07 
 
 		 128 aa  93.6  7e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1037  ferric uptake regulator family protein  41.82 
 
 		 133 aa  93.2  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0953137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 143 aa  92.8  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3531  ferric uptake regulator, Fur family  38.52 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0122  ferric uptake regulation protein  34.4 
 
 		 154 aa  92  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00816522  normal  0.910281 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1388  ferric uptake regulator, Fur family  37.21 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00327608  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1472  ferric uptake regulator, Fur family  37.8 
 
 		 131 aa  91.7  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000290418  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  34.06 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  36 
 
 		 146 aa  90.5  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  30.83 
 
 		 145 aa  90.1  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0577  ferric-uptake regulator  35.94 
 
 		 156 aa  90.1  9e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1230  FUR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0757057  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0726  ferric uptake regulator, Fur family  34.68 
 
 		 130 aa  88.6  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.787789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  34.85 
 
 		 167 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  34.85 
 
 		 167 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  31.01 
 
 		 153 aa  88.2  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  31.01 
 
 		 143 aa  87.8  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  34.09 
 
 		 167 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  32.33 
 
 		 176 aa  87.4  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2198  ferric uptake regulator, Fur family  35.66 
 
 		 169 aa  87.4  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1420  FUR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 139 aa  87.8  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0522352  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3251  ferric uptake regulator family protein  35.07 
 
 		 158 aa  87.4  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 149 aa  87.4  6e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1806  ferric uptake regulator family protein  33.06 
 
 		 141 aa  87.4  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.696064  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  35.77 
 
 		 154 aa  87  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1722  ferric uptake regulator family protein  30.77 
 
 		 146 aa  87  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.907916 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1279  transcriptional regulator, Fur family  38.52 
 
 		 141 aa  86.7  9e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000471651  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  30.23 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  34.06 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0931  ferric uptake regulator family protein  33.1 
 
 		 151 aa  85.5  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  32.03 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  33.86 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2809  FUR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 152 aa  84.7  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.110848  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1295  ferric uptake regulator family protein  37.7 
 
 		 141 aa  84.7  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000494544  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1415  ferric uptake regulator family protein  38.21 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000163802  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1505  FUR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 141 aa  84  6e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000456774  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  29.79 
 
 		 149 aa  83.6  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  29.79 
 
 		 149 aa  83.6  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01120  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  35.11 
 
 		 137 aa  83.6  8e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1995  ferric uptake regulator, Fur family  30.66 
 
 		 146 aa  83.6  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.134138  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2790  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000512773  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  31.39 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0753  ferric uptake regulator family protein  28.46 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0105  ferric uptake regulator family protein  32.56 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.013681  normal  0.263297 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  30.47 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0365  ferric uptake regulator, Fur family  30.58 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1272  ferric uptake regulator family protein  31.78 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1645  ferric uptake regulation protein (ferric uptake regulator)  32.03 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1966  ferric uptake regulator family protein  33.08 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00359557  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2442  ferric uptake regulator, Fur family  34.65 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168746 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1536  ferric uptake regulator, Fur family  34.38 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.451133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1792  ferric uptake regulator, Fur family  32.79 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000306351  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3922  ferric uptake regulator family protein  33.04 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000572819  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1300  ferric uptake regulator family protein  31.06 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>