More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0135 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0135  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 
139 aa  293  6e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000297915  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0754  ferric uptake regulator family protein  92.81 
 
 
143 aa  277  4e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.354602  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0101  ferric uptake regulator, Fur family  80.58 
 
 
139 aa  249  1e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133113  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0149  ferric uptake regulator, Fur family  67.63 
 
 
139 aa  209  1e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000946287  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0153  ferric uptake regulator, Fur family  63.31 
 
 
139 aa  198  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000104646  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08960  ferric uptake regulator, Fur family  43.75 
 
 
134 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0543  ferric uptake regulator, Fur family  41.32 
 
 
139 aa  120  9e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.70942 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3815  ferric uptake regulator family protein  41.41 
 
 
132 aa  117  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000025471  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4078  ferric uptake regulator, Fur family  39.85 
 
 
144 aa  117  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000739269  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  38.4 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  37.98 
 
 
150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  38.4 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0141  ferric uptake regulator, Fur family  41.6 
 
 
133 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.896296  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0822  ferric uptake regulator family protein  37.6 
 
 
126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000300093  normal  0.0104511 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  39.02 
 
 
150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2366  ferric uptake regulator, Fur family  38.17 
 
 
131 aa  103  6e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.437919 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  37.7 
 
 
142 aa  102  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  37.7 
 
 
142 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  37.7 
 
 
143 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  37.7 
 
 
142 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  37.7 
 
 
142 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  37.7 
 
 
144 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  37.7 
 
 
144 aa  101  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  37.7 
 
 
144 aa  101  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  37.7 
 
 
142 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3674  ferric uptake regulator family protein  38.89 
 
 
129 aa  101  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  37.7 
 
 
144 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  37.7 
 
 
142 aa  101  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  34.85 
 
 
166 aa  101  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2141  ferric uptake regulator family protein  38.28 
 
 
137 aa  100  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2513  ferric uptake regulator, Fur family  36.15 
 
 
137 aa  98.6  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275348  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1354  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 
133 aa  97.8  4e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000236384  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  37.5 
 
 
154 aa  97.8  4e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2524  ferric uptake regulator, Fur family  36.22 
 
 
138 aa  97.4  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.568134  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  37.98 
 
 
155 aa  95.1  3e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3251  ferric uptake regulator family protein  37.23 
 
 
158 aa  94.7  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  37.98 
 
 
155 aa  94.4  5e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0352  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 
131 aa  94  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  39.2 
 
 
157 aa  93.2  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  39.2 
 
 
157 aa  92.8  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1388  ferric uptake regulator, Fur family  37.21 
 
 
136 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00327608  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  35.56 
 
 
143 aa  92.8  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  39.2 
 
 
157 aa  93.2  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  33.82 
 
 
151 aa  92.8  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0122  ferric uptake regulation protein  34.09 
 
 
154 aa  90.9  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00816522  normal  0.910281 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3531  ferric uptake regulator, Fur family  37.7 
 
 
132 aa  90.5  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1420  FUR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
139 aa  89.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0522352  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  33.33 
 
 
143 aa  88.6  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  30.88 
 
 
146 aa  89  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1241  ferric uptake regulator, Fur family  37.4 
 
 
170 aa  89  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00903138 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2005  ferric uptake regulator, Fur family  33.61 
 
 
128 aa  88.2  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  35.51 
 
 
159 aa  88.2  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1230  FUR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
139 aa  87.8  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0757057  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01120  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  36.15 
 
 
137 aa  87.4  5e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  31.11 
 
 
143 aa  87.8  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1279  transcriptional regulator, Fur family  39.34 
 
 
141 aa  87.4  6e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000471651  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1472  ferric uptake regulator, Fur family  36.72 
 
 
131 aa  87  7e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000290418  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0284  ferric uptake regulator family protein  36.72 
 
 
128 aa  87  8e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0246387 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0105  ferric uptake regulator family protein  34.96 
 
 
147 aa  86.7  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.013681  normal  0.263297 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  35.2 
 
 
146 aa  86.3  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0726  ferric uptake regulator, Fur family  33.87 
 
 
130 aa  86.3  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.787789  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1037  ferric uptake regulator family protein  39.09 
 
 
133 aa  86.3  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0953137  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  31.78 
 
 
153 aa  86.3  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  33.86 
 
 
176 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  36.51 
 
 
142 aa  85.5  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1295  ferric uptake regulator family protein  39.34 
 
 
141 aa  85.5  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000494544  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1505  FUR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
141 aa  84.7  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000456774  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  32.03 
 
 
145 aa  85.1  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0365  ferric uptake regulator, Fur family  30.77 
 
 
150 aa  84.3  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1806  ferric uptake regulator family protein  33.87 
 
 
141 aa  84  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.696064  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
149 aa  83.6  8e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  31.01 
 
 
143 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  34.65 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  34.65 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1143  ferric uptake regulator, Fur family  37.1 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000124537  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3458  zinc uptake regulator  35.88 
 
 
131 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.455544  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  31.01 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3447  zinc uptake regulator  35.88 
 
 
131 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0819749  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1722  ferric uptake regulator family protein  30.6 
 
 
146 aa  82  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.907916 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  32.06 
 
 
147 aa  82  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3510  zinc uptake regulator  35.88 
 
 
131 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11469  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2809  FUR family transcriptional regulator  32.59 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.110848  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0577  ferric-uptake regulator  34.4 
 
 
156 aa  82  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  33.86 
 
 
167 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0753  ferric uptake regulator family protein  30.37 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  32.56 
 
 
146 aa  80.5  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1536  ferric uptake regulator, Fur family  34.38 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.451133  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1995  ferric uptake regulator, Fur family  32.28 
 
 
146 aa  80.1  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.134138  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1966  ferric uptake regulator family protein  34.4 
 
 
149 aa  80.5  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00359557  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1792  ferric uptake regulator, Fur family  32.79 
 
 
150 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000306351  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1073  ferric uptake regulator, Fur family  31.3 
 
 
133 aa  80.1  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  34.65 
 
 
149 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1300  ferric uptake regulator family protein  31.01 
 
 
151 aa  78.6  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  34.38 
 
 
138 aa  79  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0480  ferric uptake regulator, Fur family  31.97 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  34.65 
 
 
149 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1645  ferric uptake regulation protein (ferric uptake regulator)  30.47 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0931  ferric uptake regulator family protein  32.54 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2790  ferric uptake regulator family protein  30.28 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000512773  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>